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中國地區(qū)捻轉(zhuǎn)血矛線蟲遺傳多樣性的研究

發(fā)布時間:2023-03-26 17:35
  捻轉(zhuǎn)血矛線蟲是毛圓科線蟲中的一種重要病原,感染反芻動物,雌蟲產(chǎn)卵量高,感染后臨床癥狀表現(xiàn)為貧血、腹瀉和水腫等,嚴(yán)重時可引起家畜死亡,給畜牧業(yè)帶來嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。由于沒有商業(yè)化的疫苗,捻轉(zhuǎn)血矛線蟲病的防控仍然以抗蠕蟲藥治療為主。但是長期無節(jié)制地使用抗蠕蟲藥導(dǎo)致藥物抗藥性的產(chǎn)生,并且有些地區(qū)的多重藥物抗藥性已經(jīng)開始高度流行。通過對捻轉(zhuǎn)血矛線蟲種群遺傳多樣性的研究,不僅能夠?yàn)榭顾幮缘任换虻臄U(kuò)散提供理論依據(jù),而且對捻轉(zhuǎn)血矛線蟲病防控策略的制定提供有用的信息。但是目前對中國地區(qū)捻轉(zhuǎn)血矛線蟲種群遺傳多樣性尚一無所知。 線粒體DNA是核外遺傳標(biāo)記,進(jìn)化速度快,具有母系遺傳特征;微衛(wèi)星DNA廣泛分布在核基因組中,是孟德爾顯性遺傳標(biāo)記,多態(tài)性豐富,兩種分子標(biāo)記都能很好的反映出種群的遺傳特性。本研究利用線粒體nad4基因和微衛(wèi)星DNA兩種遺傳標(biāo)記比較分析我國不同地理種群的遺傳結(jié)構(gòu),探討種群間和種群內(nèi)的進(jìn)化關(guān)系及變異程度。 (1)基于線粒體nad4基因的種群遺傳多樣性分析 隨州、宜都、云南、陜西、廣西、遼寧和黑龍江7個種群用于捻轉(zhuǎn)血矛線蟲的遺傳多樣性分析,測序得到152條nad4基因序列,經(jīng)分析后共有14...

【文章頁數(shù)】:83 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略語表
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 捻轉(zhuǎn)血矛線蟲概述
        1.1.1 捻轉(zhuǎn)血矛線蟲簡介
        1.1.2 捻轉(zhuǎn)血矛線蟲的形態(tài)結(jié)構(gòu)
        1.1.3 捻轉(zhuǎn)血矛線蟲的生活史
        1.1.4 捻轉(zhuǎn)血矛線蟲的流行病學(xué)
        1.1.5 捻轉(zhuǎn)血矛線蟲的致病性和癥狀
        1.1.6 捻轉(zhuǎn)血矛線蟲病的防治
    1.2 寄生線蟲遺傳多樣性的研究進(jìn)展
        1.2.1 遺傳多樣性概述
        1.2.2 寄生線蟲遺傳多樣性的研究意義
        1.2.3 寄生線蟲遺傳多樣性的研究方法
    1.3 捻轉(zhuǎn)血矛線蟲遺傳多樣性的研究現(xiàn)狀
        1.3.1 線粒體DNA標(biāo)記的研究現(xiàn)狀
        1.3.2 微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的研究現(xiàn)狀
        1.3.3 其他分子標(biāo)記的研究現(xiàn)狀
2 研究目的與意義
3 材料與方法
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
    3.2 主要儀器和試劑
        3.2.1 主要儀器
        3.2.2 主要試劑
        3.2.3 主要溶液的配制
    3.3 試驗(yàn)方法
        3.3.1 基因組DNA的提取
        3.3.2 樣品的分子生物學(xué)方法鑒定
        3.3.3 線粒體nad4基因DNA序列的獲取
        3.3.4 微衛(wèi)星多肽性位點(diǎn)的篩選
        3.3.5 微衛(wèi)星的基因分型
        3.3.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
4 結(jié)果與分析
    4.1 ITS-2基因的分析
        4.1.1 PCR擴(kuò)增及產(chǎn)物測序
        4.1.2 DNA序列分析
    4.2 線粒體nad4基因的遺傳多樣性分析
        4.2.1 PCR擴(kuò)增及產(chǎn)物測序
        4.2.2 DNA序列分析
        4.2.3 系統(tǒng)進(jìn)化分析
        4.2.4 種群遺傳變異分析
    4.3 微衛(wèi)星的遺傳多樣性分析
        4.3.1 聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測
        4.3.2 熒光PCR擴(kuò)增及檢測
        4.3.3 毛細(xì)管電泳檢測
        4.3.4 微衛(wèi)星位點(diǎn)的多態(tài)性分析
        4.3.5 微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因頻率檢測
        4.3.6 哈迪-溫伯格平衡檢測(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)
        4.3.7 種群遺傳變異分析
        4.3.8 種群遺傳結(jié)構(gòu)分析
        4.3.9 種群主成分和主坐標(biāo)分析
        4.3.10 種群動態(tài)分析
        4.3.11 種群地理隔離分析
5 討論
    5.1 基于線粒體nad4基因的種群遺傳多樣性分析
        5.1.1 種群遺傳變異
        5.1.2 種群遺傳結(jié)構(gòu)
    5.2 基于微衛(wèi)星DNA的種群遺傳多樣性分析
        5.2.1 多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn)的檢測
        5.2.2 種群遺傳多樣性
        5.2.3 哈迪-溫伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium)
        5.2.4 種群遺傳結(jié)構(gòu)
        5.2.5 種群動態(tài)
    5.3 種群遺傳多樣性研究的重要性
6 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄



本文編號:3771393

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