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豬偽狂犬病病毒山西分離株gE全基因的遺傳變異多樣性及流行特點(diǎn)分析

發(fā)布時(shí)間:2022-08-09 16:59
  為了研究當(dāng)前山西省豬偽狂犬。≒R)的流行特點(diǎn)及遺傳變異情況,對山西分離的3株豬偽狂犬病病毒(PRV)分離株(SXQX株、SXTG株和SXYP株)的gE全基因進(jìn)行了擴(kuò)增、克隆和測序(已被GenBank收錄)。并將gE全基因序列和推導(dǎo)出的氨基酸序列與不同國家和地區(qū)的主要流行株進(jìn)行了遺傳變異多樣性分析。結(jié)果顯示,3株P(guān)RV分離株的gE全基因序列之間核苷酸及推導(dǎo)的氨基酸序列同源性分別為99.7%~100.0%和99.5%~100.%,與34株不同國家和地區(qū)的PRV參考株之間同源性分別為97.1%~100.0%和94.6%~100.0%,與歐美分離株的同源性分別為97.1%~97.6%和94.6%~95.7%,與2012年以來我國不同省份分離株的同源性分別為98.8%~100.0%和98.1%~100.0%,與2012年以前分離的經(jīng)典毒株同源性分別為98.4%~99.7%和97.2%~99.3%。PRV gE全基因組序列的進(jìn)化分析表明,3株P(guān)RV分離株屬于亞洲基因群中2012年以來國內(nèi)不同地區(qū)相繼分離的PRV變異株群,而與2012年前分離的經(jīng)典強(qiáng)毒株群親緣關(guān)系較遠(yuǎn),與歐美基因群親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。進(jìn)... 

【文章頁數(shù)】:9 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 PRV陽性病料來源
    1.2 主要試劑
    1.3 PRV gE蛋白ELISA抗體檢測
    1.4 PRV的分離與鑒定
    1.5 引物設(shè)計(jì)及合成
    1.6 PRV病毒基因組的提取
    1.7 PRV gE全基因的PCR擴(kuò)增
    1.8 PRV gE全基因的克隆、序列測定
    1.9 PRV gE全基因序列的比對分析
2 結(jié)果
    2.1 免疫與生產(chǎn)情況調(diào)查
    2.2 PR野毒感染gE抗體檢測結(jié)果
    2.3 PRV gE全基因的擴(kuò)增結(jié)果
    2.4 PRV gE全基因的測序結(jié)果
    2.5 PRV gE全基因核苷酸序列分析
    2.6 PRV gE全基因系統(tǒng)發(fā)生樹分析
    2.7 PRV gE基因氨基酸序列分析
3 討論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬偽狂犬病病毒貴州部分流行株的gE基因變異[J]. 石遠(yuǎn)菊,湯德元,曾智勇,黃濤,王彬,韋冠東,胡玲玲,龍冬梅,楊偉,葉麗.  中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(09)
[2]山西省豬偽狂犬病野毒感染血清學(xué)調(diào)查[J]. 雷宇平,寧艷,孫杰,雷沖.  中國動(dòng)物檢疫. 2015(09)
[3]豬偽狂犬病病毒泰州株的分離鑒定[J]. 郭廣富,曹軍平,朱愛萍,金彩蓮,戴麗紅.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(03)
[4]偽狂犬病病毒BJ/YT株毒力相關(guān)基因gE和TK序列分析[J]. 鐘承,劉蕾,張樂天,王巨實(shí),王安琦,陸寶生,楊萬蓮,呂艷麗.  中國畜牧獸醫(yī). 2014(11)
[5]豬偽狂犬病病毒(PRV-JL株)的分離與鑒定[J]. 馬興杰,羅亞坤,崔尚金.  養(yǎng)豬. 2014(05)
[6]豬偽狂犬病毒湖北株gE基因的克隆與序列分析[J]. 郭銳,田永祥,周丹娜,段正贏,楊克禮,裴小英,王紅,廖仁芳,羅詠梅,劉心建.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(25)
[7]河南省及周邊省份豬群中大面積感染豬偽狂犬病毒的病因分析[J]. 常洪濤,劉慧敏,郭占達(dá),杜季梅,趙軍,陳陸,楊霞,王新衛(wèi),姚惠霞,王川慶.  病毒學(xué)報(bào). 2014(04)
[8]豬偽狂犬病病毒變異株的分離鑒定及其gE基因的分子特征[J]. 趙鴻遠(yuǎn),彭金美,安同慶,李琳,冷超糧,陳家锃,王倩,常丹,張秋月,蔡雪輝,童光志,田志軍.  中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(07)
[9]豬偽狂犬病病毒山西株胸苷激酶基因序列分析[J]. 樊振華,孟帆,吳忻,劉文俊,姚敬明,王娟萍,韓一超,米瑞娟,雷宇平.  中國畜牧獸醫(yī). 2014(04)
[10]偽狂犬病病毒Guizhou-DY株的分離鑒定及致病性研究[J]. 郝飛,湯德元,李春燕,曾智勇,羅險(xiǎn)峰,甘振磊,劉建,王洪光.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(11)

博士論文
[1]偽狂犬病病毒主要毒力基因功能的研究[D]. 陽愛國.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005



本文編號:3672937

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