中國地區(qū)捻轉血矛線蟲遺傳多樣性的研究
發(fā)布時間:2023-03-26 17:35
捻轉血矛線蟲是毛圓科線蟲中的一種重要病原,感染反芻動物,雌蟲產卵量高,感染后臨床癥狀表現(xiàn)為貧血、腹瀉和水腫等,嚴重時可引起家畜死亡,給畜牧業(yè)帶來嚴重的經濟損失。由于沒有商業(yè)化的疫苗,捻轉血矛線蟲病的防控仍然以抗蠕蟲藥治療為主。但是長期無節(jié)制地使用抗蠕蟲藥導致藥物抗藥性的產生,并且有些地區(qū)的多重藥物抗藥性已經開始高度流行。通過對捻轉血矛線蟲種群遺傳多樣性的研究,不僅能夠為抗藥性等位基因的擴散提供理論依據(jù),而且對捻轉血矛線蟲病防控策略的制定提供有用的信息。但是目前對中國地區(qū)捻轉血矛線蟲種群遺傳多樣性尚一無所知。 線粒體DNA是核外遺傳標記,進化速度快,具有母系遺傳特征;微衛(wèi)星DNA廣泛分布在核基因組中,是孟德爾顯性遺傳標記,多態(tài)性豐富,兩種分子標記都能很好的反映出種群的遺傳特性。本研究利用線粒體nad4基因和微衛(wèi)星DNA兩種遺傳標記比較分析我國不同地理種群的遺傳結構,探討種群間和種群內的進化關系及變異程度。 (1)基于線粒體nad4基因的種群遺傳多樣性分析 隨州、宜都、云南、陜西、廣西、遼寧和黑龍江7個種群用于捻轉血矛線蟲的遺傳多樣性分析,測序得到152條nad4基因序列,經分析后共有14...
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略語表
1 文獻綜述
1.1 捻轉血矛線蟲概述
1.1.1 捻轉血矛線蟲簡介
1.1.2 捻轉血矛線蟲的形態(tài)結構
1.1.3 捻轉血矛線蟲的生活史
1.1.4 捻轉血矛線蟲的流行病學
1.1.5 捻轉血矛線蟲的致病性和癥狀
1.1.6 捻轉血矛線蟲病的防治
1.2 寄生線蟲遺傳多樣性的研究進展
1.2.1 遺傳多樣性概述
1.2.2 寄生線蟲遺傳多樣性的研究意義
1.2.3 寄生線蟲遺傳多樣性的研究方法
1.3 捻轉血矛線蟲遺傳多樣性的研究現(xiàn)狀
1.3.1 線粒體DNA標記的研究現(xiàn)狀
1.3.2 微衛(wèi)星DNA標記的研究現(xiàn)狀
1.3.3 其他分子標記的研究現(xiàn)狀
2 研究目的與意義
3 材料與方法
3.1 實驗材料
3.2 主要儀器和試劑
3.2.1 主要儀器
3.2.2 主要試劑
3.2.3 主要溶液的配制
3.3 試驗方法
3.3.1 基因組DNA的提取
3.3.2 樣品的分子生物學方法鑒定
3.3.3 線粒體nad4基因DNA序列的獲取
3.3.4 微衛(wèi)星多肽性位點的篩選
3.3.5 微衛(wèi)星的基因分型
3.3.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
4 結果與分析
4.1 ITS-2基因的分析
4.1.1 PCR擴增及產物測序
4.1.2 DNA序列分析
4.2 線粒體nad4基因的遺傳多樣性分析
4.2.1 PCR擴增及產物測序
4.2.2 DNA序列分析
4.2.3 系統(tǒng)進化分析
4.2.4 種群遺傳變異分析
4.3 微衛(wèi)星的遺傳多樣性分析
4.3.1 聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測
4.3.2 熒光PCR擴增及檢測
4.3.3 毛細管電泳檢測
4.3.4 微衛(wèi)星位點的多態(tài)性分析
4.3.5 微衛(wèi)星位點的等位基因頻率檢測
4.3.6 哈迪-溫伯格平衡檢測(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)
4.3.7 種群遺傳變異分析
4.3.8 種群遺傳結構分析
4.3.9 種群主成分和主坐標分析
4.3.10 種群動態(tài)分析
4.3.11 種群地理隔離分析
5 討論
5.1 基于線粒體nad4基因的種群遺傳多樣性分析
5.1.1 種群遺傳變異
5.1.2 種群遺傳結構
5.2 基于微衛(wèi)星DNA的種群遺傳多樣性分析
5.2.1 多態(tài)性微衛(wèi)星位點的檢測
5.2.2 種群遺傳多樣性
5.2.3 哈迪-溫伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium)
5.2.4 種群遺傳結構
5.2.5 種群動態(tài)
5.3 種群遺傳多樣性研究的重要性
6 結論
參考文獻
致謝
附錄
本文編號:3771393
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略語表
1 文獻綜述
1.1 捻轉血矛線蟲概述
1.1.1 捻轉血矛線蟲簡介
1.1.2 捻轉血矛線蟲的形態(tài)結構
1.1.3 捻轉血矛線蟲的生活史
1.1.4 捻轉血矛線蟲的流行病學
1.1.5 捻轉血矛線蟲的致病性和癥狀
1.1.6 捻轉血矛線蟲病的防治
1.2 寄生線蟲遺傳多樣性的研究進展
1.2.1 遺傳多樣性概述
1.2.2 寄生線蟲遺傳多樣性的研究意義
1.2.3 寄生線蟲遺傳多樣性的研究方法
1.3 捻轉血矛線蟲遺傳多樣性的研究現(xiàn)狀
1.3.1 線粒體DNA標記的研究現(xiàn)狀
1.3.2 微衛(wèi)星DNA標記的研究現(xiàn)狀
1.3.3 其他分子標記的研究現(xiàn)狀
2 研究目的與意義
3 材料與方法
3.1 實驗材料
3.2 主要儀器和試劑
3.2.1 主要儀器
3.2.2 主要試劑
3.2.3 主要溶液的配制
3.3 試驗方法
3.3.1 基因組DNA的提取
3.3.2 樣品的分子生物學方法鑒定
3.3.3 線粒體nad4基因DNA序列的獲取
3.3.4 微衛(wèi)星多肽性位點的篩選
3.3.5 微衛(wèi)星的基因分型
3.3.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
4 結果與分析
4.1 ITS-2基因的分析
4.1.1 PCR擴增及產物測序
4.1.2 DNA序列分析
4.2 線粒體nad4基因的遺傳多樣性分析
4.2.1 PCR擴增及產物測序
4.2.2 DNA序列分析
4.2.3 系統(tǒng)進化分析
4.2.4 種群遺傳變異分析
4.3 微衛(wèi)星的遺傳多樣性分析
4.3.1 聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測
4.3.2 熒光PCR擴增及檢測
4.3.3 毛細管電泳檢測
4.3.4 微衛(wèi)星位點的多態(tài)性分析
4.3.5 微衛(wèi)星位點的等位基因頻率檢測
4.3.6 哈迪-溫伯格平衡檢測(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)
4.3.7 種群遺傳變異分析
4.3.8 種群遺傳結構分析
4.3.9 種群主成分和主坐標分析
4.3.10 種群動態(tài)分析
4.3.11 種群地理隔離分析
5 討論
5.1 基于線粒體nad4基因的種群遺傳多樣性分析
5.1.1 種群遺傳變異
5.1.2 種群遺傳結構
5.2 基于微衛(wèi)星DNA的種群遺傳多樣性分析
5.2.1 多態(tài)性微衛(wèi)星位點的檢測
5.2.2 種群遺傳多樣性
5.2.3 哈迪-溫伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium)
5.2.4 種群遺傳結構
5.2.5 種群動態(tài)
5.3 種群遺傳多樣性研究的重要性
6 結論
參考文獻
致謝
附錄
本文編號:3771393
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