2012-2013年江西省部分地區(qū)PEDV流行株的分子流行病學(xué)調(diào)查
發(fā)布時間:2022-10-15 11:52
豬流行性腹瀉病毒(Porcine Epidemic Diarrhea Virus, PEDV)是引發(fā)豬流行性腹瀉(Porcine Epidemic Diarrhea, PED)的原因。其屬于冠狀病毒科,冠狀病毒屬。PED對于不同年齡段及不同品種的豬都容易感染,是豬的一種擁有高度接觸性的毀滅性的傳染病,以哺乳仔豬最為嚴(yán)重,死亡率可達(dá)100%。其主要的臨床癥狀以食欲不振、水樣腹瀉、嘔吐、脫水,最后的酸中毒為基本特征。該病給養(yǎng)豬業(yè)形成了極度嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失,在我國及世界各養(yǎng)豬國家普遍分布。近年來,本病在我省發(fā)生率明顯升高,因此,本研究對江西省不同地區(qū)的豬場進(jìn)行PEDV感染及流行情況進(jìn)行調(diào)查,并對流行毒株序列進(jìn)行相關(guān)分析。 本實驗利用MEGA5.0比較GenBank上所提供的PEDV-S基因序列,查找出其中最保守的序列,再應(yīng)用DNAStar軟件中的PrimemSelect按引物設(shè)計原則設(shè)計出一對引物,擴(kuò)增長度為1139bp。通過條件優(yōu)化反應(yīng),首先建立PEDV-S基因的RT-PCR擴(kuò)增方法,結(jié)果退火溫度以57.9℃條件為最優(yōu);利用該法對收集的134份江西地區(qū)疑似仔豬病毒性腹瀉的糞便或小腸組織...
【文章頁數(shù)】:52 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
目錄
摘要
Abstract
第一部分:文獻(xiàn)綜述
1.1 豬流行性腹瀉病毒的研究進(jìn)展
1.1.1 病毒的分類和形態(tài)特征
1.1.2 病毒的理化特性
1.1.3 PEDV 的分子生物學(xué)特性
1.1.4 PEDV 的致病性
1.2 豬流行性腹瀉病診斷方法的研究進(jìn)展
1.2.1 病毒的分離與鑒定
1.2.2 微量血清中和實驗
1.2.3 免疫熒光法
1.2.4 免疫電鏡法
1.2.5 RT-PCR 法
1.2.6 ELISA 法
1.3 豬流行性腹瀉的預(yù)防和治療
1.4 本實驗研究的目的和意義
第二部分 豬流行性腹瀉病毒 S 基因 RT-PCR 擴(kuò)增方法建立
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 方法
2.2 結(jié)果
2.2.1 PEDV RT-PCR 反應(yīng)最適退火溫度的確定
2.2.2 引物濃度范圍的確定
2.2.3 敏感性實驗
2.2.4 特異性實驗
2.2.5 臨床樣品的檢測結(jié)果
2.3. 小結(jié)與討論
第三部分 豬流行性腹瀉病毒的分子流行病學(xué)調(diào)查
3.1 材料與方法
3.1.1 材料
3.1.2 方法
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 PEDV S 基因的 RT-PCR 擴(kuò)增結(jié)果:
3.2.2 PCR 產(chǎn)物的克隆與鑒定
3.2.3 測序結(jié)果與分析
3.3 小結(jié)與討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SYBR Green Ⅰ實時熒光定量PCR檢測豬流行性腹瀉病毒方法的建立及應(yīng)用[J]. 王金良,郭顯坡,魏鳳,沈志強(qiáng). 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2010(10)
[2]豬流行性腹瀉病毒、豬傳染性胃腸炎病毒和豬A群輪狀病毒多重RT-PCR檢測方法的建立及臨床應(yīng)用[J]. 張坤,何啟蓋. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2010(08)
[3]豬流行性腹瀉病毒S基因片段的原核表達(dá)及其表達(dá)產(chǎn)物的反應(yīng)原性[J]. 姜艷平,葛俊偉,汪淼,喬薪瑗,唐麗杰,劉兆磊,李一經(jīng). 中國獸醫(yī)科學(xué). 2009(07)
[4]Cloning the Structure Genes and Expression the N Gene of Porcine Epidemic Diarrhea Virus DX[J]. Jian-qiang LI 1,2,Ji-xing LIU 2,Xi LAN 2,Jie CHENG 1,Run WU 1,Zhong-Zi LOU2 Xiang-ping YIN2,Xue-rui LI2,Bao-yu LI2,Bin YANG2 and Zhi-yong LI2 (1. College of Veterinary Medicine,Gansu Agricultural University,Lanzhou 730070,China;2. Key laboratory of Animal Virology of Ministry of Agriculture,State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology,Lanzhou Veterinary Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730046,China). Virologica Sinica. 2009(03)
[5]豬傳染性胃腸炎和豬流行性腹瀉疫苗研究進(jìn)展[J]. 劉巖,柏亞鐸,魯娜,董麗娜,胡桂學(xué). 中國獸藥雜志. 2007(02)
[6]豬流行性腹瀉病毒和豬傳染性胃腸炎病毒的RT-PCR鑒別診斷[J]. 方立,徐輝,陳偉杰,趙靈燕,倪柏鋒,方維煥. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2006(02)
[7]流行性腹瀉病毒M基因與甲病毒載體重組RNA的構(gòu)建[J]. 余麗蕓,侯喜林. 動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2005(05)
[8]流行性腹瀉病毒E基因與pSFV重組RNA的構(gòu)建[J]. 余麗蕓,侯喜林. 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報. 2005(01)
[9]間接ELISA檢測豬流行性腹瀉病毒的抗體水平[J]. 鄒勇,唐永蘭,蘇萬國,許大新,陳培龍,錢永清. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2000(01)
[10]豬流行性腹瀉弱毒株的培育[J]. 佟有恩,馮力,李偉杰,王明,馬思奇. 中國畜禽傳染病. 1998(06)
本文編號:3691257
【文章頁數(shù)】:52 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
目錄
摘要
Abstract
第一部分:文獻(xiàn)綜述
1.1 豬流行性腹瀉病毒的研究進(jìn)展
1.1.1 病毒的分類和形態(tài)特征
1.1.2 病毒的理化特性
1.1.3 PEDV 的分子生物學(xué)特性
1.1.4 PEDV 的致病性
1.2 豬流行性腹瀉病診斷方法的研究進(jìn)展
1.2.1 病毒的分離與鑒定
1.2.2 微量血清中和實驗
1.2.3 免疫熒光法
1.2.4 免疫電鏡法
1.2.5 RT-PCR 法
1.2.6 ELISA 法
1.3 豬流行性腹瀉的預(yù)防和治療
1.4 本實驗研究的目的和意義
第二部分 豬流行性腹瀉病毒 S 基因 RT-PCR 擴(kuò)增方法建立
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 方法
2.2 結(jié)果
2.2.1 PEDV RT-PCR 反應(yīng)最適退火溫度的確定
2.2.2 引物濃度范圍的確定
2.2.3 敏感性實驗
2.2.4 特異性實驗
2.2.5 臨床樣品的檢測結(jié)果
2.3. 小結(jié)與討論
第三部分 豬流行性腹瀉病毒的分子流行病學(xué)調(diào)查
3.1 材料與方法
3.1.1 材料
3.1.2 方法
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 PEDV S 基因的 RT-PCR 擴(kuò)增結(jié)果:
3.2.2 PCR 產(chǎn)物的克隆與鑒定
3.2.3 測序結(jié)果與分析
3.3 小結(jié)與討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SYBR Green Ⅰ實時熒光定量PCR檢測豬流行性腹瀉病毒方法的建立及應(yīng)用[J]. 王金良,郭顯坡,魏鳳,沈志強(qiáng). 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2010(10)
[2]豬流行性腹瀉病毒、豬傳染性胃腸炎病毒和豬A群輪狀病毒多重RT-PCR檢測方法的建立及臨床應(yīng)用[J]. 張坤,何啟蓋. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2010(08)
[3]豬流行性腹瀉病毒S基因片段的原核表達(dá)及其表達(dá)產(chǎn)物的反應(yīng)原性[J]. 姜艷平,葛俊偉,汪淼,喬薪瑗,唐麗杰,劉兆磊,李一經(jīng). 中國獸醫(yī)科學(xué). 2009(07)
[4]Cloning the Structure Genes and Expression the N Gene of Porcine Epidemic Diarrhea Virus DX[J]. Jian-qiang LI 1,2,Ji-xing LIU 2,Xi LAN 2,Jie CHENG 1,Run WU 1,Zhong-Zi LOU2 Xiang-ping YIN2,Xue-rui LI2,Bao-yu LI2,Bin YANG2 and Zhi-yong LI2 (1. College of Veterinary Medicine,Gansu Agricultural University,Lanzhou 730070,China;2. Key laboratory of Animal Virology of Ministry of Agriculture,State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology,Lanzhou Veterinary Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730046,China). Virologica Sinica. 2009(03)
[5]豬傳染性胃腸炎和豬流行性腹瀉疫苗研究進(jìn)展[J]. 劉巖,柏亞鐸,魯娜,董麗娜,胡桂學(xué). 中國獸藥雜志. 2007(02)
[6]豬流行性腹瀉病毒和豬傳染性胃腸炎病毒的RT-PCR鑒別診斷[J]. 方立,徐輝,陳偉杰,趙靈燕,倪柏鋒,方維煥. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2006(02)
[7]流行性腹瀉病毒M基因與甲病毒載體重組RNA的構(gòu)建[J]. 余麗蕓,侯喜林. 動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2005(05)
[8]流行性腹瀉病毒E基因與pSFV重組RNA的構(gòu)建[J]. 余麗蕓,侯喜林. 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報. 2005(01)
[9]間接ELISA檢測豬流行性腹瀉病毒的抗體水平[J]. 鄒勇,唐永蘭,蘇萬國,許大新,陳培龍,錢永清. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2000(01)
[10]豬流行性腹瀉弱毒株的培育[J]. 佟有恩,馮力,李偉杰,王明,馬思奇. 中國畜禽傳染病. 1998(06)
本文編號:3691257
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