旨在分析本實(shí)驗(yàn)室2017年從臨床病料中分離的1株豬繁殖與呼吸綜合征病毒（porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV）的分子遺傳特征,測(cè)定了其全基因組序列,并運(yùn)用生物信息學(xué)軟件對(duì)其遺傳特點(diǎn)進(jìn)行了分析。結(jié)果顯示,該毒株基因組全長(zhǎng)15 054 bp,與代表性毒株VR-2332、NADC30、CH-1a、JXA1和QYYZ的核苷酸相似性分別為84.5%、93.4%、84.2%、83.9%和82.1%。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析顯示,該毒株與NADC30-like毒株處于同一進(jìn)化分支,屬于lineage 1�；贕P5和Nsp2蛋白的氨基酸序列分析顯示,分離株GP5蛋白糖基化位點(diǎn)位于34位、44位和51位;在37—45 aa的線性表位區(qū)較為保守,在27—30 aa和37—45 aa的線性表位區(qū)存在特異的氨基酸位點(diǎn)變異;Nsp2蛋白存在NADC30-lke毒株特征性的131個(gè)（323—433位、483位、504—522位）不連續(xù)氨基酸的缺失。基因重組分析顯示,該毒株以類NADC30為主要親本、以類JXA1為次要親本,在Nsp2的氨基端（... 

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【部分圖文】：

Nsp2高變區(qū)氨基酸序列比對(duì)

HeNLH2017基因序列的擴(kuò)增

基于GP5序列(A)和Nsp2高變區(qū)序列(B)構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3654891