為了解牛支原體(M.bovis)貴州株GZ1、GZ2 TU基因的生物信息學(xué)特征,試驗(yàn)對(duì)牛支原體貴州株TU基因進(jìn)行克隆測(cè)序和序列分析,應(yīng)用DNAStar軟件對(duì)TU基因推導(dǎo)氨基酸序列蛋白親水性、表面可及性、骨架柔韌性及抗原指數(shù)進(jìn)行預(yù)測(cè)和分析。結(jié)果表明:TU基因克隆測(cè)序基因片段長(zhǎng)度為1 009 bp,與預(yù)期相符。TU基因序列分析顯示,牛支原體GZ1株與PG45標(biāo)準(zhǔn)株同源性為99.1%,與GZ2株同源性為99.0%�；蜃儺愋燥@示,參考牛支原體標(biāo)準(zhǔn)株P(guān)G45,GZ1株在第55,134,191,257,389,512,674位發(fā)生了突變,在第178,951,962位發(fā)生了缺失,GZ2株僅在273位發(fā)生了突變。進(jìn)化樹分析顯示,GZ1株與國(guó)內(nèi)分離株屬同一分支,進(jìn)化關(guān)系近。GZ1株與GZ2、PG45株屬不同分支,并且與國(guó)外的分離株進(jìn)化關(guān)系較遠(yuǎn)。TU基因B細(xì)胞抗原表位預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,該蛋白親水性、表面可及性、骨架區(qū)柔韌性都較好,抗原指數(shù)高,且分布相對(duì)均勻。該蛋白整體區(qū)域抗原優(yōu)勢(shì)明顯,具有良好的抗原性。說(shuō)明牛支原體TU基因相對(duì)保守,各地區(qū)分離株存在一定的進(jìn)化關(guān)系。

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【文章目錄】：
1 材料
    1.1 菌株
    1.2 主要試劑
2 方法
    2.1 目的基因的擴(kuò)增
    2.2 TU 基因克隆及序列分析
    2.3 TU 基因抗原性分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 TU基因的PCR 擴(kuò)增
    3.2 TU基因克隆及序列分析
        3.2.1 陽(yáng)性重組質(zhì)粒篩選
        3.2.2 TU基因的核苷酸序列同源性分析
        3.2.3 牛支原體GZ1、GZ2株TU基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
        3.2.4 牛支原體GZ1、GZ2株與標(biāo)準(zhǔn)株P(guān)G45的變異位點(diǎn)分析
    3.3 TU基因B細(xì)胞抗原表位分析
4 討論



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