肉鴨胸肌肌纖維形態(tài)與肉色的遺傳分析
發(fā)布時間:2022-12-17 14:15
2019年,我國出欄肉鴨44.30億只,位居世界第一位,鴨肉是僅次于豬肉和雞肉的第三大肉類消費產(chǎn)品。當前我國居民食品消費需求已由數(shù)量轉(zhuǎn)入質(zhì)量,對畜產(chǎn)品肉質(zhì)的要求越來越高,高品質(zhì)優(yōu)質(zhì)禽肉具有巨大的市場需求,培育優(yōu)質(zhì)肉鴨品種是產(chǎn)業(yè)重大需求。骨骼肌是動物軀體最重要的組成部分,占體重的40%~50%。肌纖維形態(tài)和肉色與肉品質(zhì)密切相關,解析鴨肌纖維組織形態(tài)與肉色的遺傳基礎將為優(yōu)質(zhì)肉鴨新品種選育提供理論基礎,本研究精確測定了綠頭野鴨×北京鴨F2資源群體以及雙親的胸肌肌纖維形態(tài)及肉色表型,并結合群體全基因組遺傳變異數(shù)據(jù)進行全基因組關聯(lián)分析,鑒定肌纖維及肉色性狀的因果基因。首先對鴨胸肌肌纖維與肉色性狀的遺傳參數(shù)進行估計,試驗采集了479只綠頭野鴨×北京鴨F2資源群體、10只北京鴨和10只野鴨的胸肌肌纖維直徑、肌纖維密度、肌纖維面積三個指標。結果表明北京鴨肌纖維直徑、面積均大于野鴨和F2資源群體且差異顯著(P<0.05),肌纖維密度均小于野鴨和F2資源群體。F2代群體三個指標均值介于北京鴨和野鴨...
【文章頁數(shù)】:51 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
主要符號對照表
第一章 緒論
1.1 研究目的及意義
1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
1.2.1 肉品質(zhì)評價指標
1.2.2 肌纖維概述
1.2.3 肌纖維形態(tài)和肉色性狀與肉品質(zhì)的關系
1.2.4 影響肌纖維組織學形態(tài)的因素
1.2.5 全基因組關聯(lián)分析簡介
1.2.6 影響肉色性狀的基因定位工作
1.3 研究內(nèi)容與技術路線
1.3.1 研究內(nèi)容
1.3.2 技術路線
第二章 鴨胸肌肌纖維與肉色性狀的遺傳參數(shù)估計
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 試驗動物
2.2.2 飼養(yǎng)管理
2.2.3 樣品采集
2.2.4 肌肉石蠟切片制作
2.2.5 切片的顯微鏡觀察和數(shù)據(jù)采集
2.2.6 肉色性狀數(shù)據(jù)采集
2.2.7 統(tǒng)計分析
2.3 結果
2.3.1 F_2群體肌纖維與肉色表型
2.3.2 不同鴨群體胸肌肌纖維性狀比較
2.3.3 肌纖維與肉色性狀遺傳力估計
2.3.4 肌纖維與肉色性狀表型和遺傳相關
2.4 討論
2.4.1 肌纖維形態(tài)與肉色表型值
2.4.2 肌纖維與肉色性狀遺傳力估算
2.4.3 肌纖維與肉色性狀表型和遺傳相關
2.5 小結
第三章 鴨胸肌肌纖維直徑全基因組關聯(lián)分析及精細定位
3.1 前言
3.2 材料與方法
3.2.1 試驗動物
3.2.2 樣品采集
3.2.3 家禽外周血基因組DNA提取與質(zhì)量檢測
3.2.4 基因組重測序和數(shù)據(jù)質(zhì)量控制
3.2.5 全基因組水平變異位點的鑒定和分型
3.2.6 全基因組關聯(lián)分析
3.2.7 北京鴨和野鴨受選擇區(qū)間篩選
3.2.8 拓展單倍型分析
3.2.9 肌肉組織總RNA提取和質(zhì)量控制
3.2.10 RNA-seq文庫構建和測序
3.2.11 RNA-seq數(shù)據(jù)質(zhì)控和分析
3.3 結果
3.3.1 肌纖維直徑全基因組關聯(lián)分析
3.3.2 精細定位
3.4 討論
3.4.1 肌纖維直徑受單基因調(diào)控
3.4.2 F_2群體GWAS信號在馴化過程中受人工選擇
3.4.3 TASP1影響肌纖維直徑的通路假說
3.5 小結
第四章 鴨胸肌肉色性狀全基因組關聯(lián)分析及精細定位
4.1 前言
4.2 材料與方法
4.2.1 試驗動物
4.2.2 樣品采集
4.2.3 家禽外周血基因組DNA提取和質(zhì)量檢測
4.2.4 基因組重測序和數(shù)據(jù)質(zhì)量控制
4.2.5 全基因組水平變異位點的鑒定和分型
4.2.6 全基因組關聯(lián)分析
4.2.7 肌肉組織總RNA提取和質(zhì)量控制
4.2.8 RNA-seq文庫構建和測序
4.2.9 RNA-seq數(shù)據(jù)質(zhì)控和分析
4.3 結果
4.3.1 全基因組關聯(lián)分析
4.3.2 候選基因分析
4.4 討論
4.4.1 肉色性狀受單基因調(diào)控
4.4.2 GWAS信號區(qū)間候選基因分析
4.4.3 SELENOT基因影響肉色黃度b*
4.5 小結
第五章 結論
5.1 全文結論
5.2 有待進一步研究的問題
參考文獻
致謝
作者簡介
【參考文獻】:
期刊論文
[1]黃麻羽肉雞體重、體尺與肌肉品質(zhì)的相關性研究[J]. 楊鵬,王克文,趙潔. 飼料研究. 2019(05)
[2]金陵白鴨的肉質(zhì)特性研究[J]. 何宗亮,匡偉,姚遠,郗正林,伍冠鎖,楊碩. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2019(07)
[3]蘇太豬宰后72 h pH和肉色性狀的全基因組關聯(lián)分析[J]. 周李生,楊杰,劉先先,張志燕,楊斌,麻駿武. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2014(03)
[4]品種和部位對鴨肉肉質(zhì)的影響[J]. 王健,臧大存,左偉勇,展躍平,施帥,段修軍. 家畜生態(tài)學報. 2008(06)
[5]不同類型鴨肉用性能及嫩度差異的比較[J]. 王健,臧大存,左偉勇,展躍平,施帥,段修軍. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2008(09)
[6]鵝的肌肉品質(zhì)及其組織學分析[J]. 林樹茂,劉為民,景棟林,張綺瓊,郭金彪. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2006(15)
[7]北京油雞品種資源特性描述[J]. 趙桂蘋,陳繼蘭,文杰,鄭麥青,李小華. 中國家禽. 2005(23)
[8]優(yōu)質(zhì)雞肉質(zhì)的特點及其評定方法[J]. 劉景,李忠榮,馮玉蘭. 福建畜牧獸醫(yī). 2004(06)
[9]優(yōu)質(zhì)雞內(nèi)涵與選育[J]. 陳寬維,陳國宏,李慧芳,張學余,耿拓宇. 中國家禽. 2003(19)
[10]淘汰蛋雞與普通肉雞肌肉品質(zhì)的比較研究[J]. 徐幸蓮,周光宏,劉海斌. 食品工業(yè)科技. 2001(06)
博士論文
[1]基于GWAS的豬肉品質(zhì)性狀候選基因研究[D]. 李娜.中國農(nóng)業(yè)大學 2016
碩士論文
[1]硒通過miR-365-3p靶向SelT調(diào)控雞骨骼肌發(fā)育機理的研究[D]. 邢夢媛.東北農(nóng)業(yè)大學 2018
本文編號:3720074
【文章頁數(shù)】:51 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
主要符號對照表
第一章 緒論
1.1 研究目的及意義
1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
1.2.1 肉品質(zhì)評價指標
1.2.2 肌纖維概述
1.2.3 肌纖維形態(tài)和肉色性狀與肉品質(zhì)的關系
1.2.4 影響肌纖維組織學形態(tài)的因素
1.2.5 全基因組關聯(lián)分析簡介
1.2.6 影響肉色性狀的基因定位工作
1.3 研究內(nèi)容與技術路線
1.3.1 研究內(nèi)容
1.3.2 技術路線
第二章 鴨胸肌肌纖維與肉色性狀的遺傳參數(shù)估計
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 試驗動物
2.2.2 飼養(yǎng)管理
2.2.3 樣品采集
2.2.4 肌肉石蠟切片制作
2.2.5 切片的顯微鏡觀察和數(shù)據(jù)采集
2.2.6 肉色性狀數(shù)據(jù)采集
2.2.7 統(tǒng)計分析
2.3 結果
2.3.1 F_2群體肌纖維與肉色表型
2.3.2 不同鴨群體胸肌肌纖維性狀比較
2.3.3 肌纖維與肉色性狀遺傳力估計
2.3.4 肌纖維與肉色性狀表型和遺傳相關
2.4 討論
2.4.1 肌纖維形態(tài)與肉色表型值
2.4.2 肌纖維與肉色性狀遺傳力估算
2.4.3 肌纖維與肉色性狀表型和遺傳相關
2.5 小結
第三章 鴨胸肌肌纖維直徑全基因組關聯(lián)分析及精細定位
3.1 前言
3.2 材料與方法
3.2.1 試驗動物
3.2.2 樣品采集
3.2.3 家禽外周血基因組DNA提取與質(zhì)量檢測
3.2.4 基因組重測序和數(shù)據(jù)質(zhì)量控制
3.2.5 全基因組水平變異位點的鑒定和分型
3.2.6 全基因組關聯(lián)分析
3.2.7 北京鴨和野鴨受選擇區(qū)間篩選
3.2.8 拓展單倍型分析
3.2.9 肌肉組織總RNA提取和質(zhì)量控制
3.2.10 RNA-seq文庫構建和測序
3.2.11 RNA-seq數(shù)據(jù)質(zhì)控和分析
3.3 結果
3.3.1 肌纖維直徑全基因組關聯(lián)分析
3.3.2 精細定位
3.4 討論
3.4.1 肌纖維直徑受單基因調(diào)控
3.4.2 F_2群體GWAS信號在馴化過程中受人工選擇
3.4.3 TASP1影響肌纖維直徑的通路假說
3.5 小結
第四章 鴨胸肌肉色性狀全基因組關聯(lián)分析及精細定位
4.1 前言
4.2 材料與方法
4.2.1 試驗動物
4.2.2 樣品采集
4.2.3 家禽外周血基因組DNA提取和質(zhì)量檢測
4.2.4 基因組重測序和數(shù)據(jù)質(zhì)量控制
4.2.5 全基因組水平變異位點的鑒定和分型
4.2.6 全基因組關聯(lián)分析
4.2.7 肌肉組織總RNA提取和質(zhì)量控制
4.2.8 RNA-seq文庫構建和測序
4.2.9 RNA-seq數(shù)據(jù)質(zhì)控和分析
4.3 結果
4.3.1 全基因組關聯(lián)分析
4.3.2 候選基因分析
4.4 討論
4.4.1 肉色性狀受單基因調(diào)控
4.4.2 GWAS信號區(qū)間候選基因分析
4.4.3 SELENOT基因影響肉色黃度b*
4.5 小結
第五章 結論
5.1 全文結論
5.2 有待進一步研究的問題
參考文獻
致謝
作者簡介
【參考文獻】:
期刊論文
[1]黃麻羽肉雞體重、體尺與肌肉品質(zhì)的相關性研究[J]. 楊鵬,王克文,趙潔. 飼料研究. 2019(05)
[2]金陵白鴨的肉質(zhì)特性研究[J]. 何宗亮,匡偉,姚遠,郗正林,伍冠鎖,楊碩. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2019(07)
[3]蘇太豬宰后72 h pH和肉色性狀的全基因組關聯(lián)分析[J]. 周李生,楊杰,劉先先,張志燕,楊斌,麻駿武. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2014(03)
[4]品種和部位對鴨肉肉質(zhì)的影響[J]. 王健,臧大存,左偉勇,展躍平,施帥,段修軍. 家畜生態(tài)學報. 2008(06)
[5]不同類型鴨肉用性能及嫩度差異的比較[J]. 王健,臧大存,左偉勇,展躍平,施帥,段修軍. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2008(09)
[6]鵝的肌肉品質(zhì)及其組織學分析[J]. 林樹茂,劉為民,景棟林,張綺瓊,郭金彪. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2006(15)
[7]北京油雞品種資源特性描述[J]. 趙桂蘋,陳繼蘭,文杰,鄭麥青,李小華. 中國家禽. 2005(23)
[8]優(yōu)質(zhì)雞肉質(zhì)的特點及其評定方法[J]. 劉景,李忠榮,馮玉蘭. 福建畜牧獸醫(yī). 2004(06)
[9]優(yōu)質(zhì)雞內(nèi)涵與選育[J]. 陳寬維,陳國宏,李慧芳,張學余,耿拓宇. 中國家禽. 2003(19)
[10]淘汰蛋雞與普通肉雞肌肉品質(zhì)的比較研究[J]. 徐幸蓮,周光宏,劉海斌. 食品工業(yè)科技. 2001(06)
博士論文
[1]基于GWAS的豬肉品質(zhì)性狀候選基因研究[D]. 李娜.中國農(nóng)業(yè)大學 2016
碩士論文
[1]硒通過miR-365-3p靶向SelT調(diào)控雞骨骼肌發(fā)育機理的研究[D]. 邢夢媛.東北農(nóng)業(yè)大學 2018
本文編號:3720074
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