雞BRD2基因及其剪接體的克隆測(cè)序與亞細(xì)胞定位分析
發(fā)布時(shí)間:2022-08-11 16:46
【目的】克隆雞含溴結(jié)構(gòu)域蛋白2(BRD2)基因及其剪接體,并對(duì)其進(jìn)行序列分析和亞細(xì)胞定位,為深入研究雞BRD2基因及其剪接體在細(xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的作用機(jī)理打下基礎(chǔ)!痉椒ā客ㄟ^RT-PCR擴(kuò)增雞BRD2基因及其剪接體的編碼區(qū)(CDS)序列,采用BioEdit、ProtParam、SOPMA、SWISS-MODEL、CDART等在線軟件進(jìn)行生物信息學(xué)分析;雞BRD2基因及其剪接體經(jīng)Xho I和Bam H I雙酶切后,分別亞克隆至真核表達(dá)載體pEGFP-C1多克隆位點(diǎn)上構(gòu)建重組真核表達(dá)載體,通過轉(zhuǎn)染HEK-293T細(xì)胞進(jìn)行亞細(xì)胞定位分析!窘Y(jié)果】雞BRD2基因CDS序列全長(zhǎng)2340 bp,編碼779個(gè)氨基酸殘基,分子量為85.66 k D,理論等電點(diǎn)(pI)為8.74,其編碼蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)主要由無規(guī)則卷曲(60.59%)和α-螺旋(28.50%)組成,含有3個(gè)明顯的功能結(jié)構(gòu)域(2個(gè)BD結(jié)構(gòu)域和1個(gè)ET結(jié)構(gòu)域)。與雞BRD2基因相比,其剪接體BRD2-X1、BRD2-X2和BRD2-X3的CDS序列長(zhǎng)分別為2301、2283和1983 bp,編碼766、760和660個(gè)氨基酸殘基。以雞BRD2氨基...
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 引物設(shè)計(jì)與合成
1.3 雞BRD2基因及其剪接體克隆與測(cè)序分析
1.4 雞BRD2基因及其剪接體重組真核表達(dá)載體構(gòu)建
1.5 細(xì)胞培養(yǎng)與轉(zhuǎn)染
1.6 雞BRD2基因及其剪接體融合蛋白熒光觀察
2 結(jié)果與分析
2.1 雞BRD2基因及其剪接體的克隆和重組真核表達(dá)載體構(gòu)建
2.2 雞BRD2基因及其剪接體的生物信息學(xué)分析結(jié)果
2.2.1雞BRD2基因及其剪接體編碼蛋白理化性質(zhì)和功能結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)分析結(jié)果
2.2.2 雞BRD2蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和功能結(jié)構(gòu)域保守性分析結(jié)果
2.2.3 雞BRD2蛋白的互作蛋白預(yù)測(cè)結(jié)果
2.2.4 雞BRD2基因核苷酸序列相似性和遺傳進(jìn)化分析結(jié)果
2.3 雞BRD2蛋白及其剪接體亞細(xì)胞定位分析結(jié)果
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]部分雞種Brd2基因SNP和INDEL分析[J]. 吳允,畢榆林,張揚(yáng),郭曉敏,李志騰,萬方,朱鵬飛,徐璐,常國(guó)斌,徐琪,陳國(guó)宏. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(02)
[2]mRNA選擇性剪接的分子機(jī)制[J]. 章國(guó)衛(wèi),宋懷東,陳竺. 遺傳學(xué)報(bào). 2004(01)
博士論文
[1]秦川牛脂肪沉積相關(guān)基因篩選及可變剪接對(duì)基因表達(dá)和細(xì)胞定位的影響研究[D]. 周揚(yáng).西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
碩士論文
[1]BRD2核定位信號(hào)的核定位功能和細(xì)胞凋亡始動(dòng)功能的初步研究[D]. 何佳瑾.中南大學(xué) 2007
本文編號(hào):3675021
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 引物設(shè)計(jì)與合成
1.3 雞BRD2基因及其剪接體克隆與測(cè)序分析
1.4 雞BRD2基因及其剪接體重組真核表達(dá)載體構(gòu)建
1.5 細(xì)胞培養(yǎng)與轉(zhuǎn)染
1.6 雞BRD2基因及其剪接體融合蛋白熒光觀察
2 結(jié)果與分析
2.1 雞BRD2基因及其剪接體的克隆和重組真核表達(dá)載體構(gòu)建
2.2 雞BRD2基因及其剪接體的生物信息學(xué)分析結(jié)果
2.2.1雞BRD2基因及其剪接體編碼蛋白理化性質(zhì)和功能結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)分析結(jié)果
2.2.2 雞BRD2蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和功能結(jié)構(gòu)域保守性分析結(jié)果
2.2.3 雞BRD2蛋白的互作蛋白預(yù)測(cè)結(jié)果
2.2.4 雞BRD2基因核苷酸序列相似性和遺傳進(jìn)化分析結(jié)果
2.3 雞BRD2蛋白及其剪接體亞細(xì)胞定位分析結(jié)果
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]部分雞種Brd2基因SNP和INDEL分析[J]. 吳允,畢榆林,張揚(yáng),郭曉敏,李志騰,萬方,朱鵬飛,徐璐,常國(guó)斌,徐琪,陳國(guó)宏. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(02)
[2]mRNA選擇性剪接的分子機(jī)制[J]. 章國(guó)衛(wèi),宋懷東,陳竺. 遺傳學(xué)報(bào). 2004(01)
博士論文
[1]秦川牛脂肪沉積相關(guān)基因篩選及可變剪接對(duì)基因表達(dá)和細(xì)胞定位的影響研究[D]. 周揚(yáng).西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
碩士論文
[1]BRD2核定位信號(hào)的核定位功能和細(xì)胞凋亡始動(dòng)功能的初步研究[D]. 何佳瑾.中南大學(xué) 2007
本文編號(hào):3675021
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