本研究旨在通過轉(zhuǎn)錄組測序篩選并研究與卵泡發(fā)育相關(guān)的上調(diào)表達(dá)基因。以3只健康的1歲齡貴州白山羊?yàn)楣┰噷ο?在其發(fā)情3 d后,屠宰并采集卵巢中的優(yōu)勢卵泡與從屬卵泡,分離顆粒細(xì)胞,轉(zhuǎn)錄組測序。通過生物信息學(xué)分析,并對其中的上調(diào)表達(dá)基因進(jìn)行GO、KEGG信號通路分析,經(jīng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR對篩選出的上調(diào)表達(dá)基因進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果顯示:GO分析共分為三大類別44組,其中參與生物學(xué)過程(BP)的基因占72.7%,參與細(xì)胞組分(CC)的基因占13.6%,參與分子功能(MF)的基因占13.6;KEGG信號通路分析發(fā)現(xiàn)20條通路,其中參與核糖體通路基因富集最為顯著。共篩選出4個(gè)可能促進(jìn)山羊卵泡發(fā)育的基因(CALM2、TUT7、LUM和PDLIM3)。熒光定量PCR結(jié)果表明,TUT7和CALM2在優(yōu)勢卵泡顆粒細(xì)胞中的表達(dá)量顯著高于從屬卵泡。本研究推測獲得的2個(gè)上調(diào)表達(dá)基因可能會促進(jìn)卵泡的發(fā)育,從而導(dǎo)致優(yōu)勢卵泡被選擇。

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及樣品采集
    1.2 總RNA提取、文庫構(gòu)建及測序
    1.3 數(shù)據(jù)處理及分析
    1.4 反轉(zhuǎn)錄及引物合成
    1.5 熒光定量PCR鑒定
    1.6 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
    2.1 貴州白山羊卵泡顆粒細(xì)胞中上調(diào)表達(dá)基因的篩
    2.2 山羊卵泡顆粒細(xì)胞中上調(diào)基因GO功能富集
    2.3 山羊卵泡顆粒細(xì)胞中上調(diào)基因KEGG信號通路分析
    2.4 山羊卵泡顆粒細(xì)胞中上調(diào)基因驗(yàn)證結(jié)果分析
3 討論
4 結(jié)論



本文編號：3760007