為對采集自昆明某大型牲畜交易市場的一例PPRV陽性鼻拭子樣本進行追根溯源,設(shè)計引物采用RT-PCR方法進行PPRV病毒基因組關(guān)鍵基因N、P、M、F、H核苷酸序列擴增,并進行序列測定和遺傳進化分析。結(jié)果顯示:N、P、M、F、H基因均有預期片段擴增,其讀碼框(ORF)長度分別為1 578、1 531、1 008、1 641及1 830 nt;N、P、M、F及H構(gòu)建的遺傳進化樹均顯示所測毒株為基因Ⅳ型,同2013年在新疆伊犁山羊中檢測到的毒株(KM091959)同源性最高,N、P、M、F、H核苷酸同源性分別為99.2%、99.0%、99.4%、99.6%和99.3%,推斷氨基酸同源性分別為98.7%、98.4%、100.0%、99.8%和99.3%。研究表明,檢測到的毒株仍為2013～2014年我國PPRV流行期的基因Ⅳ型毒株,變異較小;所測毒株的N、P、M、F、H 5個關(guān)鍵基因中,M基因最保守、其次是F/H基因,而N、P基因略有變異。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
        1.1.1 試驗樣本
        1.1.2 試劑及儀器
        1.1.3 引物及探針
    1.2 試驗方法
        1.2.1 病毒基因組RNA提取
        1.2.2 反應(yīng)體系及反應(yīng)程序
        1.2.3 RT-PCR擴增片段的純化回收、克隆及序列測定
2 結(jié)果與分析
    2.1 PPRV陽性32號鼻拭子樣本N、P、M、F、H基因的RT-PCR擴增結(jié)果（見圖1)
    2.2 PPRV陽性32號鼻拭子樣本N基因遺傳進化分析（見圖2，表2～表4)
    2.3 PPRV陽性32號鼻拭子樣本P基因遺傳進化分析（見圖3、表3、表4)
    2.4 PPRV陽性32號鼻拭子樣本M基因遺傳進化分析（見圖4、表3、表4)
    2.5 PPRV陽性32號鼻拭子樣本F基因遺傳進化分析（見圖5、表3、表4)
    2.6 PPRV陽性32號鼻拭子樣本H基因遺傳進化分析（見圖6、表3、表4)
3 討論
4 結(jié)論



本文編號：3779220