發(fā)布時(shí)間：2022-08-02 17:00

　　本試驗(yàn)旨在調(diào)查近年來新發(fā)的犬圓環(huán)病毒（canine circovirus,CCV）在重慶地區(qū)的流行情況,探索重慶流行毒株的特性。本研究利用PCR方法對(duì)2017年采集于重慶地區(qū)的100份犬血清樣品進(jìn)行CCV核酸檢測(cè),對(duì)所得CCV陽性樣品進(jìn)行全基因組擴(kuò)增與測(cè)序,并利用MegAlign、Mega 6.0和RDP4等軟件對(duì)分離到的重慶CCV毒株進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,重慶地區(qū)100份犬血清中共有4份為CCV陽性,陽性率為4%,從4份陽性樣品中共獲得3株不同的CCV基因組（CQ76、CQ79和CQ82）,全長基因組序列均為2 062 nt,與此前報(bào)道長度為2 063 nt的CCV基因組相比缺少了一個(gè)堿基,該堿基位于5′-基因間隔區(qū)內(nèi)莖環(huán)結(jié)構(gòu)的下游。3個(gè)毒株的兩個(gè)ORF之間5′末端間隔區(qū)和3′末端間隔區(qū)長度分別為134（1 929-2 062 nt）和203 nt（913-1 115 nt）。CQ76、CQ79和CQ82的同源性在99.8%～100%之間,其中CQ76與CQ82僅在第2 019位點(diǎn)存在同義突變;所獲得的3個(gè)重慶毒株與國內(nèi)外報(bào)道的其他CCV基因組序列同源性為82.7%～97.1%,其中,... 

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

基因組全長擴(kuò)增結(jié)果

陽性樣品PCR擴(kuò)增結(jié)果

CQ76、CQ79和CQ82與參考毒株基因組核苷酸同源性分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]犬圓環(huán)病毒Rep基因SYBR GreenⅠreal-time PCR方法的建立及應(yīng)用[J]. 韓知曉,杜倩,汪偉,辛佳亮,閆修魁,梁瑩瑩,朱遠(yuǎn)致,何玄,曹亮,孫文超,胡傳活,鄭敏.  中國獸醫(yī)科學(xué). 2019(12)
[2]犬圓環(huán)病毒Cap蛋白的生物信息學(xué)分析及原核表達(dá)[J]. 汪偉,辛佳亮,杜倩,韓知曉,易馳喆,閉璟珊,曹亮,莊忻雨,張赫,鄭敏,孫文超,魯會(huì)軍,金寧一.  中國動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2020(02)
[3]四川部分地區(qū)犬圓環(huán)病毒的病原檢測(cè)及基因組特征[J]. 嚴(yán)楠,馮帆,李明翔,湯承,岳華.  中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(03)
[4]犬圓環(huán)病毒ORF3基因的克隆及表達(dá)載體的構(gòu)建[J]. 孫文超,汪偉,曹亮,趙翠青,趙海洋,劉立明,孟娟,韓繼成,許汪,王茂鵬,陳征,張涵,郭丹丹,陸祎婷,夏秀秀,鄭敏,魯會(huì)軍,金寧一.  中國病原生物學(xué)雜志. 2018(02)
[5]犬圓環(huán)病毒及犬細(xì)小病毒雙重PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 曹亮,孫文超,魯會(huì)軍,田明堯,劉云霞,謝長占,趙冠宇,韓繼成,肖鵬鵬,張金勇,錢愛東,金寧一.  中國獸醫(yī)科學(xué). 2017(09)
[6]犬圓環(huán)病毒實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 孫文超,解長占,趙冠宇,曹亮,鄭敏,曹慧慧,張紅云,韋顯凱,韓繼成,溫樹波,肖朋朋,靖杰,張萍,魯會(huì)軍,金寧一.  動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2017(05)
[7]犬圓環(huán)病毒全基因組克隆與序列分析[J]. 孫文超,曹慧慧,鄭敏,徐素萍,張紅云,韋顯凱,蘇姣秀,何杰勇.  病毒學(xué)報(bào). 2016(04)



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