【目的】克隆陸川豬心肌錨蛋白重復(fù)域1基因（ANKRD1）,并進(jìn)行生物信息學(xué)及組織表達(dá)譜分析,為研究ANKRD1在陸川豬機(jī)體內(nèi)的功能作用提供參考依據(jù)。【方法】根據(jù)NCBI已公布的野豬ANKRD1基因序列（NM₂13922.1）設(shè)計(jì)特異性引物,采用TRIzol法提取陸川豬心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟、背最長(zhǎng)肌和皮下脂肪的總RNA,反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,并以此為模板進(jìn)行ANKRD1基因克隆,通過MegAlign、Protaram、Protscale、MHMM Server和SignalP等在線分析軟件進(jìn)行生物信息學(xué)分析,最后以實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)ANKRD1基因在陸川豬各組織中的表達(dá)情況�！窘Y(jié)果】陸川豬ANKRD1基因蛋白編碼區(qū)（CDS）序列全長(zhǎng)960 bp,編碼319個(gè)氨基酸殘基,與NCBI已公布野豬ANKRD1基因（NM₂13922.1）的CDS序列存在4處堿基突變,但均為同義突變,二者的ANKRD1氨基酸序列同源性為99.6%。陸川豬ANKRD1基因編碼蛋白分子量為36125.70 Da,理論等電點(diǎn)（pI）為7.09,屬于穩(wěn)定蛋白,其二級(jí)結(jié)構(gòu)... 

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 試驗(yàn)方法
        1.2.1 引物設(shè)計(jì)與合成
        1.2.2 陸川豬ANKRD1基因克隆
        1.2.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
    1.3 陸川豬ANKRD1基因生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 陸川豬ANKRD1基因克隆結(jié)果
    2.2 陸川豬ANKRD1基因生物信息學(xué)分析結(jié)果
        2.2.1 陸川豬ANKRD1基因測(cè)序分析
        2.2.2 陸川豬ANKRD1蛋白理化性質(zhì)
        2.2.3 陸川豬ANKRD1蛋白二、三級(jí)結(jié)構(gòu)
        2.2.4 陸川豬ANKRD1蛋白親/疏水性
        2.2.5 陸川豬ANKRD1蛋白信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu)
        2.2.6 陸川豬ANKRD1蛋白磷酸化位點(diǎn)
        2.2.7 陸川豬ANKRD1蛋白糖基化位點(diǎn)
        2.2.8 陸川豬ANKRD1蛋白保守域及亞細(xì)胞定位
    2.3 ANKRD1基因在陸川豬不同組織中的表達(dá)情況
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]陸川豬MYL9基因克隆及其表達(dá)差異分析[J]. 焦迪,謝婉,潘鵬丞,陳寶劍,關(guān)志惠,楊秀榮,蘭干球,郭亞芬,謝炳坤.  南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2019(03)
[2]陸川豬GPR1基因啟動(dòng)子甲基化及其mRNA表達(dá)分析[J]. 謝婉,焦迪,何劍雄,陳寶劍,關(guān)志惠,蘭干球,郭亞芬,謝炳坤.  黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(17)
[3]miR-218對(duì)血管緊張素II誘導(dǎo)的心肌細(xì)胞肥大的影響[J]. 王譯晗,朱海英,駱海燕,陸彩玲,高小博.  中國(guó)計(jì)劃生育學(xué)雜志. 2018(06)
[4]陸川豬脂酰輔酶A氧化酶1基因克隆及序列分析[J]. 關(guān)志惠,陳寶劍,潘天彪,覃兆鮮,劉嘉琪,馬青艷,農(nóng)素群,謝炳坤.  中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2017(03)
[5]陸川豬肌肉生長(zhǎng)抑制素基因的克隆與序列分析[J]. 黃艷娜,李莉,韋玲靜,郭曉萍,梁明振,蘭干球,蔣欽楊.  南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(04)
[6]陸川豬胴體品質(zhì)及肉質(zhì)的研究[J]. 張家富,何若鋼,江永強(qiáng),覃小榮,黃偉杰,劉丁健,劉桂武,羅麗萍.  養(yǎng)豬. 2010(06)

碩士論文
[1]豬WFIKKN2基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化及mRNA表達(dá)水平研究[D]. 何劍雄.廣西大學(xué) 2018



本文編號(hào)：3697230