本試驗(yàn)利用PCR-SSCP技術(shù)對90只蘇尼特羊的CAST基因的第六外顯子和3非翻譯區(qū)進(jìn)行多態(tài)性分析，并研究了其中12只12月齡的母本蘇尼特羊的不同基因型與肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)性。結(jié)果表明：在9對引物中，引物P1、P4、P5、P6擴(kuò)增的目的片段出現(xiàn)了多態(tài)位點(diǎn)。經(jīng)測序后發(fā)現(xiàn)，P1引物擴(kuò)增產(chǎn)物出現(xiàn)了2個(gè)突變位點(diǎn)分別為在56bp處A/G替換；在184bp的A/C替換，堿基的突變導(dǎo)致了在該區(qū)域出現(xiàn)了三種基因型，分別命名為AA、AB、AC；P4引物的擴(kuò)增產(chǎn)物出現(xiàn)了三種基因型（AA、BB、BC）是由于該區(qū)域兩個(gè)堿基的缺失和3個(gè)堿基替換，分別為在105bpCA堿基的缺失，在117bpG/A的替換，在201bpA/G替換，以及在131bpA/C/G的替換。P5引物擴(kuò)增產(chǎn)物在32bp處出現(xiàn)了C/T堿基的替換使得在該區(qū)域出現(xiàn)了兩種基因型（AA、AB）；P6引物擴(kuò)增產(chǎn)物出現(xiàn)了3個(gè)突變位點(diǎn)，分別為135bpT/C的替換，在142bpC/T的替換，以及在151bpA/C的替換，堿基突變導(dǎo)致了在該區(qū)域出現(xiàn)了3種基因型（AA、BB、BC）。后經(jīng)數(shù)據(jù)分析得出引物P1、P4、P5擴(kuò)增產(chǎn)物的多態(tài)信息含量（PIC）分別為0.28、... 

【文章頁數(shù)】：52 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 引言
    1.1 蘇尼特羊的簡介
    1.2 鈣蛋白酶抑制蛋白的概述
        1.2.1 鈣蛋白酶抑制蛋白的結(jié)構(gòu)
        1.2.2 鈣蛋白酶抑制蛋白及鈣蛋白酶系統(tǒng)對肉品質(zhì)的影響
        1.2.3 CAST 基因與肉品質(zhì)的相關(guān)性研究
    1.3 單核苷酸多態(tài)性遺傳標(biāo)記(SNP)的概述
        1.3.1 單核苷酸多態(tài)性遺傳標(biāo)記(SNP)的簡介
        1.3.2 PCR-SSCP 技術(shù)的簡介
        1.3.3 幾種經(jīng)典分子標(biāo)記的比較
    1.4 基因與肉質(zhì)相關(guān)性的研究進(jìn)展
    1.5 本研究的目的和意義
2 材料與方法
    2.1 試驗(yàn)材料
        2.1.1 試驗(yàn)群體
        2.1.2 儀器及設(shè)備
        2.1.3 主要的試劑
        2.1.4 主要藥品及試劑的配制
    2.2 試驗(yàn)方法
        2.2.1 實(shí)驗(yàn)技術(shù)路線
        2.2.2 血樣的采集及肉質(zhì)的測定
        2.2.3 DNA 的提取及檢測
        2.2.4 目的基因的擴(kuò)增
        2.4.5 聚丙烯酞胺凝膠電泳 PCR-SSCP 分析
        2.4.6 蘇尼特羊 CAST 基因的克隆測序
        2.4.7 數(shù)據(jù)分析方法
3 結(jié)果與分析
    3.1 血液基因組 DNA 電泳結(jié)果
    3.2 CAST 基因 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
        3.2.1 引物 P1 的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
        3.2.2 引物 P2 的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
        3.2.3 引物 P3 的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
        3.2.4 引物 P4 的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
        3.2.5 引物 P5 的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
        3.2.6 引物 P6 的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
        3.2.7 引物 P9 的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
        3.2.8 PCR 擴(kuò)增結(jié)果小結(jié)
    3.3 CAST 基因 PCR-SSCP 檢測結(jié)果
        3.3.1 引物 P1 的 SSCP 檢測結(jié)果
        3.3.2 引物 P2 的 PCR 檢測結(jié)果
        3.3.3 引物 P3 PCR 檢測結(jié)果
        3.3.4 引物 P4 的 PCR 檢測結(jié)果
        3.3.5 引物 P5 的 PCR 檢測結(jié)果
        3.3.6 引物 P6 的 PCR 檢測結(jié)果
        3.3.7 引物 P9 的 PCR 檢測結(jié)果
    3.4 蘇尼特羊 CAST 基因不同基因型的 DNA 測序
        3.4.1 P1 位點(diǎn)的不同基因型測序結(jié)果
        3.4.2 P4 位點(diǎn)的不同基因型測序結(jié)果
        3.4.3 P5 位點(diǎn)的不同基因型測序結(jié)果
        3.4.4 P6 位點(diǎn)的不同基因型測序結(jié)果
    3.5 蘇尼特羊 CAST 基因基因頻率和基因型頻率分析
    3.6 蘇尼特羊 CAST 遺傳多態(tài)性分析
    3.7 蘇尼特羊 CAST 基因與肉質(zhì)性狀相關(guān)性分析
        3.7.1 肉質(zhì)性狀的統(tǒng)計(jì)
        3.7.2 P1 位點(diǎn)的不同基因型對肉質(zhì)性狀的影響
        3.7.3 P4 位點(diǎn)的不同基因型對肉質(zhì)性狀的影響
        3.7.4 P5 位點(diǎn)的不同基因型對肉質(zhì)性狀的影響
        3.7.5 P6 位點(diǎn)的不同基因型對肉質(zhì)性狀的影響
4 討論
    4.1 試驗(yàn)材料的選擇
    4.2 影響 PCR-SSCP 檢測的因素
        4.2.1 影響 PCR 反應(yīng)因素
        4.2.2 SSCP 分析的影響因素
    4.3 基因突變與蘇尼特羊肉質(zhì)性狀的分析
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
作者簡介


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3674498