鑒別檢測裂谷熱病毒NSs缺失型疫苗株與野生株模擬物的雙重熒光定量RT-PCR方法的建立
發(fā)布時間:2022-02-22 13:20
為了建立一種能夠鑒別檢測裂谷熱病毒野毒株與NSs缺失型疫苗株的熒光定量RT-PCR方法,本研究通過對裂谷熱病毒基因組序列進行比較分析,選擇其S節(jié)段NSs基因及L節(jié)段L基因的無二級結構且保守的區(qū)段,分別設計多對引物和探針,通過試驗驗證并優(yōu)化反應條件,篩選出最佳引物和探針的組合,建立了可以快速檢測裂谷熱病毒并區(qū)分NSs基因缺失疫苗株和野毒株的雙重熒光定量RT-PCR方法。利用該方法檢測羊臨床常見病原,結果顯示該方法僅對裂谷熱質粒標準品樣品檢測為陽性,不與羊常見的其他病原出現(xiàn)陽性反應,特異性強;將裂谷熱質粒標準品10倍倍比稀釋后利用本研究建立的方法進行檢測,結果顯示,該方法對NSs和L基因重組質粒標準品的檢測下限分別為10拷貝/μL和100拷貝/μL,敏感度高;重復性實驗結果顯示,該方法組內(nèi)和組間變異系數(shù)均小于2%,重復性好。將NSs缺失型和非缺失型質粒分別轉染細胞,提取核酸,利用本方法進行檢測,結果顯示該方法可有效區(qū)分NSs基因缺失型和非缺失型核酸樣品。本研究建立的雙重熒光定量RT-PCR方法為鑒別野生病毒株和NSs缺失型疫苗株奠定了技術基礎。
【文章來源】:中國預防獸醫(yī)學報. 2020,42(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 主要試劑
1.2 疫苗及相關病原
1.3引物和探針的設計
1.4 重組質粒標準品的構建
1.5 雙重熒光定量RT-PCR方法反應體系的優(yōu)化及標準曲線的建立
1.6 特異性試驗
1.7 敏感性試驗
1.8 重復性試驗
1.9 對野生型和缺失型病毒核酸樣品的檢測
1.10臨床樣品的檢測
2 結果
2.1 雙重熒光定量方法的建立和優(yōu)化
2.2標準曲線的建立
2.3 特異性試驗結果
2.4 敏感性試驗結果
2.5 重復性試驗結果
2.6 野生型和缺失型病毒核酸樣品的檢測
2.7 臨床樣品的檢測
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]山羊皰疹病毒Ⅰ型的分離鑒定與致病性[J]. 郝飛,毛立,李文良,李基棕,楊蕾蕾,張紋紋,孫敏,鐘純燕,劉茂軍,江杰元. 畜牧獸醫(yī)學報. 2018(08)
[2]血清15與21型藍舌病病毒的分離與鑒定[J]. 李文良,毛立,楊蕾蕾,許寶軍,唐朝忠,楊恒,郝飛,張紋紋,邵坤,李華春,江杰元. 西南農(nóng)業(yè)學報. 2018(03)
[3]山羊源副流感病毒3型的分離與分子鑒定[J]. 李文良,毛立,程素平,王秋生,黃加春,張紋紋,楊蕾蕾,江杰元. 畜牧獸醫(yī)學報. 2015(02)
[4]裂谷熱病毒實時熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 蓋微微,遲航,鄭學星,薛向紅,高玉偉,王化磊,王鐵成,趙永坤,馮娜,黃耕,楊松濤,夏咸柱. 中國病原生物學雜志. 2014(01)
[5]裂谷熱病毒熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 楊志紅,李長田,楊宇,白琳,魏蓮,王靜. 中國國境衛(wèi)生檢疫雜志. 2012(03)
[6]裂谷熱病毒TaqMan熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 朱曉文,李林,桑曉宇,高玉偉,胡桂學,馮娜,王鐵成,步志高,夏咸柱. 中國人獸共患病學報. 2012(04)
本文編號:3639527
【文章來源】:中國預防獸醫(yī)學報. 2020,42(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 主要試劑
1.2 疫苗及相關病原
1.3引物和探針的設計
1.4 重組質粒標準品的構建
1.5 雙重熒光定量RT-PCR方法反應體系的優(yōu)化及標準曲線的建立
1.6 特異性試驗
1.7 敏感性試驗
1.8 重復性試驗
1.9 對野生型和缺失型病毒核酸樣品的檢測
1.10臨床樣品的檢測
2 結果
2.1 雙重熒光定量方法的建立和優(yōu)化
2.2標準曲線的建立
2.3 特異性試驗結果
2.4 敏感性試驗結果
2.5 重復性試驗結果
2.6 野生型和缺失型病毒核酸樣品的檢測
2.7 臨床樣品的檢測
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]山羊皰疹病毒Ⅰ型的分離鑒定與致病性[J]. 郝飛,毛立,李文良,李基棕,楊蕾蕾,張紋紋,孫敏,鐘純燕,劉茂軍,江杰元. 畜牧獸醫(yī)學報. 2018(08)
[2]血清15與21型藍舌病病毒的分離與鑒定[J]. 李文良,毛立,楊蕾蕾,許寶軍,唐朝忠,楊恒,郝飛,張紋紋,邵坤,李華春,江杰元. 西南農(nóng)業(yè)學報. 2018(03)
[3]山羊源副流感病毒3型的分離與分子鑒定[J]. 李文良,毛立,程素平,王秋生,黃加春,張紋紋,楊蕾蕾,江杰元. 畜牧獸醫(yī)學報. 2015(02)
[4]裂谷熱病毒實時熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 蓋微微,遲航,鄭學星,薛向紅,高玉偉,王化磊,王鐵成,趙永坤,馮娜,黃耕,楊松濤,夏咸柱. 中國病原生物學雜志. 2014(01)
[5]裂谷熱病毒熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 楊志紅,李長田,楊宇,白琳,魏蓮,王靜. 中國國境衛(wèi)生檢疫雜志. 2012(03)
[6]裂谷熱病毒TaqMan熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 朱曉文,李林,桑曉宇,高玉偉,胡桂學,馮娜,王鐵成,步志高,夏咸柱. 中國人獸共患病學報. 2012(04)
本文編號:3639527
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