福建省部分豬場等孢球蟲感染的調(diào)查及其PCR和LAMP檢測方法的建立
發(fā)布時間:2022-05-08 18:07
豬等孢球蟲主要寄生于空腸與回腸,可致三周齡以內(nèi)的哺乳仔豬出現(xiàn)腹瀉和體重下降等臨床癥狀,常給養(yǎng)殖戶的經(jīng)濟(jì)利益帶來巨大的損害。在福建省9個地區(qū)的29個豬場,檢測1-8周齡仔豬糞便樣品2173份,檢測結(jié)果為:存在豬等孢球蟲(Isospora suis)的陽性場28個,占檢測豬場數(shù)的96.56%;豬等孢球蟲卵囊總陽性率為9.76%(212/2173)。不同豬場間仔豬等孢球蟲卵囊陽性率最高為27.78%,陽性豬每克糞便卵囊數(shù)(OPG值)在25~115100之間;卵囊陽性率與對數(shù)化的OPG值呈顯著正相關(guān)(R=0.445,P=0.016)。福建省沿海六個地區(qū)的平均氣溫與豬等孢球蟲的卵囊陽性率呈顯著正相關(guān)(R=0.937,P=0.006)。第1周齡至第8周齡仔豬等孢球蟲卵囊陽性率2.66%~17.46%;2周齡仔豬的OPG值顯著高于其它周齡仔豬(P<0.01);3周齡仔豬的陽性率顯著高于其他周齡(P<0.01)。不使用抗球蟲藥物與使用其它抗球蟲藥的豬場,其仔豬等孢球蟲陽性率、OPG值均顯著高于使用百球清的豬場(P<0.01,P<0.05)。另外發(fā)現(xiàn),高床墊料飼養(yǎng)育成豬的等孢球蟲...
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 豬等孢球蟲概述
1.1 豬等孢球蟲的分類及生物學(xué)特征
1.1.1 豬等孢球蟲的分類
1.1.2 豬等孢球蟲的形態(tài)特征
1.1.3 豬等孢球蟲的生活史
2 球蟲卵囊的分離方法
2.1 糞便中分離球蟲卵囊的主要方法
2.1.1 飽和鹽水漂浮法
2.1.2 Sheather's蔗糖溶液漂浮法
2.2 組織中分離球蟲卵囊的主要方法
2.2.1 飽和硫酸鎂溶液漂浮法
2.2.2 改良韋氏法(濃硫酸-重鉻酸鈉卵囊洗液處理法)
2.3 單卵囊分離的主要方法
2.3.1 玻璃毛細(xì)吸管分離法
2.3.2 瓊脂分離法
2.3.3 玻璃紙分離法
3 豬球蟲的分子生物學(xué)診斷方法
3.1 酶聯(lián)免疫吸附檢測法(ELISA檢測法)
3.2 自體熒光顯微鏡檢測技術(shù)
3.3 PCR技術(shù)
3.3.1 普通PCR
3.3.2 巢式PCR(Nested PCR)
3.3.3 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)
3.4 LAMP技術(shù)
3.4.1 LAMP技術(shù)的原理
3.4.2 LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測方法
3.4.3 LAMP技術(shù)與PCR技術(shù)的比較
3.4.4 LAMP檢測方法在寄生蟲學(xué)上的應(yīng)用及展望
3.5 本試驗(yàn)的研究目的及意義
第二章 福建省部分豬場豬等孢球蟲感染情況的調(diào)查與分析
1 材料與方法
1.1 樣品的采集
1.2 卵囊檢查及鑒定
1.3 OPG值測定
1.4 統(tǒng)計方法
2 結(jié)果與分析
2.1 總體檢測情況
2.2 不同豬場仔豬等孢球蟲的感染情況
2.3 仔豬等孢球蟲卵囊陽性率與感染強(qiáng)度的關(guān)系
2.4 豬場規(guī)模對仔豬等孢球蟲感染的影響
2.5 仔豬等孢球蟲感染的地區(qū)差異
2.6 仔豬等孢球蟲感染的周齡差異
2.7 不同飼養(yǎng)地面對豬感染等孢球蟲的影響
2.8 抗球蟲藥物對仔豬感染等孢球蟲的影響
2.8.1 不同豬場間的比較
2.8.2 不同周齡仔豬的比較
3 小結(jié)與討論
第三章 豬等孢球蟲的PCR診斷方法
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 蟲株與菌株
1.1.2 主要試劑
1.1.3 主要儀器
1.2 方法
1.2.1 卵囊的收集與純化
1.2.2 卵囊DNA提取
1.2.3 目的基因的PCR擴(kuò)增
1.2.4 目的基因的克隆
1.2.5 敏感性試驗(yàn)
1.2.6 特異性試驗(yàn)
1.2.7 臨床中特定個數(shù)卵囊的PCR檢測
2 結(jié)果及分析
2.1 PCR反應(yīng)溫度的優(yōu)化
2.2 PCR反應(yīng)模板DNA量的優(yōu)化
2.3 PCR反應(yīng)引物濃度的優(yōu)化
2.4 重組質(zhì)粒的雙酶切鑒定
2.5 重組質(zhì)粒測序結(jié)果
2.6 PCR特異性試驗(yàn)
2.7 PCR敏感性試驗(yàn)
2.8 臨床中特定個數(shù)卵囊PCR的檢測結(jié)果
3 小結(jié)與討論
3.1 豬等孢球蟲卵囊DNA提取方法的優(yōu)化
3.2 PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化
3.3 質(zhì)粒及卵囊檢測閥值的確定
第四章 豬等孢球蟲LAMP檢測方法的建立
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 蟲株與菌株
1.1.2 主要試劑
1.1.3 主要儀器
1.2 方法
1.2.1 豬等孢球蟲卵囊的收集與純化
1.2.2 豬等孢球蟲卵囊DNA的提取
1.2.3 目的基因的LAMP擴(kuò)增
1.2.4 特異性試驗(yàn)
1.2.5 敏感性試驗(yàn)
1.2.6 臨床中特定個數(shù)卵囊的LAMP檢測
2 結(jié)果及分析
2.1 LAMP反應(yīng)Bst DNA聚合酶濃度的優(yōu)化結(jié)果
2.2 LAMP反應(yīng)Mg~(2+)濃度的優(yōu)化結(jié)果
2.3 LAMP反應(yīng)dNTPs濃度的優(yōu)化結(jié)果
2.4 LAMP反應(yīng)甜菜堿濃度的優(yōu)化結(jié)果
2.5 LAMP反應(yīng)內(nèi)引物的優(yōu)化結(jié)果
2.6 LAMP特異性試驗(yàn)
2.7 LAMP敏感性試驗(yàn)
2.8 臨床中特定個數(shù)卵囊DNA的LAMP檢測
3 小結(jié)與討論
3.1 豬等孢球蟲LAMP檢測方法的建立及優(yōu)化
3.2 LAMP技術(shù)與PCR技術(shù)敏感性的比較
3.3 LAMP技術(shù)污染的控制
本論文結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
致謝
附表1
附圖1
攻讀學(xué)位期間承擔(dān)的科研任務(wù)與主要成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新田縣養(yǎng)豬場豬球蟲感染情況調(diào)查[J]. 李衛(wèi)華,劉毅. 湖南畜牧獸醫(yī). 2013(01)
[2]微小隱孢子蟲LAMP檢測方法的探索[J]. 史亞東,董海聚,王榮軍,張龍現(xiàn),寧長申,菅復(fù)春. 中國人獸共患病學(xué)報. 2012(12)
[3]酶聯(lián)免疫吸附檢測法的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 伏旭,李培武,賀莉,尹穩(wěn),傅仲學(xué). 氨基酸和生物資源. 2012(03)
[4]湖南省豬球蟲種類及感染狀況研究[J]. 伍慧蘭. 湘南學(xué)院學(xué)報. 2011(05)
[5]福建省部分規(guī);i場球蟲感染情況調(diào)查[J]. 張世忠,江斌,吳勝會,林琳. 養(yǎng)豬. 2011(02)
[6]豬等孢球蟲的分離、分子生物學(xué)初步鑒定及PCR診斷方法的建立[J]. 劉錦,梁全順. 福建畜牧獸醫(yī). 2010(04)
[7]環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增技術(shù)在畜禽疾病診斷中的應(yīng)用[J]. 劉寶山,潘樹德,尹榮煥,沈國順. 中國獸醫(yī)雜志. 2009(07)
[8]云南省昆明市豬球蟲種類的初步調(diào)查[J]. 廖潔穎,胡俊杰. 畜牧與獸醫(yī). 2008(09)
[9]伊川縣規(guī);i場豬球蟲種類及感染情況調(diào)查[J]. 張偉麗,陳亞萍,王天奇. 云南畜牧獸醫(yī). 2008(03)
[10]雞艾美耳球蟲單卵囊分離與種類鑒定[J]. 王鑫,黃兵,趙其平,韓靜芳,韓紅玉,董輝,姜連連. 復(fù)旦學(xué)報(自然科學(xué)版). 2007(06)
碩士論文
[1]福建省豬主要寄生蟲流行現(xiàn)狀研究[D]. 劉錦.福建農(nóng)林大學(xué) 2010
[2]LAMP和PCR檢測單核細(xì)胞增生性李斯特氏菌的研究[D]. 張亞爽.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[3]艾美耳球蟲卵囊染色方法篩選及PCR擴(kuò)增方法的建立[D]. 李娜.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號:3652127
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 豬等孢球蟲概述
1.1 豬等孢球蟲的分類及生物學(xué)特征
1.1.1 豬等孢球蟲的分類
1.1.2 豬等孢球蟲的形態(tài)特征
1.1.3 豬等孢球蟲的生活史
2 球蟲卵囊的分離方法
2.1 糞便中分離球蟲卵囊的主要方法
2.1.1 飽和鹽水漂浮法
2.1.2 Sheather's蔗糖溶液漂浮法
2.2 組織中分離球蟲卵囊的主要方法
2.2.1 飽和硫酸鎂溶液漂浮法
2.2.2 改良韋氏法(濃硫酸-重鉻酸鈉卵囊洗液處理法)
2.3 單卵囊分離的主要方法
2.3.1 玻璃毛細(xì)吸管分離法
2.3.2 瓊脂分離法
2.3.3 玻璃紙分離法
3 豬球蟲的分子生物學(xué)診斷方法
3.1 酶聯(lián)免疫吸附檢測法(ELISA檢測法)
3.2 自體熒光顯微鏡檢測技術(shù)
3.3 PCR技術(shù)
3.3.1 普通PCR
3.3.2 巢式PCR(Nested PCR)
3.3.3 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)
3.4 LAMP技術(shù)
3.4.1 LAMP技術(shù)的原理
3.4.2 LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測方法
3.4.3 LAMP技術(shù)與PCR技術(shù)的比較
3.4.4 LAMP檢測方法在寄生蟲學(xué)上的應(yīng)用及展望
3.5 本試驗(yàn)的研究目的及意義
第二章 福建省部分豬場豬等孢球蟲感染情況的調(diào)查與分析
1 材料與方法
1.1 樣品的采集
1.2 卵囊檢查及鑒定
1.3 OPG值測定
1.4 統(tǒng)計方法
2 結(jié)果與分析
2.1 總體檢測情況
2.2 不同豬場仔豬等孢球蟲的感染情況
2.3 仔豬等孢球蟲卵囊陽性率與感染強(qiáng)度的關(guān)系
2.4 豬場規(guī)模對仔豬等孢球蟲感染的影響
2.5 仔豬等孢球蟲感染的地區(qū)差異
2.6 仔豬等孢球蟲感染的周齡差異
2.7 不同飼養(yǎng)地面對豬感染等孢球蟲的影響
2.8 抗球蟲藥物對仔豬感染等孢球蟲的影響
2.8.1 不同豬場間的比較
2.8.2 不同周齡仔豬的比較
3 小結(jié)與討論
第三章 豬等孢球蟲的PCR診斷方法
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 蟲株與菌株
1.1.2 主要試劑
1.1.3 主要儀器
1.2 方法
1.2.1 卵囊的收集與純化
1.2.2 卵囊DNA提取
1.2.3 目的基因的PCR擴(kuò)增
1.2.4 目的基因的克隆
1.2.5 敏感性試驗(yàn)
1.2.6 特異性試驗(yàn)
1.2.7 臨床中特定個數(shù)卵囊的PCR檢測
2 結(jié)果及分析
2.1 PCR反應(yīng)溫度的優(yōu)化
2.2 PCR反應(yīng)模板DNA量的優(yōu)化
2.3 PCR反應(yīng)引物濃度的優(yōu)化
2.4 重組質(zhì)粒的雙酶切鑒定
2.5 重組質(zhì)粒測序結(jié)果
2.6 PCR特異性試驗(yàn)
2.7 PCR敏感性試驗(yàn)
2.8 臨床中特定個數(shù)卵囊PCR的檢測結(jié)果
3 小結(jié)與討論
3.1 豬等孢球蟲卵囊DNA提取方法的優(yōu)化
3.2 PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化
3.3 質(zhì)粒及卵囊檢測閥值的確定
第四章 豬等孢球蟲LAMP檢測方法的建立
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 蟲株與菌株
1.1.2 主要試劑
1.1.3 主要儀器
1.2 方法
1.2.1 豬等孢球蟲卵囊的收集與純化
1.2.2 豬等孢球蟲卵囊DNA的提取
1.2.3 目的基因的LAMP擴(kuò)增
1.2.4 特異性試驗(yàn)
1.2.5 敏感性試驗(yàn)
1.2.6 臨床中特定個數(shù)卵囊的LAMP檢測
2 結(jié)果及分析
2.1 LAMP反應(yīng)Bst DNA聚合酶濃度的優(yōu)化結(jié)果
2.2 LAMP反應(yīng)Mg~(2+)濃度的優(yōu)化結(jié)果
2.3 LAMP反應(yīng)dNTPs濃度的優(yōu)化結(jié)果
2.4 LAMP反應(yīng)甜菜堿濃度的優(yōu)化結(jié)果
2.5 LAMP反應(yīng)內(nèi)引物的優(yōu)化結(jié)果
2.6 LAMP特異性試驗(yàn)
2.7 LAMP敏感性試驗(yàn)
2.8 臨床中特定個數(shù)卵囊DNA的LAMP檢測
3 小結(jié)與討論
3.1 豬等孢球蟲LAMP檢測方法的建立及優(yōu)化
3.2 LAMP技術(shù)與PCR技術(shù)敏感性的比較
3.3 LAMP技術(shù)污染的控制
本論文結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
致謝
附表1
附圖1
攻讀學(xué)位期間承擔(dān)的科研任務(wù)與主要成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新田縣養(yǎng)豬場豬球蟲感染情況調(diào)查[J]. 李衛(wèi)華,劉毅. 湖南畜牧獸醫(yī). 2013(01)
[2]微小隱孢子蟲LAMP檢測方法的探索[J]. 史亞東,董海聚,王榮軍,張龍現(xiàn),寧長申,菅復(fù)春. 中國人獸共患病學(xué)報. 2012(12)
[3]酶聯(lián)免疫吸附檢測法的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 伏旭,李培武,賀莉,尹穩(wěn),傅仲學(xué). 氨基酸和生物資源. 2012(03)
[4]湖南省豬球蟲種類及感染狀況研究[J]. 伍慧蘭. 湘南學(xué)院學(xué)報. 2011(05)
[5]福建省部分規(guī);i場球蟲感染情況調(diào)查[J]. 張世忠,江斌,吳勝會,林琳. 養(yǎng)豬. 2011(02)
[6]豬等孢球蟲的分離、分子生物學(xué)初步鑒定及PCR診斷方法的建立[J]. 劉錦,梁全順. 福建畜牧獸醫(yī). 2010(04)
[7]環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增技術(shù)在畜禽疾病診斷中的應(yīng)用[J]. 劉寶山,潘樹德,尹榮煥,沈國順. 中國獸醫(yī)雜志. 2009(07)
[8]云南省昆明市豬球蟲種類的初步調(diào)查[J]. 廖潔穎,胡俊杰. 畜牧與獸醫(yī). 2008(09)
[9]伊川縣規(guī);i場豬球蟲種類及感染情況調(diào)查[J]. 張偉麗,陳亞萍,王天奇. 云南畜牧獸醫(yī). 2008(03)
[10]雞艾美耳球蟲單卵囊分離與種類鑒定[J]. 王鑫,黃兵,趙其平,韓靜芳,韓紅玉,董輝,姜連連. 復(fù)旦學(xué)報(自然科學(xué)版). 2007(06)
碩士論文
[1]福建省豬主要寄生蟲流行現(xiàn)狀研究[D]. 劉錦.福建農(nóng)林大學(xué) 2010
[2]LAMP和PCR檢測單核細(xì)胞增生性李斯特氏菌的研究[D]. 張亞爽.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[3]艾美耳球蟲卵囊染色方法篩選及PCR擴(kuò)增方法的建立[D]. 李娜.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號:3652127
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