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3株臨床分離的豬流行性腹瀉病毒S基因克隆及序列分析

發(fā)布時(shí)間:2022-07-09 16:01
  對(duì)臨床分離鑒定的3株豬流行性腹瀉病毒(PEDV)的S基因進(jìn)行克隆及序列分析,對(duì)豐富我國PEDV的遺傳衍化特征具有重要意義。S基因序列分析發(fā)現(xiàn),JX18毒株與CV777親緣關(guān)系較近,核苷酸同源性為99.71%,氨基酸同源性95.7%,屬于G1-b進(jìn)化分支。JX18毒株與CV777經(jīng)典毒株S蛋白氨基酸序列相比較,不存在氨基酸的插入或缺失,在中和表位區(qū)及已鑒定抗原表位區(qū)僅有一處氨基酸突變。SD18、JingTai18與PEDV CV777親緣關(guān)系較遠(yuǎn),核苷酸同源性分別為93.64%和92.64%,S蛋白氨基酸序列同源性分別為93%和93.5%。SD18和JingTai18位于G2-b進(jìn)化分支。SD18與JingTai18株與CV777經(jīng)典毒株相比,S蛋白氨基酸序列中存在插入缺失及多位點(diǎn)的氨基酸突變。研究結(jié)果為進(jìn)一步了解我國PEDV流行及變異情況提供了數(shù)據(jù)支持。 

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料
        1.1.1 試劑
        1.1.2 毒株
        1.1.3 儀器設(shè)備
    1.2 方法
        1.2.1 引物設(shè)計(jì)
        1.2.2 S基因擴(kuò)增
        1.2.3 PEDV S基因蛋白質(zhì)序列分析
2 結(jié)果
    2.1 PEDV S基因RT-PCR結(jié)果
    2.2 PEDV S基因序列及蛋白質(zhì)序列分析
    2.3 PEDV S蛋白遺傳進(jìn)化分析
3 討論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]PEDV中國流行株和疫苗株S蛋白免疫反應(yīng)性差異分析[J]. 陳靜,楊盼盼,雷喜梅,王曉夢(mèng),高冬生,常洪濤,楊霞,陳陸,趙軍,王川慶.  中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(10)
[2]豬流行性腹瀉病毒S基因研究進(jìn)展[J]. 陳弟詩,任玉鵬,張斌,李麗,聶艷如,周莉媛.  動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2014(07)
[3]PEDV S蛋白B細(xì)胞抗原表位的篩選和鑒定[J]. 孫東波,朗洪武,時(shí)洪艷,陳建飛,崔曉辰,王承寶,佟有恩,馮力.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2007(09)



本文編號(hào):3657404

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