山東省部分地區(qū)鴨養(yǎng)殖屠宰鏈中產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離鑒定及基因分型
發(fā)布時(shí)間:2022-11-06 18:46
產(chǎn)氣莢膜梭菌(Clostridium perfringens)是一種重要的人畜共患病原微生物,不僅可以導(dǎo)致家禽的壞死性腸炎(NE),給養(yǎng)殖業(yè)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失,還能夠引起人食物中毒等消化道疾病,給人的健康帶來(lái)一定的威脅。隨著抗生素的廣泛使用,產(chǎn)氣莢膜梭菌對(duì)抗生素的耐藥性不斷增強(qiáng),多重耐藥現(xiàn)象明顯,嚴(yán)重影響了抗生素的臨床治療效果。家禽是產(chǎn)氣莢膜梭菌的主要宿主,其屠宰加工過(guò)程中往往會(huì)被產(chǎn)氣莢膜梭菌污染。雖然各國(guó)對(duì)不同宿主及食品中產(chǎn)氣莢膜梭菌的流行狀況開(kāi)展了較為系統(tǒng)的研究,但關(guān)于家禽養(yǎng)殖屠宰鏈中產(chǎn)氣莢膜梭菌的報(bào)道還相對(duì)匱乏,中國(guó)是世界上最大的肉鴨生產(chǎn)國(guó),山東是養(yǎng)鴨大省,因此對(duì)山東地區(qū)鴨養(yǎng)殖及屠宰過(guò)程中產(chǎn)氣莢膜梭菌的流行情況、血清型分布、耐藥性以及遺傳演化規(guī)律進(jìn)行研究,不僅可以填補(bǔ)鴨源產(chǎn)氣莢膜梭菌流行情況研究的空缺,為養(yǎng)殖場(chǎng)合理使用抗生素提供理論依據(jù),同時(shí)對(duì)評(píng)估公共衛(wèi)生和食品安全也具有重要意義。2018年12月至2019年6月,從濰坊地區(qū)某養(yǎng)殖屠宰一體化公司的肉鴨養(yǎng)殖屠宰鏈以及泰安、聊城、濰坊地區(qū)四個(gè)鴨場(chǎng)的鴨養(yǎng)殖階段采集樣品共計(jì)939份,經(jīng)選擇培養(yǎng)基分離培養(yǎng)后,用PCR擴(kuò)增鑒定產(chǎn)氣莢膜梭菌8種...
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
符號(hào)說(shuō)明
中文摘要
Abstract
1 前言
1.1 產(chǎn)氣莢膜梭菌簡(jiǎn)介
1.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌的血清分型
1.3 產(chǎn)氣莢膜梭菌的毒力基因
1.4 產(chǎn)氣莢膜梭菌的流行情況
1.4.1 產(chǎn)氣莢膜梭菌在家禽養(yǎng)殖場(chǎng)中的流行情況
1.4.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌在禽產(chǎn)品中的流行情況
1.5 禽源產(chǎn)氣莢膜梭菌耐藥研究現(xiàn)狀
1.6 多位點(diǎn)序列分型
1.7 研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 樣品
2.1.2 菌株
2.1.3 培養(yǎng)基
2.1.4 主要試劑及溶液配制
2.1.5 抗生素
2.1.6 主要儀器
2.2 方法
2.2.1 樣品處理
2.2.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離與鑒定
2.2.3 菌種保存及DNA提取
2.2.4 血清型鑒定
2.2.5 毒力基因檢測(cè)
2.2.6 藥敏試驗(yàn)
2.2.7 多位點(diǎn)序列分型(MLST)
2.2.7.1 管家基因引物合成
2.2.7.2 管家基因的PCR擴(kuò)增及測(cè)序
2.2.7.3 MLST分型及系統(tǒng)發(fā)育分析
2.2.8 統(tǒng)計(jì)分析和辛普森多樣性指數(shù)
3 結(jié)果
3.1 產(chǎn)氣莢膜梭菌的鑒定結(jié)果
3.1.1 菌落形態(tài)
3.1.2 鏡檢結(jié)果
3.1.3 產(chǎn)氣莢膜梭菌PCR鑒定結(jié)果
3.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離結(jié)果
3.2.1 鴨養(yǎng)殖場(chǎng)中產(chǎn)氣莢膜梭菌的陽(yáng)性率
3.2.2 肉鴨屠宰環(huán)節(jié)中產(chǎn)氣莢膜梭菌的陽(yáng)性率
3.3 血清型分型結(jié)果
3.4 毒力基因檢測(cè)結(jié)果
3.4.1 產(chǎn)氣莢膜梭菌毒力基因PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.4.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌毒力基因流行情況
3.5 產(chǎn)氣莢膜梭菌藥敏試驗(yàn)結(jié)果
3.5.1 產(chǎn)氣莢膜梭菌耐藥率統(tǒng)計(jì)
3.5.1.1 養(yǎng)殖場(chǎng)分離株的耐藥率
3.5.1.2 屠宰場(chǎng)分離株的耐藥率
3.5.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌多重耐藥情況
3.6 多位點(diǎn)序列分型(MLST)
3.6.1 管家基因PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.6.2 MLST序列型(ST)
3.6.3 MLST最小生成樹(shù)
3.6.3.1 鴨養(yǎng)殖場(chǎng)分離株的最小生成樹(shù)
3.6.3.2 從養(yǎng)殖到屠宰生產(chǎn)鏈中分離株的最小生成樹(shù)
3.7 產(chǎn)氣莢膜梭菌的系統(tǒng)進(jìn)化結(jié)果
3.7.1 鴨養(yǎng)殖場(chǎng)分離株的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
3.7.2 從養(yǎng)殖到屠宰生產(chǎn)鏈中分離株的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
4 討論
4.1 產(chǎn)氣莢膜梭菌流行情況分析
4.1.1 養(yǎng)殖場(chǎng)中產(chǎn)氣莢膜梭菌的流行情況分析
4.1.2 屠宰場(chǎng)中產(chǎn)氣莢膜梭菌的流行情況分析
4.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌毒力基因分析
4.3 產(chǎn)氣莢膜梭菌耐藥情況分析
4.4 產(chǎn)氣莢膜梭菌MLST分型
4.4.1 養(yǎng)殖場(chǎng)中產(chǎn)氣莢膜梭菌的MLST分析
4.4.2 肉鴨從養(yǎng)殖到屠宰過(guò)程中產(chǎn)氣莢膜梭菌的MLST分析
4.5 產(chǎn)氣莢膜梭菌系統(tǒng)發(fā)育分析
5 結(jié)論
6 創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]北京市某職業(yè)學(xué)校一起食源性疾病暴發(fā)的調(diào)查[J]. 鄭蘭紫,馮月明,周?chē)?guó)營(yíng),王化勇. 中國(guó)公共衛(wèi)生管理. 2018(01)
[2]澳門(mén)地區(qū)雞源產(chǎn)氣莢膜梭菌的污染情況及基因分型[J]. 陸宗浩,黃慧怡,梁曉君,吳志君,李婉芬. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2018(03)
[3]鄭州市熟肉制品中產(chǎn)氣莢膜梭菌污染狀況調(diào)查[J]. 王小慧,魏法山,趙莉君,牛會(huì)敏,李苗云,柳艷霞,趙改名. 中國(guó)食品衛(wèi)生雜志. 2017(02)
[4]冷鮮雞產(chǎn)氣莢膜梭菌及其毒素的潛在危害分析[J]. 馬壯,彭新宇,葉得河,高彪,袁明貴,尹燁華,徐志宏. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(08)
[5]一起由快餐盒飯引發(fā)的產(chǎn)氣莢膜梭菌食物中毒[J]. 劉秀峰,陳東宛,呂金昌,高彭,李永進(jìn). 中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2016(11)
[6]魏氏梭菌外毒素的研究進(jìn)展[J]. 許崇利. 河南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(01)
[7]陜西省部分地區(qū)雞源A型產(chǎn)氣莢膜梭菌分離株的藥敏試驗(yàn)[J]. 姜艷芬,紀(jì)文靜,許晗. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2015(10)
[8]不同地區(qū)雞源產(chǎn)氣莢膜梭菌的毒素型鑒定和藥敏試驗(yàn)[J]. 胡賀,覃宗華,王艷華,龔振興,劉保紅,殷昊,彭險(xiǎn)峰,馬雪婷,李祥瑞,蔡建平. 畜牧與獸醫(yī). 2015(10)
[9]SPF雞糞菌移植與發(fā)酵床飼養(yǎng)模式下肉雞生產(chǎn)性能和抗藥性研究[J]. 李運(yùn)喜,駱延波,宋敏訓(xùn),馮敏燕,林樹(shù)乾,劉軍偉,郭文龍,劉玉慶,劉煥奇. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(05)
[10]雞產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離鑒定及藥敏試驗(yàn)[J]. 艾地云,邵華斌,張騰飛,詹麗超,羅玲,張蓉蓉,汪宏才,王紅琳,羅青平,溫國(guó)元. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2014(06)
碩士論文
[1]山東省泰安市零售鴨產(chǎn)品中產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離鑒定、基因分型及耐藥性研究[D]. 劉煜.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]山東省泰安市不同來(lái)源的雞產(chǎn)氣莢膜梭菌分離鑒定、耐藥性及基因分型研究[D]. 張匯寧.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[3]廣州市冷鮮雞產(chǎn)氣莢膜梭菌的污染分析及netB菌株的致病性研究[D]. 馬壯.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]規(guī)模化雞場(chǎng)健康雞群產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離、鑒定及遺傳多樣性研究[D]. 鄭曉麗.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號(hào):3704028
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
符號(hào)說(shuō)明
中文摘要
Abstract
1 前言
1.1 產(chǎn)氣莢膜梭菌簡(jiǎn)介
1.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌的血清分型
1.3 產(chǎn)氣莢膜梭菌的毒力基因
1.4 產(chǎn)氣莢膜梭菌的流行情況
1.4.1 產(chǎn)氣莢膜梭菌在家禽養(yǎng)殖場(chǎng)中的流行情況
1.4.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌在禽產(chǎn)品中的流行情況
1.5 禽源產(chǎn)氣莢膜梭菌耐藥研究現(xiàn)狀
1.6 多位點(diǎn)序列分型
1.7 研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 樣品
2.1.2 菌株
2.1.3 培養(yǎng)基
2.1.4 主要試劑及溶液配制
2.1.5 抗生素
2.1.6 主要儀器
2.2 方法
2.2.1 樣品處理
2.2.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離與鑒定
2.2.3 菌種保存及DNA提取
2.2.4 血清型鑒定
2.2.5 毒力基因檢測(cè)
2.2.6 藥敏試驗(yàn)
2.2.7 多位點(diǎn)序列分型(MLST)
2.2.7.1 管家基因引物合成
2.2.7.2 管家基因的PCR擴(kuò)增及測(cè)序
2.2.7.3 MLST分型及系統(tǒng)發(fā)育分析
2.2.8 統(tǒng)計(jì)分析和辛普森多樣性指數(shù)
3 結(jié)果
3.1 產(chǎn)氣莢膜梭菌的鑒定結(jié)果
3.1.1 菌落形態(tài)
3.1.2 鏡檢結(jié)果
3.1.3 產(chǎn)氣莢膜梭菌PCR鑒定結(jié)果
3.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離結(jié)果
3.2.1 鴨養(yǎng)殖場(chǎng)中產(chǎn)氣莢膜梭菌的陽(yáng)性率
3.2.2 肉鴨屠宰環(huán)節(jié)中產(chǎn)氣莢膜梭菌的陽(yáng)性率
3.3 血清型分型結(jié)果
3.4 毒力基因檢測(cè)結(jié)果
3.4.1 產(chǎn)氣莢膜梭菌毒力基因PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.4.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌毒力基因流行情況
3.5 產(chǎn)氣莢膜梭菌藥敏試驗(yàn)結(jié)果
3.5.1 產(chǎn)氣莢膜梭菌耐藥率統(tǒng)計(jì)
3.5.1.1 養(yǎng)殖場(chǎng)分離株的耐藥率
3.5.1.2 屠宰場(chǎng)分離株的耐藥率
3.5.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌多重耐藥情況
3.6 多位點(diǎn)序列分型(MLST)
3.6.1 管家基因PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.6.2 MLST序列型(ST)
3.6.3 MLST最小生成樹(shù)
3.6.3.1 鴨養(yǎng)殖場(chǎng)分離株的最小生成樹(shù)
3.6.3.2 從養(yǎng)殖到屠宰生產(chǎn)鏈中分離株的最小生成樹(shù)
3.7 產(chǎn)氣莢膜梭菌的系統(tǒng)進(jìn)化結(jié)果
3.7.1 鴨養(yǎng)殖場(chǎng)分離株的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
3.7.2 從養(yǎng)殖到屠宰生產(chǎn)鏈中分離株的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
4 討論
4.1 產(chǎn)氣莢膜梭菌流行情況分析
4.1.1 養(yǎng)殖場(chǎng)中產(chǎn)氣莢膜梭菌的流行情況分析
4.1.2 屠宰場(chǎng)中產(chǎn)氣莢膜梭菌的流行情況分析
4.2 產(chǎn)氣莢膜梭菌毒力基因分析
4.3 產(chǎn)氣莢膜梭菌耐藥情況分析
4.4 產(chǎn)氣莢膜梭菌MLST分型
4.4.1 養(yǎng)殖場(chǎng)中產(chǎn)氣莢膜梭菌的MLST分析
4.4.2 肉鴨從養(yǎng)殖到屠宰過(guò)程中產(chǎn)氣莢膜梭菌的MLST分析
4.5 產(chǎn)氣莢膜梭菌系統(tǒng)發(fā)育分析
5 結(jié)論
6 創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]北京市某職業(yè)學(xué)校一起食源性疾病暴發(fā)的調(diào)查[J]. 鄭蘭紫,馮月明,周?chē)?guó)營(yíng),王化勇. 中國(guó)公共衛(wèi)生管理. 2018(01)
[2]澳門(mén)地區(qū)雞源產(chǎn)氣莢膜梭菌的污染情況及基因分型[J]. 陸宗浩,黃慧怡,梁曉君,吳志君,李婉芬. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2018(03)
[3]鄭州市熟肉制品中產(chǎn)氣莢膜梭菌污染狀況調(diào)查[J]. 王小慧,魏法山,趙莉君,牛會(huì)敏,李苗云,柳艷霞,趙改名. 中國(guó)食品衛(wèi)生雜志. 2017(02)
[4]冷鮮雞產(chǎn)氣莢膜梭菌及其毒素的潛在危害分析[J]. 馬壯,彭新宇,葉得河,高彪,袁明貴,尹燁華,徐志宏. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(08)
[5]一起由快餐盒飯引發(fā)的產(chǎn)氣莢膜梭菌食物中毒[J]. 劉秀峰,陳東宛,呂金昌,高彭,李永進(jìn). 中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2016(11)
[6]魏氏梭菌外毒素的研究進(jìn)展[J]. 許崇利. 河南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(01)
[7]陜西省部分地區(qū)雞源A型產(chǎn)氣莢膜梭菌分離株的藥敏試驗(yàn)[J]. 姜艷芬,紀(jì)文靜,許晗. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2015(10)
[8]不同地區(qū)雞源產(chǎn)氣莢膜梭菌的毒素型鑒定和藥敏試驗(yàn)[J]. 胡賀,覃宗華,王艷華,龔振興,劉保紅,殷昊,彭險(xiǎn)峰,馬雪婷,李祥瑞,蔡建平. 畜牧與獸醫(yī). 2015(10)
[9]SPF雞糞菌移植與發(fā)酵床飼養(yǎng)模式下肉雞生產(chǎn)性能和抗藥性研究[J]. 李運(yùn)喜,駱延波,宋敏訓(xùn),馮敏燕,林樹(shù)乾,劉軍偉,郭文龍,劉玉慶,劉煥奇. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(05)
[10]雞產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離鑒定及藥敏試驗(yàn)[J]. 艾地云,邵華斌,張騰飛,詹麗超,羅玲,張蓉蓉,汪宏才,王紅琳,羅青平,溫國(guó)元. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2014(06)
碩士論文
[1]山東省泰安市零售鴨產(chǎn)品中產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離鑒定、基因分型及耐藥性研究[D]. 劉煜.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]山東省泰安市不同來(lái)源的雞產(chǎn)氣莢膜梭菌分離鑒定、耐藥性及基因分型研究[D]. 張匯寧.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[3]廣州市冷鮮雞產(chǎn)氣莢膜梭菌的污染分析及netB菌株的致病性研究[D]. 馬壯.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]規(guī)模化雞場(chǎng)健康雞群產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離、鑒定及遺傳多樣性研究[D]. 鄭曉麗.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號(hào):3704028
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