冠狀病毒N蛋白抑制IFN-β產(chǎn)生的分子機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2023-04-01 18:17
冠狀病毒(Coronavirus,CoV)屬于套式病毒目(Nidovirales)冠狀病毒科(Coronaviridae)冠狀病毒亞科,可分為α、β、γ、δ四個(gè)屬,其中α、β冠狀病毒主要感染哺乳動(dòng)物,γ-冠狀病毒主要感染鳥(niǎo)類,δ-冠狀病毒既可以感染鳥(niǎo)類,也可以感染哺乳動(dòng)物。自2003年嚴(yán)重急性呼吸綜合征(Severe acute respiratory syndrome,SARS)爆發(fā)以來(lái),對(duì)冠狀病毒的研究受到高度重視。近年來(lái),不斷有新的冠狀病毒被發(fā)現(xiàn),如2012年出現(xiàn)的中東呼吸綜合征冠狀病毒(Middle East respiratory syndrome coronavirus,MERS-CoV),2014年在美國(guó)爆發(fā)的豬δ冠狀病毒(Porcine deltacoronavirus,PDCoV);而且,隨著環(huán)境條件變化或免疫壓力等因素的影響,一些老的冠狀病毒也發(fā)生了變異,導(dǎo)致新的變異毒株出現(xiàn)和流行,如2010年底在我國(guó)大流行的豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)變異毒株。這些新發(fā)與再現(xiàn)的冠狀病毒,給人類和動(dòng)物健康造成構(gòu)成了巨大...
【文章頁(yè)數(shù)】:105 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
1.1 抗病毒天然免疫概述
1.1.1 抗病毒天然免疫簡(jiǎn)介
1.1.2 天然免疫的模式識(shí)別受體
1.1.3 RNA病毒誘導(dǎo)I型干擾素產(chǎn)生的信號(hào)通路
1.1.4 I型干擾素誘導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)
1.2 病毒蛋白拮抗干擾素應(yīng)答的機(jī)制
1.2.1 病毒蛋白拮抗I型干擾素表達(dá)
1.2.2 病毒蛋白拮抗I型干擾素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)
1.3 冠狀病毒的研究進(jìn)展
1.3.1 冠狀病毒分類
1.3.2 冠狀病毒基因組結(jié)構(gòu)和復(fù)制
1.3.3 冠狀病毒與天然免疫
1.3.4 豬流行性腹瀉病毒的流行特征
1.3.5 鼠肝炎病毒和呼吸道冠狀病毒的流行特征
1.3.6 豬δ冠狀病毒的流行特征
第2章 研究目的與意義
第3章 材料與方法
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 毒株與菌株
3.1.2 細(xì)胞及轉(zhuǎn)染相關(guān)材料
3.1.3 載體與質(zhì)粒
3.1.4 工具酶、抗體及主要化學(xué)試劑
3.1.5 細(xì)胞培養(yǎng)基及其配置
3.1.6 主要緩沖液及其配置
3.1.7 主要實(shí)驗(yàn)儀器及設(shè)備
3.1.8 分子生物學(xué)分析軟件
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建
3.2.2 VSV-GFP和仙臺(tái)病毒的增殖
3.2.3 RNA的提取及實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR
3.2.4 雙熒光素酶檢測(cè)實(shí)驗(yàn)
3.2.5 Western blot及Co-IP實(shí)驗(yàn)
3.2.6 間接免疫熒光實(shí)驗(yàn)與激光共聚焦顯微鏡觀察
3.2.7 RNA結(jié)合實(shí)驗(yàn)
3.2.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
第4章 結(jié)果與分析
4.1 PEDV N蛋白拮抗IFN-β產(chǎn)生
4.1.1 PEDV N蛋白抑制SEV誘導(dǎo)的IFN-β表達(dá)
4.1.2 PEDV N蛋白抑制IRF3的活性
4.1.3 TBK1可能是PEDV N蛋白潛在的靶標(biāo)
4.1.4 PEDV N蛋白能與TBK1發(fā)生相互作用
4.1.5 PEDV N蛋白阻礙了IRF3與TBK1之間的相互作用
4.2 MHV和SARS-CoV N蛋白拮抗IFN-β產(chǎn)生
4.2.1 MHV和SARS-CoV N蛋白沒(méi)有靶向TBK1
4.2.2 MHV N蛋白抑制SEV誘導(dǎo)的IFN-β表達(dá)
4.2.3 MHV和SARS-CoV N蛋白抑制PACT激活的RIG-I/MDA5誘導(dǎo)IFN-β產(chǎn)生活性
4.2.4 MHV和SARS-CoV N蛋白能與PACT發(fā)生相互作用
4.2.5 MHV和SARS-CoV N蛋白抑制PACT結(jié)合RIG-I/MDA5
4.2.6 MHV和SARS-CoV N蛋白結(jié)合PACT是依賴RNA的
4.2.7 PEDV和PRRSV N蛋白不能拮抗PACT
4.3 PDCoV N蛋白抑制IFN-β產(chǎn)生的分子機(jī)制
4.3.1 PDCoV N蛋白抑制SEV誘導(dǎo)的IFN-β產(chǎn)生
4.3.2 PDCoV N蛋白抑制IRF3活性
4.3.3 PDCoV N蛋白抑制SEV誘導(dǎo)的RIG-I/MDA5活性
4.3.4 PDCoV N蛋白能夠與RIG-I發(fā)生相互作用且不依賴RNA
4.3.5 PDCoV N蛋白能與RIG-I的Hel和CTD結(jié)構(gòu)域發(fā)生相互作用
4.3.6 PDCoV N蛋白抑制poly(I:C)和PACT結(jié)合RIG-I
4.3.7 PDCoV N蛋白的NTD結(jié)構(gòu)域發(fā)揮抑制IFN-β功能
第5章 討論與結(jié)論
5.1 討論
5.1.1 PEDV N蛋白抑制IFN-β產(chǎn)生產(chǎn)生的分子機(jī)制初步研究
5.1.2 MHV和SARS-CoV N蛋白抑制IFN-β產(chǎn)生的分子機(jī)制初步研究
5.1.3 PDCoV N蛋白抑制IFN-β產(chǎn)生的分子機(jī)制研究
5.1.4 冠狀病毒編碼的蛋白抑制IFN-β產(chǎn)生的規(guī)律
5.2 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
本文編號(hào):3777624
【文章頁(yè)數(shù)】:105 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
1.1 抗病毒天然免疫概述
1.1.1 抗病毒天然免疫簡(jiǎn)介
1.1.2 天然免疫的模式識(shí)別受體
1.1.3 RNA病毒誘導(dǎo)I型干擾素產(chǎn)生的信號(hào)通路
1.1.4 I型干擾素誘導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)
1.2 病毒蛋白拮抗干擾素應(yīng)答的機(jī)制
1.2.1 病毒蛋白拮抗I型干擾素表達(dá)
1.2.2 病毒蛋白拮抗I型干擾素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)
1.3 冠狀病毒的研究進(jìn)展
1.3.1 冠狀病毒分類
1.3.2 冠狀病毒基因組結(jié)構(gòu)和復(fù)制
1.3.3 冠狀病毒與天然免疫
1.3.4 豬流行性腹瀉病毒的流行特征
1.3.5 鼠肝炎病毒和呼吸道冠狀病毒的流行特征
1.3.6 豬δ冠狀病毒的流行特征
第2章 研究目的與意義
第3章 材料與方法
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 毒株與菌株
3.1.2 細(xì)胞及轉(zhuǎn)染相關(guān)材料
3.1.3 載體與質(zhì)粒
3.1.4 工具酶、抗體及主要化學(xué)試劑
3.1.5 細(xì)胞培養(yǎng)基及其配置
3.1.6 主要緩沖液及其配置
3.1.7 主要實(shí)驗(yàn)儀器及設(shè)備
3.1.8 分子生物學(xué)分析軟件
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建
3.2.2 VSV-GFP和仙臺(tái)病毒的增殖
3.2.3 RNA的提取及實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR
3.2.4 雙熒光素酶檢測(cè)實(shí)驗(yàn)
3.2.5 Western blot及Co-IP實(shí)驗(yàn)
3.2.6 間接免疫熒光實(shí)驗(yàn)與激光共聚焦顯微鏡觀察
3.2.7 RNA結(jié)合實(shí)驗(yàn)
3.2.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
第4章 結(jié)果與分析
4.1 PEDV N蛋白拮抗IFN-β產(chǎn)生
4.1.1 PEDV N蛋白抑制SEV誘導(dǎo)的IFN-β表達(dá)
4.1.2 PEDV N蛋白抑制IRF3的活性
4.1.3 TBK1可能是PEDV N蛋白潛在的靶標(biāo)
4.1.4 PEDV N蛋白能與TBK1發(fā)生相互作用
4.1.5 PEDV N蛋白阻礙了IRF3與TBK1之間的相互作用
4.2 MHV和SARS-CoV N蛋白拮抗IFN-β產(chǎn)生
4.2.1 MHV和SARS-CoV N蛋白沒(méi)有靶向TBK1
4.2.2 MHV N蛋白抑制SEV誘導(dǎo)的IFN-β表達(dá)
4.2.3 MHV和SARS-CoV N蛋白抑制PACT激活的RIG-I/MDA5誘導(dǎo)IFN-β產(chǎn)生活性
4.2.4 MHV和SARS-CoV N蛋白能與PACT發(fā)生相互作用
4.2.5 MHV和SARS-CoV N蛋白抑制PACT結(jié)合RIG-I/MDA5
4.2.6 MHV和SARS-CoV N蛋白結(jié)合PACT是依賴RNA的
4.2.7 PEDV和PRRSV N蛋白不能拮抗PACT
4.3 PDCoV N蛋白抑制IFN-β產(chǎn)生的分子機(jī)制
4.3.1 PDCoV N蛋白抑制SEV誘導(dǎo)的IFN-β產(chǎn)生
4.3.2 PDCoV N蛋白抑制IRF3活性
4.3.3 PDCoV N蛋白抑制SEV誘導(dǎo)的RIG-I/MDA5活性
4.3.4 PDCoV N蛋白能夠與RIG-I發(fā)生相互作用且不依賴RNA
4.3.5 PDCoV N蛋白能與RIG-I的Hel和CTD結(jié)構(gòu)域發(fā)生相互作用
4.3.6 PDCoV N蛋白抑制poly(I:C)和PACT結(jié)合RIG-I
4.3.7 PDCoV N蛋白的NTD結(jié)構(gòu)域發(fā)揮抑制IFN-β功能
第5章 討論與結(jié)論
5.1 討論
5.1.1 PEDV N蛋白抑制IFN-β產(chǎn)生產(chǎn)生的分子機(jī)制初步研究
5.1.2 MHV和SARS-CoV N蛋白抑制IFN-β產(chǎn)生的分子機(jī)制初步研究
5.1.3 PDCoV N蛋白抑制IFN-β產(chǎn)生的分子機(jī)制研究
5.1.4 冠狀病毒編碼的蛋白抑制IFN-β產(chǎn)生的規(guī)律
5.2 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
本文編號(hào):3777624
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