1株類NADC30與類JXA1重組的豬繁殖與呼吸綜合征病毒基因組遺傳特征分析
發(fā)布時間:2022-07-03 12:57
旨在分析本實驗室2017年從臨床病料中分離的1株豬繁殖與呼吸綜合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)的分子遺傳特征,測定了其全基因組序列,并運用生物信息學(xué)軟件對其遺傳特點進行了分析。結(jié)果顯示,該毒株基因組全長15 054 bp,與代表性毒株VR-2332、NADC30、CH-1a、JXA1和QYYZ的核苷酸相似性分別為84.5%、93.4%、84.2%、83.9%和82.1%。系統(tǒng)進化樹分析顯示,該毒株與NADC30-like毒株處于同一進化分支,屬于lineage 1�;贕P5和Nsp2蛋白的氨基酸序列分析顯示,分離株GP5蛋白糖基化位點位于34位、44位和51位;在37—45 aa的線性表位區(qū)較為保守,在27—30 aa和37—45 aa的線性表位區(qū)存在特異的氨基酸位點變異;Nsp2蛋白存在NADC30-lke毒株特征性的131個(323—433位、483位、504—522位)不連續(xù)氨基酸的缺失�;蛑亟M分析顯示,該毒株以類NADC30為主要親本、以類JXA1為次要親本,在Nsp2的氨基端(...
【文章頁數(shù)】:11 頁
【部分圖文】:
Nsp2高變區(qū)氨基酸序列比對
HeNLH2017基因序列的擴增
基于GP5序列(A)和Nsp2高變區(qū)序列(B)構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹
【參考文獻】:
期刊論文
[1]福建省14株P(guān)RRSV-2全基因組特性分析[J]. 魏春華,夏偉,馬英,李娜,吳熠丹,勾明郗,林志峰,戴愛玲,楊小燕,劉建奎. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2019(09)
[2]山東及周邊部分地區(qū)豬繁殖與呼吸綜合征病毒的變異與遺傳演化分析[J]. 胡棟,徐煜琳,朱迎春,趙情,王亭亭,龐恒,李傳剛,于江,常維山,吳家強,彭軍. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2019(06)
[3]河北省PRRSV流行毒株的分離鑒定[J]. 劉玄福,郝建香,宋濤,辛樹陽,張守聰,田瑞,芮萍,王秋悅,劉謝榮,馬增軍. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2019(02)
[4]中國豬繁殖與呼吸綜合征病毒流行歷史及現(xiàn)狀[J]. 郭振華,陳鑫鑫,李睿,喬松林,郭軍慶,張改平. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2018(01)
[5]2012―2013年豬繁殖與呼吸綜合征病毒河南流行株的分離鑒定及分子流行病學(xué)調(diào)查[J]. 周峰,常洪濤,趙軍,陳陸,王新衛(wèi),劉紅英,姚慧霞,王川慶,楊霞. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2014(09)
[6]豬繁殖與呼吸綜合征病毒的分離與初步鑒定[J]. 楊漢春,管山紅,尹曉敏,甘孟侯. 中國獸醫(yī)雜志. 1997(10)
[7]從疑似PRRS流產(chǎn)胎兒分離PRRSV的研究[J]. 郭寶清,陳章水,劉文興,崔益洙. 中國畜禽傳染病. 1996(02)
本文編號:3654891
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【部分圖文】:
Nsp2高變區(qū)氨基酸序列比對
HeNLH2017基因序列的擴增
基于GP5序列(A)和Nsp2高變區(qū)序列(B)構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹
【參考文獻】:
期刊論文
[1]福建省14株P(guān)RRSV-2全基因組特性分析[J]. 魏春華,夏偉,馬英,李娜,吳熠丹,勾明郗,林志峰,戴愛玲,楊小燕,劉建奎. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2019(09)
[2]山東及周邊部分地區(qū)豬繁殖與呼吸綜合征病毒的變異與遺傳演化分析[J]. 胡棟,徐煜琳,朱迎春,趙情,王亭亭,龐恒,李傳剛,于江,常維山,吳家強,彭軍. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2019(06)
[3]河北省PRRSV流行毒株的分離鑒定[J]. 劉玄福,郝建香,宋濤,辛樹陽,張守聰,田瑞,芮萍,王秋悅,劉謝榮,馬增軍. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2019(02)
[4]中國豬繁殖與呼吸綜合征病毒流行歷史及現(xiàn)狀[J]. 郭振華,陳鑫鑫,李睿,喬松林,郭軍慶,張改平. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2018(01)
[5]2012―2013年豬繁殖與呼吸綜合征病毒河南流行株的分離鑒定及分子流行病學(xué)調(diào)查[J]. 周峰,常洪濤,趙軍,陳陸,王新衛(wèi),劉紅英,姚慧霞,王川慶,楊霞. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2014(09)
[6]豬繁殖與呼吸綜合征病毒的分離與初步鑒定[J]. 楊漢春,管山紅,尹曉敏,甘孟侯. 中國獸醫(yī)雜志. 1997(10)
[7]從疑似PRRS流產(chǎn)胎兒分離PRRSV的研究[J]. 郭寶清,陳章水,劉文興,崔益洙. 中國畜禽傳染病. 1996(02)
本文編號:3654891
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