姜曲海豬和杜洛克豬肺炎支原體易感性差異的分子遺傳機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2022-11-06 18:36
豬支原體肺炎(Mycoplasmal pneumonia of swine,MPS)又稱(chēng)為豬氣喘病,廣泛流行于世界各國(guó)的養(yǎng)豬場(chǎng),對(duì)養(yǎng)豬業(yè)造成極為嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。豬肺炎支原體(Mycoplasma hyopneumoniae,Mhp)是引起該病的主要病原菌,F(xiàn)有研究發(fā)現(xiàn),不同豬種對(duì)Mhp感染表現(xiàn)出較大差異的易感性,中國(guó)地方豬種對(duì)Mhp的易感性高于引入豬種,如高繁殖力的姜曲海豬、二花臉豬、梅山豬等地方豬種相對(duì)于杜洛克豬、長(zhǎng)白豬等引入豬種表現(xiàn)出嚴(yán)重的氣喘病。但是,不同品種對(duì)Mhp易感性的分子遺傳機(jī)制尚不清楚。因此,本研究以地方豬種(姜曲海豬)、培育豬種(蘇姜豬)和引入豬種(長(zhǎng)白豬和杜洛克豬)為研究對(duì)象,通過(guò)流行病學(xué)調(diào)查和人工感染試驗(yàn),從臨床癥狀、病理特征、體液免疫、基因表達(dá)等方面系統(tǒng)分析并驗(yàn)證中外豬種Mhp易感性的差異。此外,以姜曲海豬和杜洛克豬為素材,利用高通量測(cè)序技術(shù)測(cè)定并比較分析兩個(gè)品種感染Mhp后肺組織中mRNA、lncRNA和miRNA表達(dá)模式的相同點(diǎn)和異同點(diǎn),分析差異表達(dá)mRNA、lncRNA和miRNA在機(jī)體抵抗Mhp感染過(guò)程中的免疫調(diào)控作用,以進(jìn)一步揭示中外豬種Mhp易感性差...
【文章頁(yè)數(shù)】:137 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
符號(hào)說(shuō)明
第1章 文獻(xiàn)綜述
1.1 Mhp的研究進(jìn)展
1.1.1 Mhp的發(fā)現(xiàn)及研究歷程
1.1.2 Mhp病原學(xué)研究進(jìn)展
1.1.3 Mhp感染的免疫應(yīng)答
1.1.4 不同豬種Mhp免疫應(yīng)答差異的研究
1.1.5 Mhp抗性基因的研究進(jìn)展
1.2 高通量測(cè)序技術(shù)應(yīng)用及研究進(jìn)展
1.2.1 mRNA轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
1.2.2 lncRNA轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
1.2.3 miRNA轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
1.3 本研究的目的和意義
第2章 江蘇蘇中地區(qū)豬支原體肺炎流行病學(xué)調(diào)查及分析
2.1 材料與方法
2.1.1 調(diào)查對(duì)象
2.1.2 樣本采集
2.1.3 試驗(yàn)試劑
2.1.4 血清Mhp抗體檢測(cè)
2.1.5 Mhp抗原檢測(cè)
2.1.6 肺組織病理檢測(cè)
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 血清Mhp抗體檢測(cè)結(jié)果
2.2.2 呼吸道和肺組織Mhp抗原檢測(cè)結(jié)果
2.2.3 肺組織病理檢測(cè)結(jié)果
2.3 討論
2.3.1 血清中Mhp抗體檢測(cè)結(jié)果分析
2.3.2 呼吸道及肺組織Mhp抗原檢測(cè)結(jié)果分析
2.3.3 肺組織病理檢測(cè)結(jié)果分析
2.4 小結(jié)
第3章 姜曲海豬和杜洛克豬Mhp易感性差異的免疫基礎(chǔ)研究
3.1 材料與方法
3.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
3.1.2 主要試驗(yàn)試劑
3.1.3 Mhp感染試驗(yàn)
3.1.4 稱(chēng)重和臨床評(píng)價(jià)
3.1.5 血液免疫蛋白檢測(cè)
3.1.6 屠宰與肺組織病理檢測(cè)
3.1.7 基因表達(dá)定量PCR檢測(cè)
3.1.8 數(shù)據(jù)處理和分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 試驗(yàn)豬臨床癥狀
3.2.2 試驗(yàn)豬體重變化
3.2.3 試驗(yàn)豬肺組織病理變化
3.2.4 血清抗體含量檢測(cè)
3.2.5 血清IgG、IgM含量檢測(cè)
3.2.6 基因表達(dá)檢測(cè)
3.3 討論
3.3.1 Mhp感染對(duì)臨床癥狀、生長(zhǎng)速度的影響
3.3.2 Mhp感染對(duì)肺組織損傷及血清抗體的影響
3.3.3 Mhp感染對(duì)血清IgG、IgM含量的影響
3.3.4 Mhp感染對(duì)基因表達(dá)的影響
3.3.5 Mhp感染模型的研究
3.4 小結(jié)
第4章 姜曲海豬與杜洛克豬感染Mhp后肺組織mRNA及l(fā)ncRNA轉(zhuǎn)錄組差異分析
4.1 材料與方法
4.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
4.1.2 主要試劑
4.1.3 Mhp感染試驗(yàn)及樣本準(zhǔn)備
4.1.4 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
4.1.5 測(cè)序數(shù)據(jù)處理及生物信息學(xué)分析
4.1.6 定量PCR驗(yàn)證測(cè)序數(shù)據(jù)
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 樣本總RNA質(zhì)量檢測(cè)
4.2.2 測(cè)序數(shù)據(jù)分析
4.2.3 mRNA和lncRNA差異表達(dá)分析
4.2.4 差異表達(dá)mRNA的功能分析
4.2.5 差異表達(dá)lncRNA的功能分析
4.3 討論
4.3.1 測(cè)序數(shù)據(jù)分析
4.3.2 差異表達(dá)mRNA介導(dǎo)的免疫應(yīng)答模式分析
4.3.3 差異表達(dá)lncRNA靶基因及功能分析
4.4 小結(jié)
第5章 姜曲海豬與杜洛克豬感染Mhp后肺組織miRNA轉(zhuǎn)錄組差異分析
5.1 材料與方法
5.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物及樣本準(zhǔn)備
5.1.2 主要試劑
5.1.3 樣本總RNA提取及質(zhì)控
5.1.4 小RNA文庫(kù)構(gòu)建及測(cè)序
5.1.5 測(cè)序數(shù)據(jù)處理及生物信息學(xué)分析
5.1.6 定量PCR驗(yàn)證測(cè)序數(shù)據(jù)
5.1.7 ceRNA關(guān)聯(lián)分析和關(guān)鍵免疫應(yīng)答基因的篩選
5.1.8 免疫組織中基因表達(dá)檢測(cè)
5.2 結(jié)果與分析
5.2.1 小RNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析
5.2.2 miRNA的篩選及新miRNA預(yù)測(cè)
5.2.3 miRNA表達(dá)分析
5.2.4 差異表達(dá)miRNA的篩選
5.2.5 差異表達(dá)miRNA靶基因的預(yù)測(cè)
5.2.6 差異表達(dá)miRNA的功能分析
5.2.7 miRNA測(cè)序數(shù)據(jù)的驗(yàn)證
5.2.8 ceRNA關(guān)聯(lián)分析及關(guān)鍵免疫應(yīng)答基因的篩選結(jié)果
5.2.9 免疫組織中基因表達(dá)檢測(cè)結(jié)果
5.3 討論
5.3.1 小RNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析
5.3.2 差異表達(dá)miRNA的免疫調(diào)控機(jī)制分析
5.3.3 ceRNA關(guān)聯(lián)及關(guān)鍵免疫應(yīng)答基因篩選結(jié)果分析
5.3.4 免疫組織中基因表達(dá)檢測(cè)結(jié)果分析
5.4 小結(jié)
全文結(jié)論
論文創(chuàng)新點(diǎn)
論文有待改進(jìn)之處和下一步研究計(jì)劃
參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Ssc-miR-27b-3p在豬繁殖與呼吸綜合征病毒感染中的作用分析[J]. 吳俊靜,季子云,喬木,武華玉,劉貴生,彭先文,梅書(shū)棋. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(S2)
[2]豬支原體肺炎病變對(duì)體重的影響[J]. 杜德燕,方鵬飛,朱冬梅,鄒智坤,嚴(yán)成,郭健寶. 中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2018(06)
[3]B7家族新成員HHLA2的研究進(jìn)展[J]. 王澤群,魏素菊. 中國(guó)免疫學(xué)雜志. 2018(05)
[4]miR-7-5p對(duì)氫醌誘導(dǎo)TK6細(xì)胞損傷作用[J]. 楊慧,陳玉婷,梁海榮,羅皓,高羽亭,翟璐,唐煥文. 中國(guó)職業(yè)醫(yī)學(xué). 2017(03)
[5]基于QTL的豬支原體肺炎候選基因的篩選與生物學(xué)注釋[J]. 張程玥,張哲,張向喆,王起山,潘玉春. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2017(03)
[6]Mir-217通過(guò)Sirt1/HIF-1α信號(hào)通路介導(dǎo)高糖誘導(dǎo)的大鼠腎小球系膜細(xì)胞炎癥反應(yīng)及纖維化[J]. 邵瀅,呂川,吳燦,周月宏,王秋月. 中華內(nèi)分泌代謝雜志. 2016 (07)
[7]豬支原體肺炎發(fā)生的品種敏感差異及分子基礎(chǔ)[J]. 方曉敏,趙為民,付言峰,涂楓,李碧俠,王學(xué)敏,趙芳,任守文. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(14)
[8]套式PCR檢測(cè)中國(guó)江蘇省豬場(chǎng)豬鼻支原體和豬肺炎支原體的感染(英文)[J]. Joyce Wanjiru Maingi,熊祺琰,韋艷娜,馬慶紅,紀(jì)燕,William Kimaru,華立忠,王佳,邵國(guó)青,鮑恩東. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2014(08)
[9]豬支原體肺炎研究進(jìn)展[J]. 李瑩瑩,何穎,趙武,李斌,秦毅斌,盧冰霞,梁家幸,陸芹章. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2013(10)
[10]豬肺炎支原體致病機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 李彥偉,劉茂軍,武昱孜,張旭,李桂蘭,張映,邵國(guó)青. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2013(08)
博士論文
[1]斷奶仔豬F18大腸桿菌抗性基因和lncRNA的篩選與調(diào)控機(jī)制分析[D]. 吳正常.揚(yáng)州大學(xué) 2017
[2]豬肺炎支原體誘導(dǎo)豬肺泡巨噬細(xì)胞基因差異表達(dá)譜研究[D]. 王貴平.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
本文編號(hào):3704013
【文章頁(yè)數(shù)】:137 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
符號(hào)說(shuō)明
第1章 文獻(xiàn)綜述
1.1 Mhp的研究進(jìn)展
1.1.1 Mhp的發(fā)現(xiàn)及研究歷程
1.1.2 Mhp病原學(xué)研究進(jìn)展
1.1.3 Mhp感染的免疫應(yīng)答
1.1.4 不同豬種Mhp免疫應(yīng)答差異的研究
1.1.5 Mhp抗性基因的研究進(jìn)展
1.2 高通量測(cè)序技術(shù)應(yīng)用及研究進(jìn)展
1.2.1 mRNA轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
1.2.2 lncRNA轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
1.2.3 miRNA轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
1.3 本研究的目的和意義
第2章 江蘇蘇中地區(qū)豬支原體肺炎流行病學(xué)調(diào)查及分析
2.1 材料與方法
2.1.1 調(diào)查對(duì)象
2.1.2 樣本采集
2.1.3 試驗(yàn)試劑
2.1.4 血清Mhp抗體檢測(cè)
2.1.5 Mhp抗原檢測(cè)
2.1.6 肺組織病理檢測(cè)
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 血清Mhp抗體檢測(cè)結(jié)果
2.2.2 呼吸道和肺組織Mhp抗原檢測(cè)結(jié)果
2.2.3 肺組織病理檢測(cè)結(jié)果
2.3 討論
2.3.1 血清中Mhp抗體檢測(cè)結(jié)果分析
2.3.2 呼吸道及肺組織Mhp抗原檢測(cè)結(jié)果分析
2.3.3 肺組織病理檢測(cè)結(jié)果分析
2.4 小結(jié)
第3章 姜曲海豬和杜洛克豬Mhp易感性差異的免疫基礎(chǔ)研究
3.1 材料與方法
3.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
3.1.2 主要試驗(yàn)試劑
3.1.3 Mhp感染試驗(yàn)
3.1.4 稱(chēng)重和臨床評(píng)價(jià)
3.1.5 血液免疫蛋白檢測(cè)
3.1.6 屠宰與肺組織病理檢測(cè)
3.1.7 基因表達(dá)定量PCR檢測(cè)
3.1.8 數(shù)據(jù)處理和分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 試驗(yàn)豬臨床癥狀
3.2.2 試驗(yàn)豬體重變化
3.2.3 試驗(yàn)豬肺組織病理變化
3.2.4 血清抗體含量檢測(cè)
3.2.5 血清IgG、IgM含量檢測(cè)
3.2.6 基因表達(dá)檢測(cè)
3.3 討論
3.3.1 Mhp感染對(duì)臨床癥狀、生長(zhǎng)速度的影響
3.3.2 Mhp感染對(duì)肺組織損傷及血清抗體的影響
3.3.3 Mhp感染對(duì)血清IgG、IgM含量的影響
3.3.4 Mhp感染對(duì)基因表達(dá)的影響
3.3.5 Mhp感染模型的研究
3.4 小結(jié)
第4章 姜曲海豬與杜洛克豬感染Mhp后肺組織mRNA及l(fā)ncRNA轉(zhuǎn)錄組差異分析
4.1 材料與方法
4.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
4.1.2 主要試劑
4.1.3 Mhp感染試驗(yàn)及樣本準(zhǔn)備
4.1.4 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
4.1.5 測(cè)序數(shù)據(jù)處理及生物信息學(xué)分析
4.1.6 定量PCR驗(yàn)證測(cè)序數(shù)據(jù)
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 樣本總RNA質(zhì)量檢測(cè)
4.2.2 測(cè)序數(shù)據(jù)分析
4.2.3 mRNA和lncRNA差異表達(dá)分析
4.2.4 差異表達(dá)mRNA的功能分析
4.2.5 差異表達(dá)lncRNA的功能分析
4.3 討論
4.3.1 測(cè)序數(shù)據(jù)分析
4.3.2 差異表達(dá)mRNA介導(dǎo)的免疫應(yīng)答模式分析
4.3.3 差異表達(dá)lncRNA靶基因及功能分析
4.4 小結(jié)
第5章 姜曲海豬與杜洛克豬感染Mhp后肺組織miRNA轉(zhuǎn)錄組差異分析
5.1 材料與方法
5.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物及樣本準(zhǔn)備
5.1.2 主要試劑
5.1.3 樣本總RNA提取及質(zhì)控
5.1.4 小RNA文庫(kù)構(gòu)建及測(cè)序
5.1.5 測(cè)序數(shù)據(jù)處理及生物信息學(xué)分析
5.1.6 定量PCR驗(yàn)證測(cè)序數(shù)據(jù)
5.1.7 ceRNA關(guān)聯(lián)分析和關(guān)鍵免疫應(yīng)答基因的篩選
5.1.8 免疫組織中基因表達(dá)檢測(cè)
5.2 結(jié)果與分析
5.2.1 小RNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析
5.2.2 miRNA的篩選及新miRNA預(yù)測(cè)
5.2.3 miRNA表達(dá)分析
5.2.4 差異表達(dá)miRNA的篩選
5.2.5 差異表達(dá)miRNA靶基因的預(yù)測(cè)
5.2.6 差異表達(dá)miRNA的功能分析
5.2.7 miRNA測(cè)序數(shù)據(jù)的驗(yàn)證
5.2.8 ceRNA關(guān)聯(lián)分析及關(guān)鍵免疫應(yīng)答基因的篩選結(jié)果
5.2.9 免疫組織中基因表達(dá)檢測(cè)結(jié)果
5.3 討論
5.3.1 小RNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析
5.3.2 差異表達(dá)miRNA的免疫調(diào)控機(jī)制分析
5.3.3 ceRNA關(guān)聯(lián)及關(guān)鍵免疫應(yīng)答基因篩選結(jié)果分析
5.3.4 免疫組織中基因表達(dá)檢測(cè)結(jié)果分析
5.4 小結(jié)
全文結(jié)論
論文創(chuàng)新點(diǎn)
論文有待改進(jìn)之處和下一步研究計(jì)劃
參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Ssc-miR-27b-3p在豬繁殖與呼吸綜合征病毒感染中的作用分析[J]. 吳俊靜,季子云,喬木,武華玉,劉貴生,彭先文,梅書(shū)棋. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(S2)
[2]豬支原體肺炎病變對(duì)體重的影響[J]. 杜德燕,方鵬飛,朱冬梅,鄒智坤,嚴(yán)成,郭健寶. 中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2018(06)
[3]B7家族新成員HHLA2的研究進(jìn)展[J]. 王澤群,魏素菊. 中國(guó)免疫學(xué)雜志. 2018(05)
[4]miR-7-5p對(duì)氫醌誘導(dǎo)TK6細(xì)胞損傷作用[J]. 楊慧,陳玉婷,梁海榮,羅皓,高羽亭,翟璐,唐煥文. 中國(guó)職業(yè)醫(yī)學(xué). 2017(03)
[5]基于QTL的豬支原體肺炎候選基因的篩選與生物學(xué)注釋[J]. 張程玥,張哲,張向喆,王起山,潘玉春. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2017(03)
[6]Mir-217通過(guò)Sirt1/HIF-1α信號(hào)通路介導(dǎo)高糖誘導(dǎo)的大鼠腎小球系膜細(xì)胞炎癥反應(yīng)及纖維化[J]. 邵瀅,呂川,吳燦,周月宏,王秋月. 中華內(nèi)分泌代謝雜志. 2016 (07)
[7]豬支原體肺炎發(fā)生的品種敏感差異及分子基礎(chǔ)[J]. 方曉敏,趙為民,付言峰,涂楓,李碧俠,王學(xué)敏,趙芳,任守文. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(14)
[8]套式PCR檢測(cè)中國(guó)江蘇省豬場(chǎng)豬鼻支原體和豬肺炎支原體的感染(英文)[J]. Joyce Wanjiru Maingi,熊祺琰,韋艷娜,馬慶紅,紀(jì)燕,William Kimaru,華立忠,王佳,邵國(guó)青,鮑恩東. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2014(08)
[9]豬支原體肺炎研究進(jìn)展[J]. 李瑩瑩,何穎,趙武,李斌,秦毅斌,盧冰霞,梁家幸,陸芹章. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2013(10)
[10]豬肺炎支原體致病機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 李彥偉,劉茂軍,武昱孜,張旭,李桂蘭,張映,邵國(guó)青. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2013(08)
博士論文
[1]斷奶仔豬F18大腸桿菌抗性基因和lncRNA的篩選與調(diào)控機(jī)制分析[D]. 吳正常.揚(yáng)州大學(xué) 2017
[2]豬肺炎支原體誘導(dǎo)豬肺泡巨噬細(xì)胞基因差異表達(dá)譜研究[D]. 王貴平.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
本文編號(hào):3704013
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