主要組織相容性復(fù)合物（MHC）是一種高度多態(tài)性的基因組,編碼脊椎動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)的免疫球蛋白樣受體,其表達(dá)產(chǎn)物分布在各種細(xì)胞的表面。它被稱為MHC分子,在人體免疫系統(tǒng)中起著非常重要的抗原呈遞作用。它不僅與移植排斥有關(guān),而且與動(dòng)物的某些經(jīng)濟(jì)特征密切相關(guān)。MHC抗原參與機(jī)體的免疫反應(yīng),在機(jī)體的免疫反應(yīng)調(diào)節(jié),抗原識(shí)別和呈遞中發(fā)揮重要作用。同時(shí),MHC的遺傳背景和不同個(gè)體之間的多樣性水平的差異可導(dǎo)致個(gè)體對(duì)疾病的抗性和易感性的差異。因此,MHC作為抗病性和易感性的候選基因已成為遺傳育種研究的熱點(diǎn),并且它也越來越受到生態(tài)學(xué)家群體遺傳學(xué)家和動(dòng)物遺傳學(xué)育種者的關(guān)注。本研究以家兔為實(shí)驗(yàn)材料,為更加完整的了解MHCⅡDQ基因的結(jié)構(gòu)和功能,采用RACE技術(shù),獲得了家兔MHCⅡDQ基因的完整cDNA序列,并進(jìn)行了克隆測(cè)序,采用生物信息學(xué)技術(shù),分析并預(yù)測(cè)了基因的結(jié)構(gòu)和功能。主要研究結(jié)果如下:1.使用RACE技術(shù)克隆獲得了家兔MHCⅡDQ基因的完整cDNA序列,采用生物信息學(xué)技術(shù),分析和預(yù)測(cè)基因的結(jié)構(gòu)和功能。MHCⅡDQ基因cDNA全長(zhǎng)1148bp（GenBank登錄號(hào):XM₀02714510.3... 

【文章頁數(shù)】：59 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

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中文摘要
Abstract
1 引言
    1.1 家兔及其研究進(jìn)展
    1.2 兔類免疫系統(tǒng)
        1.2.1 免疫器官
        1.2.2 免疫細(xì)胞
        1.2.3 體液免疫因子
        1.2.4 MHC基因
    1.3 試驗(yàn)技術(shù)
        1.3.1 cDNA末端快速克隆技術(shù)
        1.3.2 巢式 PCR 和降落 PCR
        1.3.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
    1.4 本研究的目的和意義
2 材料與方法
    2.1 試驗(yàn)材料
        2.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物及樣品采集處理
        2.1.2 主要儀器
        2.1.3 網(wǎng)絡(luò)資源和軟件
        2.1.4 主要試劑的配制
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 MHC Ⅱ DQ基因的c DNA全長(zhǎng)擴(kuò)增
        2.2.2 MHC Ⅱ DQ基因c DNA全長(zhǎng)測(cè)序
        2.2.3 生物信息學(xué)分析
        2.2.4 熒光定量PCR的檢測(cè)分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 MHC Ⅱ DQ基因的CDNA全長(zhǎng)的克隆
        3.1.1 總RNA的提取與質(zhì)量檢測(cè)
        3.1.2 5 '反應(yīng)RACE、3'RACE和中間片段的PCR擴(kuò)增
        3.1.3 菌液PCR結(jié)果
    3.2 測(cè)序結(jié)果分析
        3.2.1 序列拼接
    3.3 生物信息學(xué)分析
        3.3.1 ORF預(yù)測(cè)
        3.3.2 蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析
        3.3.3 蛋白質(zhì)疏水性與二級(jí)結(jié)構(gòu)
        3.3.4 蛋白質(zhì)跨膜區(qū)和亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)
        3.3.5 蛋白質(zhì)信號(hào)肽預(yù)測(cè)
        3.3.6 蛋白質(zhì)糖基化和磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)
        3.3.7 蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        3.3.8 蛋白質(zhì)氨基酸分子進(jìn)化樹
    3.4 家兔MHC Ⅱ DQ基因的表達(dá)檢測(cè)分析
        3.4.1 熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線和熔解曲線繪制
        3.4.2 家兔MHC Ⅱ DQ基因的組織表達(dá)譜分析
4 討論
    4.1 家兔MHC ⅡDQ的生物信息學(xué)分析
    4.2 MHC Ⅱ DQ基因mRNA的組織表達(dá)差異
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[3]應(yīng)用于染色體步移的PCR擴(kuò)增技術(shù)的研究進(jìn)展[J]. 劉博,蘇喬,湯敏謙,袁曉東,安利佳.  遺傳. 2006(05)
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碩士論文
[1]草魚MHC II B和組織蛋白酶D基因的克隆、表達(dá)及多態(tài)性分析[D]. 董忠典.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]草魚β2m基因的分子克隆與MHC class Ⅰ多態(tài)性分析及其重組蛋白的鑒定[D]. 楊天耀.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005



本文編號(hào)：3707410