發(fā)布時間：2022-04-27 20:19

　　在全球奶牛繁殖力不斷下降的同時,我國奶牛養(yǎng)殖業(yè)也不能避免地出現(xiàn)了同樣的問題。在過去的半個世紀(jì)里,由于受到經(jīng)濟(jì)利益的驅(qū)動,人們過度地追逐奶牛的高產(chǎn)高效,而忽視繁殖性狀,使得其繁殖性能一直在衰退。本研究使用的是基于BovineSNP50 （54K）芯片對495頭分別來自中英兩國的荷斯坦奶牛的54001個SNP位點(diǎn)進(jìn)行GWAS第1階段的研究結(jié)果,從中選取了RAD54L基因rs108938226位點(diǎn)和RRMl基因rs41771122位點(diǎn)作為研究位點(diǎn),對其進(jìn)行GWAS的第2階段擴(kuò)大群體驗(yàn)證,同時選取PPARy2基因與GPX4基因作為候選基因,在來自2個牛群共計925頭荷斯坦奶牛大群體中進(jìn)行研究,結(jié)果如下：1.RAD54L基因rs108938226位點(diǎn)存在C/T突變,突變前后不引起酶切位點(diǎn)變化,通過CRS-PCR,使得該位點(diǎn)發(fā)生突變時產(chǎn)生Sac I酶切多態(tài)性,在兩個群體中均檢測到CC、CT、TT三種基因型,其中CC基因型頻率略高于CT基因型,兩者基因型頻率均明顯高于TT基因型,C等位基因頻率高于T等位基因頻率。性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明該位點(diǎn)不同基因型在荷斯坦奶牛前3胎總體的產(chǎn)后到初次配種天數(shù)與第1胎產(chǎn)... 

【文章頁數(shù)】：77 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略語表
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 荷斯坦奶牛繁殖性能的相關(guān)研究
        1.1.1 奶牛繁殖性能指標(biāo)
        1.1.2 影響奶牛繁殖性能的因素
    1.2 基于高密度SNP芯片的GWAS的研究進(jìn)展
    1.3 氧化應(yīng)激的相關(guān)研究
        1.3.1 氧化應(yīng)激的產(chǎn)生與危害
        1.3.2 氧化應(yīng)激對奶牛的影響
    1.4 初篩位點(diǎn)所在基因的研究進(jìn)展
        1.4.1 RAD54L基因的研究進(jìn)展
        1.4.2 RRM1基因的研究進(jìn)展
    1.5 參與氧化還原過程的基因的研究進(jìn)展
        1.5.1 PPARγ2基因的研究進(jìn)展
        1.5.2 GPX4的研究進(jìn)展
    1.6 SNP分子標(biāo)記的相關(guān)研究
2 研究目的和意義
3 材料與方法
    3.1 試驗(yàn)材料
        3.1.1 樣本與數(shù)據(jù)采集
        3.1.2 主要儀器設(shè)備
        3.1.3 主要酶和試劑
        3.1.4 主要溶液和試劑的配制
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 奶牛血液基因組DNA提取
        3.2.2 引物設(shè)計及PCR反應(yīng)條件
        3.2.3 瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物
        3.2.4 聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)
        3.2.5 銀染檢測
        3.2.6 PCR-SSCP檢測
        3.2.7 回收純化和測序
        3.2.8 PCR產(chǎn)物的酶切分型(RFLP)
    3.3 群體遺傳學(xué)研究和數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
        3.3.1 群體遺傳學(xué)研究
        3.3.2 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
4 結(jié)果與分析
    4.1 荷斯坦奶牛基因組DNA
    4.2 奶牛繁殖性狀及影響因素分析
    4.3 RAD54L基因
        4.3.1 RAD54L基因目的片段擴(kuò)增
        4.3.2 RAD54L基因多態(tài)性檢測
        4.3.3 RAD54L基因多態(tài)位點(diǎn)的遺傳信息
        4.3.4 RAD54L基因多態(tài)性與荷斯坦奶牛繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析
    4.4 RRM1基因
        4.4.1 RRM1基因目的片段擴(kuò)增
        4.4.2 RRM1基因多態(tài)性檢測
        4.4.3 RRM1基因多態(tài)位點(diǎn)的遺傳信息
        4.4.4 RRM1基因多態(tài)性與荷斯坦奶牛繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析
    4.5 PPARγ2基因
        4.5.1 PPARγ2基因目的片段擴(kuò)增
        4.5.2 PPARγ2基因多態(tài)性檢測
        4.5.3 PPARγ2基因多態(tài)位點(diǎn)的遺傳信息
        4.5.4 PPARγ2基因多態(tài)性與荷斯坦奶牛繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析
    4.6 GPX4基因
5 討論
    5.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法分析
    5.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果的分析討論
        5.2.1 荷斯坦奶牛繁殖狀況與影響因素
        5.2.2 荷斯坦奶牛RAD54L基因多態(tài)性與荷斯坦奶牛的繁殖性狀
        5.2.3 荷斯坦奶牛RRM1基因多態(tài)性與荷斯坦奶牛的繁殖性狀
        5.2.4 荷斯坦奶牛PPARγ2基因多態(tài)性與荷斯坦奶牛的繁殖性狀
        5.2.5 荷斯坦奶牛GPX4基因多態(tài)性
        5.2.6 關(guān)于本研究中的SNP位點(diǎn)
6 總結(jié)
    6.1 主要研究成果
    6.2 本研究的特色和創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
致謝



本文編號：3649106