利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究北京油雞肌肉發(fā)育和肌內(nèi)脂肪沉積的分子機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2022-12-07 00:42
肌肉發(fā)育狀況直接影響畜禽生產(chǎn)效率,肌內(nèi)脂肪(IMF)含量是影響肉品質(zhì)的重要因素。本研究采用絕對(duì)和相對(duì)定量(iTRAQ)蛋白質(zhì)組技術(shù)檢測北京油雞(BJY)整個(gè)生長期胸肌中蛋白質(zhì)表達(dá)譜,對(duì)肉雞不同發(fā)育階段肌肉發(fā)育和肌內(nèi)脂肪代謝的分子機(jī)制進(jìn)行深入研究。本試驗(yàn)包括三部分內(nèi)容: 試驗(yàn)一:利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)篩選北京油雞胸肌組織中四個(gè)生長階段的差異表達(dá)蛋白。選用1日齡北京油雞40只,隨機(jī)分為4組,分別在1日齡(出雛)、56日齡(快速生長期)、98日齡(上市日齡)、140日齡(性成熟期)屠宰一組,提取雞胸肌的總蛋白,構(gòu)建不同日齡的蛋白混合池并進(jìn)行iTRAQ檢測。結(jié)果表明:1)鑒定到517個(gè)蛋白,可定量的蛋白494個(gè),210個(gè)顯著下調(diào),210個(gè)顯著上調(diào)。2)通過分層聚類分析,發(fā)現(xiàn)在56日齡和98日齡蛋白表達(dá)水平相近,140日齡次之,1日齡最遠(yuǎn);1日齡蛋白質(zhì)表達(dá)水平與其他三個(gè)時(shí)期差異很大。 試驗(yàn)二:北京油雞肌肉發(fā)育相關(guān)的差異表達(dá)蛋白及分子機(jī)制研究。試驗(yàn)動(dòng)物同試驗(yàn)一。利用蛋白表達(dá)譜數(shù)據(jù)和屠體數(shù)據(jù),進(jìn)行生物信息學(xué)和關(guān)聯(lián)分析篩選肌肉發(fā)育相關(guān)的關(guān)鍵蛋白和信號(hào)通路,利用Western Blotting(...
【文章頁數(shù)】:110 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 肌肉生長和發(fā)育的研究進(jìn)展
1.1.1 骨骼肌發(fā)育的生物學(xué)過程
1.1.2 肌肉發(fā)育的研究進(jìn)展
1.2 肉雞肉品質(zhì)研究進(jìn)展
1.2.1 脂肪和脂肪酸的形成的生物學(xué)過程
1.2.2 肌內(nèi)脂肪與肉品質(zhì)
1.2.3 肌內(nèi)脂肪的研究進(jìn)展
1.2.4 肌肉發(fā)育和脂類代謝的調(diào)控通路
1.3 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在畜禽中的研究進(jìn)展
1.3.1 常用的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)
1.3.2 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在畜禽研究中的應(yīng)用
1.4 研究內(nèi)容以及目的意義
第二章 利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究北京油雞不同發(fā)育階段胸肌組織中蛋白表達(dá)譜
2.1 前言
2.2 材料和方法
2.2.1 試驗(yàn)材料和樣品采集
2.2.2 主要儀器、試劑與配制
2.2.3 實(shí)驗(yàn)方法和流程
2.3 試驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3.1 蛋白提取
2.3.2 蛋白鑒定結(jié)果及理化性質(zhì)分析結(jié)果
2.3.3 鑒定蛋白的分層聚類結(jié)果
2.3.4 差異蛋白的篩選及GO分析結(jié)果
2.3.5 差異蛋白的KEGG通路富集分析
2.3.6 蛋白表達(dá)譜與差異蛋白分析
2.4 討論
2.4.1 iTRAQ技術(shù)的選擇
2.4.2 iTRAQ技術(shù)在家禽中利用的可靠性分析
2.4.3 BJY不同發(fā)育階段胸肌組織中蛋白的發(fā)育狀況
2.5 小結(jié)
第三章 北京油雞肌肉發(fā)育相關(guān)的差異表達(dá)蛋白及分子機(jī)制研究
3.1 前言
3.2 材料和方法
3.2.1 試驗(yàn)材料和樣品采集
3.2.2 主要儀器、試劑與配制
3.2.3 試驗(yàn)方法與流程
3.2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 不同階段肌肉發(fā)育規(guī)律
3.3.2 生物信息學(xué)手段篩選肌肉發(fā)育相關(guān)的蛋白
3.3.3 關(guān)聯(lián)分析篩選肌肉發(fā)育相關(guān)的鑒定
3.3.4 不同階段差異蛋白的GO富集分析
3.3.5 不同階段的差異蛋白KEGG通路富集分析
3.3.6 肌肉發(fā)育相關(guān)的功能蛋白的驗(yàn)證
3.3.7 BJY胸肌肌肉發(fā)育的分子調(diào)控網(wǎng)路
3.4 討論
3.5 小結(jié)
第四章 北京油雞肌內(nèi)脂肪沉積相關(guān)的差異表達(dá)蛋白及分子機(jī)制研究
4.1 前言
4.2 材料和方法
4.2.1 試驗(yàn)材料和樣品采集
4.2.2 主要儀器、試劑與配制
4.2.3 試驗(yàn)方法與流程
4.2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 脂肪在BJY不同階段不同組織的沉積規(guī)律
4.3.2 不同階段胸肌組織中的脂肪組成分析
4.3.3 不同階段胸肌組織中脂肪酸組成成分分析
4.3.4 生物信息學(xué)篩選與脂類代謝相關(guān)的蛋白
4.3.5 關(guān)聯(lián)分析鑒定的與脂肪代謝相關(guān)的蛋白
4.3.6 BJY不同發(fā)育階段胸肌組織中與脂肪代謝顯著相關(guān)的通路的鑒定分析
4.3.7 脂肪代謝相關(guān)的功能蛋白的驗(yàn)證
4.3.8 脂肪代謝相關(guān)的Pathway的驗(yàn)證
4.4 討論
4.4.1 基于iTRAQ數(shù)據(jù)結(jié)果對(duì)胸肌脂類代謝相關(guān)蛋白和通路的篩選
4.4.2 胸肌不同發(fā)育階段的脂肪沉積的機(jī)制
4.5 小結(jié)
全文結(jié)論
1 主要結(jié)論
2 創(chuàng)新點(diǎn)
3 需要進(jìn)一步解決的問題
參考文獻(xiàn)
附表
致謝
作者簡歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]北京油雞體脂分布及沉積規(guī)律研究[J]. 付睿琦,趙桂蘋,劉冉冉,鄭麥青,陳繼蘭,文杰. 動(dòng)物營養(yǎng)學(xué)報(bào). 2013(07)
[2]耐力運(yùn)動(dòng)促進(jìn)骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞線粒體能量代謝及其對(duì)成肌分化的影響[J]. 薄海,王遜,陳啟祥,吉力立,張勇. 中國運(yùn)動(dòng)醫(yī)學(xué)雜志. 2012(05)
[3]蛋白組學(xué)技術(shù)研究有氧運(yùn)動(dòng)影響C57BL/6小鼠骨骼肌代謝系列報(bào)道之一——有氧運(yùn)動(dòng)對(duì)胰島素抵抗小鼠骨骼肌脂代謝相關(guān)蛋白的影響[J]. 尹苗苗,牛燕媚,袁海瑞,劉效磊,褚曉蕾,黃雯,傅力. 中國運(yùn)動(dòng)醫(yī)學(xué)雜志. 2011(07)
[4]衛(wèi)星細(xì)胞與肌肉肥大關(guān)系及成肌因子的運(yùn)動(dòng)性調(diào)控[J]. 王今越,王小虹,陳民盛,楊海東. 中國組織工程研究與臨床康復(fù). 2010(28)
[5]氯仿/甲醇勻漿測定肝臟甘油三酯含量[J]. 曾濤,謝克勤,張翠麗,于麗華,朱振平. 衛(wèi)生研究. 2008(05)
[6]雞H-FABP和A-FABP基因表達(dá)與肌內(nèi)脂肪含量相關(guān)研究[J]. 李文娟,李宏賓,文杰,陳繼蘭,趙桂蘋,鄭麥青. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2006(05)
[7]北京油雞品種資源特性描述[J]. 趙桂蘋,陳繼蘭,文杰,鄭麥青,李小華. 中國家禽. 2005(23)
[8]利用基因芯片技術(shù)研究兩品種雞脂肪組織差異表達(dá)基因[J]. 王洪寶,王啟貴,李輝. 生物工程學(xué)報(bào). 2005(06)
[9]雞肉肌苷酸和肌內(nèi)脂肪沉積規(guī)律研究[J]. 陳繼蘭,文杰,王述柏,趙桂蘋,鄭麥青,李小華. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2005(08)
[10]不同雞種肌肉肌苷酸和脂肪酸含量的比較[J]. 李慧芳,陳寬維. 揚(yáng)州大學(xué)學(xué)報(bào). 2004(03)
博士論文
[1]肉雞肌內(nèi)脂肪形成的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及相關(guān)基因研究[D]. 崔煥先.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
[2]雞TLRs基因的表達(dá)調(diào)控與抗沙門氏菌的機(jī)制研究[D]. 茍鐘勇.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[3]優(yōu)質(zhì)雞肌內(nèi)脂肪代謝調(diào)控及其與肉質(zhì)性狀關(guān)系的研究[D]. 楊燁.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2005
[4]共軛亞油酸對(duì)肉雞肉品質(zhì)的影響及其作用機(jī)制的研究[D]. 張廣民.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2006
[5]振動(dòng)訓(xùn)練對(duì)大鼠骨骼肌運(yùn)動(dòng)能力的影響及其機(jī)制探討[D]. 史仍飛.第二軍醫(yī)大學(xué) 2007
[6]雞肉品質(zhì)相關(guān)脂肪代謝功能基因的篩選及營養(yǎng)調(diào)控研究[D]. 李文娟.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
[7]脂肪型和瘦肉型豬肌肉生長和脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達(dá)分析和分子網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建[D]. 李明洲.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[8]煙酸對(duì)雞脂肪代謝和肉品質(zhì)的影響及作用機(jī)理[D]. 蔣瑞瑞.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
[9]肉雞肌纖維特性與肉質(zhì)性狀的形成規(guī)律及日糧營養(yǎng)調(diào)控研究[D]. 趙景鵬.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
碩士論文
[1]后肢懸吊大鼠骨骼肌廢用性肌萎縮的蛋白組學(xué)研究[D]. 任媛媛.北京體育大學(xué) 2010
本文編號(hào):3711921
【文章頁數(shù)】:110 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 肌肉生長和發(fā)育的研究進(jìn)展
1.1.1 骨骼肌發(fā)育的生物學(xué)過程
1.1.2 肌肉發(fā)育的研究進(jìn)展
1.2 肉雞肉品質(zhì)研究進(jìn)展
1.2.1 脂肪和脂肪酸的形成的生物學(xué)過程
1.2.2 肌內(nèi)脂肪與肉品質(zhì)
1.2.3 肌內(nèi)脂肪的研究進(jìn)展
1.2.4 肌肉發(fā)育和脂類代謝的調(diào)控通路
1.3 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在畜禽中的研究進(jìn)展
1.3.1 常用的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)
1.3.2 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在畜禽研究中的應(yīng)用
1.4 研究內(nèi)容以及目的意義
第二章 利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究北京油雞不同發(fā)育階段胸肌組織中蛋白表達(dá)譜
2.1 前言
2.2 材料和方法
2.2.1 試驗(yàn)材料和樣品采集
2.2.2 主要儀器、試劑與配制
2.2.3 實(shí)驗(yàn)方法和流程
2.3 試驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3.1 蛋白提取
2.3.2 蛋白鑒定結(jié)果及理化性質(zhì)分析結(jié)果
2.3.3 鑒定蛋白的分層聚類結(jié)果
2.3.4 差異蛋白的篩選及GO分析結(jié)果
2.3.5 差異蛋白的KEGG通路富集分析
2.3.6 蛋白表達(dá)譜與差異蛋白分析
2.4 討論
2.4.1 iTRAQ技術(shù)的選擇
2.4.2 iTRAQ技術(shù)在家禽中利用的可靠性分析
2.4.3 BJY不同發(fā)育階段胸肌組織中蛋白的發(fā)育狀況
2.5 小結(jié)
第三章 北京油雞肌肉發(fā)育相關(guān)的差異表達(dá)蛋白及分子機(jī)制研究
3.1 前言
3.2 材料和方法
3.2.1 試驗(yàn)材料和樣品采集
3.2.2 主要儀器、試劑與配制
3.2.3 試驗(yàn)方法與流程
3.2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 不同階段肌肉發(fā)育規(guī)律
3.3.2 生物信息學(xué)手段篩選肌肉發(fā)育相關(guān)的蛋白
3.3.3 關(guān)聯(lián)分析篩選肌肉發(fā)育相關(guān)的鑒定
3.3.4 不同階段差異蛋白的GO富集分析
3.3.5 不同階段的差異蛋白KEGG通路富集分析
3.3.6 肌肉發(fā)育相關(guān)的功能蛋白的驗(yàn)證
3.3.7 BJY胸肌肌肉發(fā)育的分子調(diào)控網(wǎng)路
3.4 討論
3.5 小結(jié)
第四章 北京油雞肌內(nèi)脂肪沉積相關(guān)的差異表達(dá)蛋白及分子機(jī)制研究
4.1 前言
4.2 材料和方法
4.2.1 試驗(yàn)材料和樣品采集
4.2.2 主要儀器、試劑與配制
4.2.3 試驗(yàn)方法與流程
4.2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 脂肪在BJY不同階段不同組織的沉積規(guī)律
4.3.2 不同階段胸肌組織中的脂肪組成分析
4.3.3 不同階段胸肌組織中脂肪酸組成成分分析
4.3.4 生物信息學(xué)篩選與脂類代謝相關(guān)的蛋白
4.3.5 關(guān)聯(lián)分析鑒定的與脂肪代謝相關(guān)的蛋白
4.3.6 BJY不同發(fā)育階段胸肌組織中與脂肪代謝顯著相關(guān)的通路的鑒定分析
4.3.7 脂肪代謝相關(guān)的功能蛋白的驗(yàn)證
4.3.8 脂肪代謝相關(guān)的Pathway的驗(yàn)證
4.4 討論
4.4.1 基于iTRAQ數(shù)據(jù)結(jié)果對(duì)胸肌脂類代謝相關(guān)蛋白和通路的篩選
4.4.2 胸肌不同發(fā)育階段的脂肪沉積的機(jī)制
4.5 小結(jié)
全文結(jié)論
1 主要結(jié)論
2 創(chuàng)新點(diǎn)
3 需要進(jìn)一步解決的問題
參考文獻(xiàn)
附表
致謝
作者簡歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]北京油雞體脂分布及沉積規(guī)律研究[J]. 付睿琦,趙桂蘋,劉冉冉,鄭麥青,陳繼蘭,文杰. 動(dòng)物營養(yǎng)學(xué)報(bào). 2013(07)
[2]耐力運(yùn)動(dòng)促進(jìn)骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞線粒體能量代謝及其對(duì)成肌分化的影響[J]. 薄海,王遜,陳啟祥,吉力立,張勇. 中國運(yùn)動(dòng)醫(yī)學(xué)雜志. 2012(05)
[3]蛋白組學(xué)技術(shù)研究有氧運(yùn)動(dòng)影響C57BL/6小鼠骨骼肌代謝系列報(bào)道之一——有氧運(yùn)動(dòng)對(duì)胰島素抵抗小鼠骨骼肌脂代謝相關(guān)蛋白的影響[J]. 尹苗苗,牛燕媚,袁海瑞,劉效磊,褚曉蕾,黃雯,傅力. 中國運(yùn)動(dòng)醫(yī)學(xué)雜志. 2011(07)
[4]衛(wèi)星細(xì)胞與肌肉肥大關(guān)系及成肌因子的運(yùn)動(dòng)性調(diào)控[J]. 王今越,王小虹,陳民盛,楊海東. 中國組織工程研究與臨床康復(fù). 2010(28)
[5]氯仿/甲醇勻漿測定肝臟甘油三酯含量[J]. 曾濤,謝克勤,張翠麗,于麗華,朱振平. 衛(wèi)生研究. 2008(05)
[6]雞H-FABP和A-FABP基因表達(dá)與肌內(nèi)脂肪含量相關(guān)研究[J]. 李文娟,李宏賓,文杰,陳繼蘭,趙桂蘋,鄭麥青. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2006(05)
[7]北京油雞品種資源特性描述[J]. 趙桂蘋,陳繼蘭,文杰,鄭麥青,李小華. 中國家禽. 2005(23)
[8]利用基因芯片技術(shù)研究兩品種雞脂肪組織差異表達(dá)基因[J]. 王洪寶,王啟貴,李輝. 生物工程學(xué)報(bào). 2005(06)
[9]雞肉肌苷酸和肌內(nèi)脂肪沉積規(guī)律研究[J]. 陳繼蘭,文杰,王述柏,趙桂蘋,鄭麥青,李小華. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2005(08)
[10]不同雞種肌肉肌苷酸和脂肪酸含量的比較[J]. 李慧芳,陳寬維. 揚(yáng)州大學(xué)學(xué)報(bào). 2004(03)
博士論文
[1]肉雞肌內(nèi)脂肪形成的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及相關(guān)基因研究[D]. 崔煥先.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
[2]雞TLRs基因的表達(dá)調(diào)控與抗沙門氏菌的機(jī)制研究[D]. 茍鐘勇.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[3]優(yōu)質(zhì)雞肌內(nèi)脂肪代謝調(diào)控及其與肉質(zhì)性狀關(guān)系的研究[D]. 楊燁.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2005
[4]共軛亞油酸對(duì)肉雞肉品質(zhì)的影響及其作用機(jī)制的研究[D]. 張廣民.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2006
[5]振動(dòng)訓(xùn)練對(duì)大鼠骨骼肌運(yùn)動(dòng)能力的影響及其機(jī)制探討[D]. 史仍飛.第二軍醫(yī)大學(xué) 2007
[6]雞肉品質(zhì)相關(guān)脂肪代謝功能基因的篩選及營養(yǎng)調(diào)控研究[D]. 李文娟.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
[7]脂肪型和瘦肉型豬肌肉生長和脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達(dá)分析和分子網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建[D]. 李明洲.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[8]煙酸對(duì)雞脂肪代謝和肉品質(zhì)的影響及作用機(jī)理[D]. 蔣瑞瑞.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
[9]肉雞肌纖維特性與肉質(zhì)性狀的形成規(guī)律及日糧營養(yǎng)調(diào)控研究[D]. 趙景鵬.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
碩士論文
[1]后肢懸吊大鼠骨骼肌廢用性肌萎縮的蛋白組學(xué)研究[D]. 任媛媛.北京體育大學(xué) 2010
本文編號(hào):3711921
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3711921.html
最近更新
教材專著