普氏野馬兩種腸道寄生蟲ITS序列的擴增與分析
發(fā)布時間:2023-03-29 21:25
普氏野馬(Equus ferus ssp. przewalskii)作為一種瀕危保護(hù)動物,其健康成長和種群數(shù)量的擴大對種質(zhì)資源保護(hù)具有特殊價值,其體內(nèi)寄生蟲可對機體產(chǎn)生不同程度的病理損害。本研究擬鑒定國家林業(yè)局甘肅瀕危動物保護(hù)中心普氏野馬腸道內(nèi)寄生蟲的種類,首先分離普氏野馬群體驅(qū)蟲后糞便中的蟲體,進(jìn)行形態(tài)學(xué)特征初步鑒定,之后運用生物信息學(xué)方法對擴增蟲體的內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer, ITS)序列進(jìn)行比對。結(jié)果顯示,普氏野馬腸道共分離出2種蟲體,形態(tài)學(xué)鑒定初步推斷為馬副蛔蟲(Parascaris equorum)和杯環(huán)屬線蟲(Cylicocyclus sp.),分別命名為PE和CN;PE蟲體ITS區(qū)全長865 bp(GenBank No. MT579850),其中ITS-1、5.8S r DNA和ITS-2的長度分別為421、156和288 bp,其與馬副蛔蟲的同源性為99.88%;CN蟲體ITS區(qū)全長843 bp (GenBank No. MT581488),其中ITS-1、5.8S rDNA和ITS-2的長度分別為370、153和320 bp...
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣品采集
1.2 主要試劑及實驗儀器
1.3 形態(tài)學(xué)鑒定
1.4 蟲體DNA的提取
1.5 PCR擴增ITS序列
1.6 ITS擴增片段克隆及測序分析
1.7 進(jìn)化樹構(gòu)建與遺傳距離計算
2 結(jié)果與分析
2.1 蟲體形態(tài)學(xué)特征
2.2 ITS序列PCR擴增產(chǎn)物鑒定
2.3 ITS擴增序列的測序及同源性分析
2.3.1 PE蟲體
2.3.2 CN蟲體
2.4 ITS序列系統(tǒng)發(fā)育樹分析
2.4.1 PE與其他蛔蟲ITS序列的進(jìn)化樹
2.4.2 CN與其他線蟲ITS序列的進(jìn)化樹
2.5 ITS序列遺傳距離分析
2.5.1 馬副蛔蟲(PE)與其他蛔蟲ITS序列的遺傳距離
2.5.2 鼻狀杯環(huán)線蟲(CN)與其他線蟲ITS序列的遺傳距離
3 討論
4 結(jié)論
本文編號:3774509
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣品采集
1.2 主要試劑及實驗儀器
1.3 形態(tài)學(xué)鑒定
1.4 蟲體DNA的提取
1.5 PCR擴增ITS序列
1.6 ITS擴增片段克隆及測序分析
1.7 進(jìn)化樹構(gòu)建與遺傳距離計算
2 結(jié)果與分析
2.1 蟲體形態(tài)學(xué)特征
2.2 ITS序列PCR擴增產(chǎn)物鑒定
2.3 ITS擴增序列的測序及同源性分析
2.3.1 PE蟲體
2.3.2 CN蟲體
2.4 ITS序列系統(tǒng)發(fā)育樹分析
2.4.1 PE與其他蛔蟲ITS序列的進(jìn)化樹
2.4.2 CN與其他線蟲ITS序列的進(jìn)化樹
2.5 ITS序列遺傳距離分析
2.5.1 馬副蛔蟲(PE)與其他蛔蟲ITS序列的遺傳距離
2.5.2 鼻狀杯環(huán)線蟲(CN)與其他線蟲ITS序列的遺傳距離
3 討論
4 結(jié)論
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