豬SUMO1基因的堿基序列特征及其在豬肺炎支原體感染過程中的表達(dá)
發(fā)布時(shí)間:2023-02-05 11:17
根據(jù)NCBI上GenBank的豬類泛素蛋白修飾分子1(SUMO1)基因堿基序列(NM001112676.1),設(shè)計(jì)編碼區(qū)全長上、下游引物,成功克隆了豬SUMO1基因完整的編碼區(qū)序列。經(jīng)生物信息學(xué)軟件分析發(fā)現(xiàn)豬SUMO1基因的蛋白質(zhì)編碼區(qū)(CDS)全長306 bp,編碼101個(gè)氨基酸,SUMO1的蛋白質(zhì)氨基酸序列在物種間高度保守。SUMO1基因在豬心、肝、脾、肺、腎、小腸及肌肉組織中均有表達(dá),且在肺部表達(dá)較高。豬肺炎支原體感染原代豬肺泡巨噬細(xì)胞后SUMO1的mRNA表達(dá)水平顯著升高。參與調(diào)控炎癥反應(yīng)的基因,如TLR2、P65和RXRα均存在潛在的SUMO化修飾位點(diǎn),并且豬肺炎支原體感染后它們的mRNA表達(dá)水平極顯著升高。
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.1.1 菌株及主要試劑
1.1.2 試驗(yàn)組織樣品
1.2 方法
1.2.1 原代豬肺泡巨噬細(xì)胞的分離及培養(yǎng)
1.2.2 豬肺炎支原體感染原代豬肺泡巨噬細(xì)胞
1.2.3 SUMO1基因的克隆
1.2.4 半定量PCR和實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測基因表達(dá)
1.2.5 試驗(yàn)結(jié)果分析及預(yù)測軟件
2 結(jié)果與分析
2.1 豬SUMO1基因編碼區(qū)的擴(kuò)增及克隆
2.2 豬SUMO1的蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析
2.2.1 SUMO1的氨基酸序列
2.2.2 SUMO1的磷酸化位點(diǎn)預(yù)測
2.2.3 SUMO1的結(jié)構(gòu)預(yù)測及分析
2.2.4 SUMO1的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
2.3 SUMO1在豬不同組織中的表達(dá)譜
2.4 豬支原體肺炎感染原代豬肺泡巨噬細(xì)胞后SUMO1的mRNA表達(dá)水平
2.5 調(diào)控炎癥反應(yīng)因子表達(dá)的上游調(diào)控基因SUMO化修飾位點(diǎn)預(yù)測
2.6 豬支原體肺炎感染原代豬肺泡巨噬細(xì)胞后相關(guān)調(diào)控基因的mRNA表達(dá)水平
3 討 論
本文編號(hào):3734877
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1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.1.1 菌株及主要試劑
1.1.2 試驗(yàn)組織樣品
1.2 方法
1.2.1 原代豬肺泡巨噬細(xì)胞的分離及培養(yǎng)
1.2.2 豬肺炎支原體感染原代豬肺泡巨噬細(xì)胞
1.2.3 SUMO1基因的克隆
1.2.4 半定量PCR和實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測基因表達(dá)
1.2.5 試驗(yàn)結(jié)果分析及預(yù)測軟件
2 結(jié)果與分析
2.1 豬SUMO1基因編碼區(qū)的擴(kuò)增及克隆
2.2 豬SUMO1的蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析
2.2.1 SUMO1的氨基酸序列
2.2.2 SUMO1的磷酸化位點(diǎn)預(yù)測
2.2.3 SUMO1的結(jié)構(gòu)預(yù)測及分析
2.2.4 SUMO1的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
2.3 SUMO1在豬不同組織中的表達(dá)譜
2.4 豬支原體肺炎感染原代豬肺泡巨噬細(xì)胞后SUMO1的mRNA表達(dá)水平
2.5 調(diào)控炎癥反應(yīng)因子表達(dá)的上游調(diào)控基因SUMO化修飾位點(diǎn)預(yù)測
2.6 豬支原體肺炎感染原代豬肺泡巨噬細(xì)胞后相關(guān)調(diào)控基因的mRNA表達(dá)水平
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