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功能基因組注釋探討解淀粉芽孢桿菌的益生機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2023-03-03 19:55
  旨在利用功能基因組注釋的方法,深入挖掘解淀粉芽孢桿菌BLCC1-0238基因組中與益生作用密切相關(guān)的功能基因。結(jié)果表明,解淀粉芽孢桿菌BLCC1-0238的基因組大小約為3.88 Mb,含有3 941個(gè)編碼序列,有8個(gè)基因簇參與聚酮類化物、非核糖體脂肽和芽孢桿菌素的生物合成,部分基因簇參與環(huán)狀脂肽羅克霉素的合成;該菌還具有1個(gè)編碼肽基脯氨酰異構(gòu)酶的基因,12個(gè)與耐酸相關(guān)的基因和7個(gè)參與編碼水解酶的基因。綜上所述,這些基因的存在有助于動(dòng)物機(jī)體對(duì)抗病原菌和脅迫因素,還有利于對(duì)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的消化和吸收。

【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 主要試劑和儀器
    1.2 基因組測(cè)序和注釋
    1.3 基因組比較
    1.4 基因組數(shù)據(jù)挖掘次級(jí)代謝產(chǎn)物和水解酶
2 結(jié)果與分析
    2.1 基因組比較和注釋
    2.2 抗菌代謝產(chǎn)物
        2.2.1 聚酮類化合物
        2.2.2 環(huán)二肽
        2.2.3 非核糖體合成的脂肽
        2.2.4 細(xì)菌黏附素和聚集素
    2.3 耐酸基因和水解酶
3 討論與結(jié)論



本文編號(hào):3753010

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