基于駱駝腎臟、肝臟和回腸的RNA-seq揭示其耐鹽抗旱的機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2022-11-06 12:27
駱駝是久居沙漠的大型哺乳動(dòng)物,其作為動(dòng)物抗逆性研究的良好生物資源擁有著極其重要的科研和應(yīng)用價(jià)值。本試驗(yàn)對(duì)9只雌性雙峰駝(Camelus bactrianus)進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,再通過(guò)抗性基因篩選、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控分析和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,為揭示駱駝適應(yīng)沙漠環(huán)境的獨(dú)特機(jī)制和解決人類高血壓、高血糖等疾病提供了分子理論基礎(chǔ)。本試驗(yàn)將9只雌性雙峰駝隨機(jī)分配到鹽脅迫試驗(yàn)組、禁水脅迫試驗(yàn)組和自由飲食對(duì)照組中,每組3只。經(jīng)24天的試驗(yàn)處理后分別采集9只駱駝的腎皮質(zhì)、腎髓質(zhì)、肝臟和回腸,利用Illumina HiSeq4000和2500測(cè)序儀,對(duì)所采集的組織樣品進(jìn)行測(cè)序,并從質(zhì)控后的有效數(shù)據(jù)中篩選得到差異表達(dá)的mRNA和非編碼RNA。與對(duì)照組相比,鹽脅迫腎皮質(zhì)有差異表達(dá)的mRNA 13種,lncRNA 4種,miRNA 11種;禁水脅迫腎皮質(zhì)有差異表達(dá)的mRNA 14種,lncRNA 0種,miRNA 18種;鹽脅迫腎髓質(zhì)有差異表達(dá)的mRNA 22種,lncRNA 2種,miRNA 31種;禁水脅迫腎髓質(zhì)有差異表達(dá)的mRNA 17種,lncRNA 0種,miRNA 26種;鹽脅迫肝臟有差異表達(dá)的mRNA 14種,ln...
【文章頁(yè)數(shù)】:119 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1技術(shù)路線??Fig.?1?Technology?roadmap??
圖2試驗(yàn)涉及的雙峰駝??Fig.2?Bactrian?camels?involved?in?the?experiment??2.?1.3.?2?mi?RNA文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序??
鹽脅迫腎皮質(zhì)顯著差異表達(dá)基因的log2(foldchange)
本文編號(hào):3703501
【文章頁(yè)數(shù)】:119 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1技術(shù)路線??Fig.?1?Technology?roadmap??
圖2試驗(yàn)涉及的雙峰駝??Fig.2?Bactrian?camels?involved?in?the?experiment??2.?1.3.?2?mi?RNA文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序??
鹽脅迫腎皮質(zhì)顯著差異表達(dá)基因的log2(foldchange)
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