發(fā)布時間：2023-02-16 19:51

　　為了解牛支原體(M.bovis)貴州株GZ1、GZ2 TU基因的生物信息學特征,試驗對牛支原體貴州株TU基因進行克隆測序和序列分析,應用DNAStar軟件對TU基因推導氨基酸序列蛋白親水性、表面可及性、骨架柔韌性及抗原指數(shù)進行預測和分析。結果表明:TU基因克隆測序基因片段長度為1 009 bp,與預期相符。TU基因序列分析顯示,牛支原體GZ1株與PG45標準株同源性為99.1%,與GZ2株同源性為99.0%�；蜃儺愋燥@示,參考牛支原體標準株PG45,GZ1株在第55,134,191,257,389,512,674位發(fā)生了突變,在第178,951,962位發(fā)生了缺失,GZ2株僅在273位發(fā)生了突變。進化樹分析顯示,GZ1株與國內分離株屬同一分支,進化關系近。GZ1株與GZ2、PG45株屬不同分支,并且與國外的分離株進化關系較遠。TU基因B細胞抗原表位預測結果顯示,該蛋白親水性、表面可及性、骨架區(qū)柔韌性都較好,抗原指數(shù)高,且分布相對均勻。該蛋白整體區(qū)域抗原優(yōu)勢明顯,具有良好的抗原性。說明牛支原體TU基因相對保守,各地區(qū)分離株存在一定的進化關系。

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 材料
    1.1 菌株
    1.2 主要試劑
2 方法
    2.1 目的基因的擴增
    2.2 TU 基因克隆及序列分析
    2.3 TU 基因抗原性分析
3 結果與分析
    3.1 TU基因的PCR 擴增
    3.2 TU基因克隆及序列分析
        3.2.1 陽性重組質粒篩選
        3.2.2 TU基因的核苷酸序列同源性分析
        3.2.3 牛支原體GZ1、GZ2株TU基因的系統(tǒng)進化樹分析
        3.2.4 牛支原體GZ1、GZ2株與標準株PG45的變異位點分析
    3.3 TU基因B細胞抗原表位分析
4 討論



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