大熊貓糞便及環(huán)境中大腸桿菌耐藥性和質(zhì)粒介導(dǎo)ESBLs酶耐藥基因檢測(cè)
發(fā)布時(shí)間:2023-03-11 08:18
大熊貓(Ailuropodamelanoloca)是我國(guó)特有的珍稀大型野生動(dòng)物,屬國(guó)家一級(jí)瀕危保護(hù)動(dòng)物。隨著大熊貓人工圈養(yǎng)的增多,疾病發(fā)生是影響大熊貓繁育重要因素。大熊貓疾病發(fā)生以消化系統(tǒng)疾病為主,其中大腸桿菌是引起腸道感染的主要病原菌。獸醫(yī)臨床主要使用抗菌藥物,尤其是使用β-內(nèi)酰胺類藥物控制大熊貓大腸桿菌病發(fā)生。隨著藥物的廣泛使用或?yàn)E用,耐藥大腸桿菌菌株迅速出現(xiàn),這給野生動(dòng)物感染性疾病的控制帶來(lái)了困難。大腸桿菌除了是重要的病原菌,也是動(dòng)物體內(nèi)的重要共生菌,對(duì)共生菌耐藥性的調(diào)查,有助于了解耐藥菌株的產(chǎn)生和流行趨勢(shì),為控制和減少耐藥的產(chǎn)生具有意義。本研究于2012年7月到2013年7月,從成都大熊貓繁育研究基地,采集大熊貓糞便和環(huán)境樣本,分離鑒定出125株大腸桿菌共生菌,其中糞便源大腸桿菌96株,環(huán)境源大腸桿菌29株。采用藥敏試驗(yàn)紙片擴(kuò)散法,檢測(cè)了菌株對(duì)18種抗菌藥物(8種p-內(nèi)酰胺類藥物和10種非p-內(nèi)酰胺類藥物)的藥物敏感性。結(jié)果顯示,125株大腸桿菌共生菌對(duì)p-內(nèi)酰胺類藥物氨芐西林、頭孢唑林和非β-內(nèi)酰胺類藥物四環(huán)素類、復(fù)方新諾明耐藥較嚴(yán)重(耐藥率范圍30%~75%),菌株對(duì)頭孢西...
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞表
第一部分 文獻(xiàn)綜述
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 大熊貓腸道菌群簡(jiǎn)介
1.2 耐藥大腸桿菌的研究現(xiàn)狀
1.3 大腸桿菌耐β-內(nèi)酰胺類藥物的耐藥機(jī)制研究
1.4 大腸桿菌產(chǎn)ESBLs菌株耐藥基因的傳播機(jī)制
1.5 ESBLs和AmpC酶的檢測(cè)
1.5.1 產(chǎn)ESBLs酶的表型鑒定方法
1.5.2 產(chǎn)AmpC酶的表型篩選
1.6 質(zhì)粒ESBLs和AmpC酶基因的分子生物學(xué)檢測(cè)方法
2 選題目的及意義
第二部分 試驗(yàn)研究
第一章 大熊貓糞便及環(huán)境中大腸桿菌耐藥性監(jiān)測(cè)
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 樣本的采集及質(zhì)控菌株
1.1.2 主要藥物
1.1.3 培養(yǎng)基
1.1.4 其他試劑
1.1.5 主要儀器和設(shè)備
1.2 方法
1.2.1 大腸桿菌的分離和純化
1.2.2 大腸桿菌的鑒定
1.2.3 大腸桿菌菌株的保存
1.2.4 紙片擴(kuò)散法檢測(cè)菌株的藥物敏感性
1.2.5 藥敏結(jié)果的判斷
1.2.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 不同樣本大腸桿菌的分離及鑒定結(jié)果
2.2 96株分離自大熊貓糞便大腸桿菌對(duì)藥物的耐藥情況
2.2.1 96株分離自大熊貓糞便大腸桿菌對(duì)藥物的耐藥率
2.2.2 糞便源大腸桿菌對(duì)藥物的多重耐藥
2.2.3 糞便源菌株對(duì)不同抗菌藥物的交叉耐藥性
2.3 29株分離自環(huán)境大腸菌對(duì)藥物的耐藥情況
2.3.1 29株環(huán)境源菌株對(duì)抗菌藥物的耐藥率
2.3.2 多重耐藥
2.3.3 環(huán)境源菌株對(duì)不同抗菌藥物的交叉耐藥性
2.4 不同來(lái)源菌株對(duì)抗菌藥物耐藥性比較
2.4.1 不同來(lái)源菌株耐藥率比較
2.4.2 不同來(lái)源菌株的多重耐藥性比較
3 討論
3.1 不同樣本大腸桿菌菌株的分離情況
3.2 糞便源菌株對(duì)不同抗菌藥物的耐藥情況
3.2.1 96株糞便源大腸桿菌對(duì)不同抗菌藥物的耐藥率
3.2.2 糞便源大腸桿菌的多重耐藥性分析
3.2.3 糞便源大腸桿菌的交叉耐藥性
3.3 環(huán)境源大腸桿菌的耐藥性分析
3.3.1 29株環(huán)境源大腸桿菌的耐藥性監(jiān)測(cè)
3.3.2 29株環(huán)境源大腸桿菌的多重耐藥性監(jiān)測(cè)
3.3.3 環(huán)境源大腸桿菌的交叉耐藥性
4 小結(jié)
第二章 大腸桿菌產(chǎn)ESBLs和AmpC酶及其基因型的檢測(cè)
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 菌株
1.1.2 藥敏紙片
1.1.3 培養(yǎng)基
1.1.4 其他試劑
1.1.5 主要儀器和設(shè)備
1.2 方法
1.2.1 大腸桿菌產(chǎn)ESBLs的初步篩選
1.2.2 大腸桿菌AmpC酶的初步篩選
1.2.3 產(chǎn)ESBLs和AmpC酶菌株質(zhì)粒DNA的提取及電泳檢測(cè)
1.2.4 大腸桿菌質(zhì)粒ESBLs和AmpC酶的基因型檢測(cè)
1.2.5 基因測(cè)序
1.2.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 產(chǎn)ESBLs和AmpC酶大腸桿菌的篩選
2.1.1 糞便源大腸桿菌產(chǎn)ESBLs酶菌株的篩選
2.1.2 環(huán)境源大腸桿菌產(chǎn)ESBLs酶菌株的篩選
2.1.3 產(chǎn)AmpC酶大腸桿菌的篩選
2.2 產(chǎn)ESBLs大腸桿菌的耐藥性分析
2.3 ESBLs基因和AmpC酶基因檢測(cè)
2.3.1 ESBLs基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.3.2 AmpC酶基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.4 基因測(cè)序結(jié)果
3 討論
3.1 產(chǎn)ESBLs和AmpC酶大腸桿菌的篩選
3.2 產(chǎn)ESBLs陽(yáng)性菌株和陰性菌株的耐藥性比較
3.3 大腸桿菌ESBLs和AmpC耐藥基因流行情況
第三部分 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
本文編號(hào):3759523
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞表
第一部分 文獻(xiàn)綜述
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 大熊貓腸道菌群簡(jiǎn)介
1.2 耐藥大腸桿菌的研究現(xiàn)狀
1.3 大腸桿菌耐β-內(nèi)酰胺類藥物的耐藥機(jī)制研究
1.4 大腸桿菌產(chǎn)ESBLs菌株耐藥基因的傳播機(jī)制
1.5 ESBLs和AmpC酶的檢測(cè)
1.5.1 產(chǎn)ESBLs酶的表型鑒定方法
1.5.2 產(chǎn)AmpC酶的表型篩選
1.6 質(zhì)粒ESBLs和AmpC酶基因的分子生物學(xué)檢測(cè)方法
2 選題目的及意義
第二部分 試驗(yàn)研究
第一章 大熊貓糞便及環(huán)境中大腸桿菌耐藥性監(jiān)測(cè)
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 樣本的采集及質(zhì)控菌株
1.1.2 主要藥物
1.1.3 培養(yǎng)基
1.1.4 其他試劑
1.1.5 主要儀器和設(shè)備
1.2 方法
1.2.1 大腸桿菌的分離和純化
1.2.2 大腸桿菌的鑒定
1.2.3 大腸桿菌菌株的保存
1.2.4 紙片擴(kuò)散法檢測(cè)菌株的藥物敏感性
1.2.5 藥敏結(jié)果的判斷
1.2.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 不同樣本大腸桿菌的分離及鑒定結(jié)果
2.2 96株分離自大熊貓糞便大腸桿菌對(duì)藥物的耐藥情況
2.2.1 96株分離自大熊貓糞便大腸桿菌對(duì)藥物的耐藥率
2.2.2 糞便源大腸桿菌對(duì)藥物的多重耐藥
2.2.3 糞便源菌株對(duì)不同抗菌藥物的交叉耐藥性
2.3 29株分離自環(huán)境大腸菌對(duì)藥物的耐藥情況
2.3.1 29株環(huán)境源菌株對(duì)抗菌藥物的耐藥率
2.3.2 多重耐藥
2.3.3 環(huán)境源菌株對(duì)不同抗菌藥物的交叉耐藥性
2.4 不同來(lái)源菌株對(duì)抗菌藥物耐藥性比較
2.4.1 不同來(lái)源菌株耐藥率比較
2.4.2 不同來(lái)源菌株的多重耐藥性比較
3 討論
3.1 不同樣本大腸桿菌菌株的分離情況
3.2 糞便源菌株對(duì)不同抗菌藥物的耐藥情況
3.2.1 96株糞便源大腸桿菌對(duì)不同抗菌藥物的耐藥率
3.2.2 糞便源大腸桿菌的多重耐藥性分析
3.2.3 糞便源大腸桿菌的交叉耐藥性
3.3 環(huán)境源大腸桿菌的耐藥性分析
3.3.1 29株環(huán)境源大腸桿菌的耐藥性監(jiān)測(cè)
3.3.2 29株環(huán)境源大腸桿菌的多重耐藥性監(jiān)測(cè)
3.3.3 環(huán)境源大腸桿菌的交叉耐藥性
4 小結(jié)
第二章 大腸桿菌產(chǎn)ESBLs和AmpC酶及其基因型的檢測(cè)
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 菌株
1.1.2 藥敏紙片
1.1.3 培養(yǎng)基
1.1.4 其他試劑
1.1.5 主要儀器和設(shè)備
1.2 方法
1.2.1 大腸桿菌產(chǎn)ESBLs的初步篩選
1.2.2 大腸桿菌AmpC酶的初步篩選
1.2.3 產(chǎn)ESBLs和AmpC酶菌株質(zhì)粒DNA的提取及電泳檢測(cè)
1.2.4 大腸桿菌質(zhì)粒ESBLs和AmpC酶的基因型檢測(cè)
1.2.5 基因測(cè)序
1.2.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 產(chǎn)ESBLs和AmpC酶大腸桿菌的篩選
2.1.1 糞便源大腸桿菌產(chǎn)ESBLs酶菌株的篩選
2.1.2 環(huán)境源大腸桿菌產(chǎn)ESBLs酶菌株的篩選
2.1.3 產(chǎn)AmpC酶大腸桿菌的篩選
2.2 產(chǎn)ESBLs大腸桿菌的耐藥性分析
2.3 ESBLs基因和AmpC酶基因檢測(cè)
2.3.1 ESBLs基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.3.2 AmpC酶基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.4 基因測(cè)序結(jié)果
3 討論
3.1 產(chǎn)ESBLs和AmpC酶大腸桿菌的篩選
3.2 產(chǎn)ESBLs陽(yáng)性菌株和陰性菌株的耐藥性比較
3.3 大腸桿菌ESBLs和AmpC耐藥基因流行情況
第三部分 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
本文編號(hào):3759523
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