寧夏地區(qū)牛源金黃色葡萄球菌β-內(nèi)酰胺酶的分析及作用方式的研究
發(fā)布時(shí)間:2022-07-13 20:34
旨在深入了解寧夏地區(qū)牛源金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus, SA)所產(chǎn)生β-內(nèi)酰胺酶的進(jìn)化及結(jié)構(gòu)特征并揭示其作用方式。分別以藥敏試驗(yàn)和PCR方法檢測(cè)5種β-內(nèi)酰胺類(lèi)藥物耐藥情況和耐藥基因;通過(guò)生物信息學(xué)手段對(duì)檢出的β-內(nèi)酰胺酶BlaZ作進(jìn)化分析及結(jié)構(gòu)功能預(yù)測(cè);利用分子對(duì)接和動(dòng)力學(xué)模擬,分析BlaZ的作用方式。結(jié)果表明,青霉素類(lèi)藥物的耐藥率明顯高于頭孢菌素;blaZ基因檢出率為82.37%,并檢出SA中較少報(bào)道的blaZTEM-1基因,檢出率為26.05%;進(jìn)化分析可知,BlaZ屬于A型β-內(nèi)酰胺酶,包含63個(gè)重要且承受進(jìn)化壓力的蹤跡殘基;分子對(duì)接發(fā)現(xiàn),BlaZ易與青霉素類(lèi)藥物及阿維巴坦等抑制劑結(jié)合并形成穩(wěn)定復(fù)合物;動(dòng)力學(xué)模擬顯示,BlaZ的結(jié)構(gòu)柔性小于同型酶TEM-1和TEM-52,其中Ω-loop區(qū)域柔性存在差異(P<0.05)且能影響與藥物的作用,即該區(qū)域柔性與結(jié)合活性呈正相關(guān);BlaZ分別與氨芐西林和頭孢噻呋結(jié)合時(shí)結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性差異顯著(P<0.05)。寧夏地區(qū)牛源SA產(chǎn)生的β-內(nèi)酰胺酶BlaZ屬A型,并從菌株中檢出blaZ...
【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 試驗(yàn)菌株
1.1.2 培養(yǎng)基及試劑
1.2 方法
1.2.1 藥敏試驗(yàn)
1.2.2 基因組DNA提取
1.2.3 β-內(nèi)酰胺酶基因檢測(cè)
1.2.4 進(jìn)化分析
1.2.5 結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
1.2.6 結(jié)構(gòu)對(duì)比
1.2.7 分子對(duì)接
1.2.8 分子動(dòng)力學(xué)模擬
2 結(jié) 果
2.1 藥敏試驗(yàn)
2.2 β-內(nèi)酰胺酶基因檢測(cè)
2.3 進(jìn)化分析
2.4 結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.5 結(jié)構(gòu)對(duì)比
2.6 分子對(duì)接
2.7 分子動(dòng)力學(xué)模擬
2.8 抑制劑與β-內(nèi)酰胺酶作用分析
3 討 論
4 結(jié) 論
本文編號(hào):3660722
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 試驗(yàn)菌株
1.1.2 培養(yǎng)基及試劑
1.2 方法
1.2.1 藥敏試驗(yàn)
1.2.2 基因組DNA提取
1.2.3 β-內(nèi)酰胺酶基因檢測(cè)
1.2.4 進(jìn)化分析
1.2.5 結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
1.2.6 結(jié)構(gòu)對(duì)比
1.2.7 分子對(duì)接
1.2.8 分子動(dòng)力學(xué)模擬
2 結(jié) 果
2.1 藥敏試驗(yàn)
2.2 β-內(nèi)酰胺酶基因檢測(cè)
2.3 進(jìn)化分析
2.4 結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.5 結(jié)構(gòu)對(duì)比
2.6 分子對(duì)接
2.7 分子動(dòng)力學(xué)模擬
2.8 抑制劑與β-內(nèi)酰胺酶作用分析
3 討 論
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本文編號(hào):3660722
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