牦牛GDF-10、IHH、MC4R基因的多態(tài)與生長性狀的相關(guān)性研究
發(fā)布時間:2023-03-05 09:42
本研究選取了3個地方牦牛品種(甘肅甘南牦牛、甘肅天祝牦牛、西藏帕里牦牛)和1個培育品種(青海大通牦牛)為研究對象,應(yīng)用分子生物技術(shù)對牦牛GDF-10基因、IHH基因、MC4R基因多態(tài)性與生長性狀的相關(guān)性進(jìn)行研究,同時應(yīng)用實時熒光定量PCR技術(shù),對GDF-10基因、IHH基因、MC4R基因在牦牛不同組織中的表達(dá)規(guī)律進(jìn)行分析。篩選與牦牛生長發(fā)育有關(guān)的遺傳標(biāo)記,為牦牛分子育種提供理論基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下: 1.GDF-10基因、IHH基因和MC4R基因在牦牛組織中的表達(dá)譜 GDF-10基因、IHH基因和MC4R基因在牦牛的心臟、肝臟、胰腺、肌肉、肺和卵巢等所研究的8個部位都有表達(dá),其中GDF-10基因主要在牦牛脾臟和卵巢組織中高度表達(dá),IHH基因主要在心臟、脾臟和肌肉組織中高度表達(dá),MC4R基因主要在腎臟、胰臟和肌肉組織中高度表達(dá)。 2.GDF-10基因的多態(tài)性及其與牦牛生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)性分析 檢測到牦牛GDF-10基因外顯子區(qū)域3個多態(tài)位點12116(G/A)、12152(C/T)、和13041(T/C),3個多態(tài)位點均表現(xiàn)為低度多態(tài)(PIC<0.25),三個多態(tài)位點之間存在弱連鎖平...
【文章頁數(shù)】:85 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Summary
縮略詞對照表
第一章 緒論
1.1 牦牛概況
1.1.1 牦牛種質(zhì)資源概述
1.1.2 牦牛分子育種研究概述
1.1.2.1 牦牛分子育種研究背景
1.1.2.2 牦牛分子育種研究的必要性
1.1.2.3 牦牛分子育種研究進(jìn)展
1.2 SNP 分子標(biāo)記的研究進(jìn)展
1.2.1 分子標(biāo)記的研究進(jìn)展
1.2.2 SNP 的特點和檢測
1.3 基因分型技術(shù)研究進(jìn)展
1.4 實時熒光定量 PCR
1.5 GDF-10 基因的研究進(jìn)展
1.5.1 GDF-10 家族簡介
1.5.2 GDF-10 基因的結(jié)構(gòu)和功能
1.5.3 GDF-10 基因的表達(dá)
1.6 IHH 基因的研究進(jìn)展
1.6.1 IHH 基因的家族簡介
1.6.2 IHH 基因的結(jié)構(gòu)和功能
1.6.3 IHH 基因的表達(dá)研究
1.7 MC4R 基因的研究進(jìn)展
1.7.1 MC4R 基因家族簡介
1.7.2 MC4R 基因結(jié)構(gòu)和功能
1.7.3 MC4R 基因表達(dá)
1.8 實驗的目的和意義
1.9 實驗的技術(shù)路線
第二章 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 實驗所用牦牛血樣及組織樣
2.1.2 生產(chǎn)性狀指標(biāo)
2.2 主要儀器設(shè)備與試劑
2.3 試驗方法
2.3.1 基因組 DNA 的提取和檢測
2.3.2 混合 DNA 池的構(gòu)建
2.3.3 RNA 的提取和質(zhì)量測定
2.3.4 引物設(shè)計和稀釋
2.3.4.1 GDF-10 基因引物設(shè)計
2.3.4.2 IHH 基因引物設(shè)計
2.3.4.3 MC4R 基因引物設(shè)計
2.3.5 實時定量 PCR 擴(kuò)增
2.3.6 DNA 擴(kuò)增和產(chǎn)物純化
2.3.7 HRM 小片段法基因分型和測序
2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計
第三章 結(jié)果與分析
3.1 基因組 DNA 的提取和擴(kuò)增結(jié)果
3.2 RNA 的提取結(jié)果
3.3 牦牛候選基因組織表達(dá)譜分析
3.3.1 牦牛 GDF-10 基因的組織表達(dá)譜分析
3.3.2 牦牛 IHH 基因的組織表達(dá)譜分析
3.3.3 牦牛 MC4R 基因的組織表達(dá)譜分析
3.4 牦牛 GDF-10 基因外顯子區(qū)域多態(tài)位點的統(tǒng)計分析
3.4.1 牦牛 GDF-10 基因 HRM 方法的分型
3.4.2 牦牛 GDF-10 基因多態(tài)位點遺傳多態(tài)性的分析
3.4.2.1 牦牛 GDF-10 基因的基因型頻率、基因頻率
3.4.2.2 牦牛 GDF-10 基因群體遺傳特性
3.4.2.3 牦牛 GDF-10 基因的單倍型分析
3.4.2.4 牦牛 GDF-10 基因基因型及單倍型與體尺性狀的關(guān)聯(lián)性分析
3.5 牦牛 IHH 基因外顯子區(qū)域多態(tài)位點的統(tǒng)計分析
3.5.1 牦牛 IHH 基因 HRM 方法的分型
3.5.2 牦牛 IHH 基因多態(tài)位點遺傳多態(tài)性的分析
3.5.2.1 牦牛 IHH 基因的基因型頻率、基因頻率
3.5.2.2 牦牛 IHH 基因群體遺傳特性
3.5.2.3 牦牛 IHH 基因的單倍型分析
3.5.2.4 牦牛 IHH 基因基因型及基因型組合與體尺性狀的關(guān)聯(lián)性分析
3.6 牦牛 MC4R 基因基因型及單倍型與體尺性狀的關(guān)聯(lián)性分析
3.6.1 牦牛 MC4R 基因 HRM 方法的分型
3.6.2 牦牛 MC4R 基因多態(tài)位點遺傳多態(tài)性的分析
3.6.2.1 牦牛 MC4R 基因的基因型頻率、基因頻率
3.6.2.2 牦牛 MC4R 基因群體遺傳特性
3.6.2.3 牦牛 MC4R 基因基因型與體尺性狀的關(guān)聯(lián)性分析
第四章 討論
4.1 采樣及實驗方法的分析
4.1.1 牦牛血樣的采集及 DNA 的提取
4.1.2 SNP 篩查
4.1.3 影響基因分型的因素
4.2 牦牛候選基因的組織表達(dá)譜分析
4.3 牦牛 GDF-10 基因遺傳分析
4.4 牦牛 IHH 基因遺傳分析
4.5 牦牛 MC4R 基因遺傳分析
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
個人簡介
導(dǎo)師簡介
附錄
本文編號:3755960
【文章頁數(shù)】:85 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Summary
縮略詞對照表
第一章 緒論
1.1 牦牛概況
1.1.1 牦牛種質(zhì)資源概述
1.1.2 牦牛分子育種研究概述
1.1.2.1 牦牛分子育種研究背景
1.1.2.2 牦牛分子育種研究的必要性
1.1.2.3 牦牛分子育種研究進(jìn)展
1.2 SNP 分子標(biāo)記的研究進(jìn)展
1.2.1 分子標(biāo)記的研究進(jìn)展
1.2.2 SNP 的特點和檢測
1.3 基因分型技術(shù)研究進(jìn)展
1.4 實時熒光定量 PCR
1.5 GDF-10 基因的研究進(jìn)展
1.5.1 GDF-10 家族簡介
1.5.2 GDF-10 基因的結(jié)構(gòu)和功能
1.5.3 GDF-10 基因的表達(dá)
1.6 IHH 基因的研究進(jìn)展
1.6.1 IHH 基因的家族簡介
1.6.2 IHH 基因的結(jié)構(gòu)和功能
1.6.3 IHH 基因的表達(dá)研究
1.7 MC4R 基因的研究進(jìn)展
1.7.1 MC4R 基因家族簡介
1.7.2 MC4R 基因結(jié)構(gòu)和功能
1.7.3 MC4R 基因表達(dá)
1.8 實驗的目的和意義
1.9 實驗的技術(shù)路線
第二章 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 實驗所用牦牛血樣及組織樣
2.1.2 生產(chǎn)性狀指標(biāo)
2.2 主要儀器設(shè)備與試劑
2.3 試驗方法
2.3.1 基因組 DNA 的提取和檢測
2.3.2 混合 DNA 池的構(gòu)建
2.3.3 RNA 的提取和質(zhì)量測定
2.3.4 引物設(shè)計和稀釋
2.3.4.1 GDF-10 基因引物設(shè)計
2.3.4.2 IHH 基因引物設(shè)計
2.3.4.3 MC4R 基因引物設(shè)計
2.3.5 實時定量 PCR 擴(kuò)增
2.3.6 DNA 擴(kuò)增和產(chǎn)物純化
2.3.7 HRM 小片段法基因分型和測序
2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計
第三章 結(jié)果與分析
3.1 基因組 DNA 的提取和擴(kuò)增結(jié)果
3.2 RNA 的提取結(jié)果
3.3 牦牛候選基因組織表達(dá)譜分析
3.3.1 牦牛 GDF-10 基因的組織表達(dá)譜分析
3.3.2 牦牛 IHH 基因的組織表達(dá)譜分析
3.3.3 牦牛 MC4R 基因的組織表達(dá)譜分析
3.4 牦牛 GDF-10 基因外顯子區(qū)域多態(tài)位點的統(tǒng)計分析
3.4.1 牦牛 GDF-10 基因 HRM 方法的分型
3.4.2 牦牛 GDF-10 基因多態(tài)位點遺傳多態(tài)性的分析
3.4.2.1 牦牛 GDF-10 基因的基因型頻率、基因頻率
3.4.2.2 牦牛 GDF-10 基因群體遺傳特性
3.4.2.3 牦牛 GDF-10 基因的單倍型分析
3.4.2.4 牦牛 GDF-10 基因基因型及單倍型與體尺性狀的關(guān)聯(lián)性分析
3.5 牦牛 IHH 基因外顯子區(qū)域多態(tài)位點的統(tǒng)計分析
3.5.1 牦牛 IHH 基因 HRM 方法的分型
3.5.2 牦牛 IHH 基因多態(tài)位點遺傳多態(tài)性的分析
3.5.2.1 牦牛 IHH 基因的基因型頻率、基因頻率
3.5.2.2 牦牛 IHH 基因群體遺傳特性
3.5.2.3 牦牛 IHH 基因的單倍型分析
3.5.2.4 牦牛 IHH 基因基因型及基因型組合與體尺性狀的關(guān)聯(lián)性分析
3.6 牦牛 MC4R 基因基因型及單倍型與體尺性狀的關(guān)聯(lián)性分析
3.6.1 牦牛 MC4R 基因 HRM 方法的分型
3.6.2 牦牛 MC4R 基因多態(tài)位點遺傳多態(tài)性的分析
3.6.2.1 牦牛 MC4R 基因的基因型頻率、基因頻率
3.6.2.2 牦牛 MC4R 基因群體遺傳特性
3.6.2.3 牦牛 MC4R 基因基因型與體尺性狀的關(guān)聯(lián)性分析
第四章 討論
4.1 采樣及實驗方法的分析
4.1.1 牦牛血樣的采集及 DNA 的提取
4.1.2 SNP 篩查
4.1.3 影響基因分型的因素
4.2 牦牛候選基因的組織表達(dá)譜分析
4.3 牦牛 GDF-10 基因遺傳分析
4.4 牦牛 IHH 基因遺傳分析
4.5 牦牛 MC4R 基因遺傳分析
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
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導(dǎo)師簡介
附錄
本文編號:3755960
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