野鳥源禽流感病毒(AIV)分離株的遺傳進化及其致病性研究
發(fā)布時間:2022-02-14 16:46
野鳥作為禽流感病毒的天然宿主和原始病毒庫,伴隨著其遷徙的季節(jié)性,跨地域性及長距離性等特點,在禽流感病毒全球范圍內的廣泛傳播中扮演著重要的角色。我國東北地區(qū)生態(tài)環(huán)境豐富多樣,森林、濕地、湖泊、平原及沼澤草甸等自然生境為多種鳥類的棲息繁衍提供了良好的天然條件,是東北亞野鳥遷徙的重要通道。為了掌握該地區(qū)禽流感病毒野生宿主分布特點,掌握其遺傳變異規(guī)律,為防制禽流感提供科學依據(jù),我們在2012年3月至2013年5月對該地區(qū)野鳥禽流感病原進行了調查,并分析了分離株的分子特征、遺傳進化及其對不同宿主的致病性。1.野鳥源禽流感病毒的分離與鑒定2012年3至2013年5月對東北地區(qū)三個省份及河北秦皇島主動開展了野生鳥類禽流感病原分子流行病學調查,共采集樣野鳥個體1279份,包括6個目,30個屬,57個種。通過雞胚傳代分離純化病毒、血凝抑制及RT-PCR確定禽流感病毒亞型,結果有14個野鳥AIV檢測為陽性,陽性率為1.09%。陽性樣本中有7株H3N8亞型,3株H5N1亞型,2株H3N2亞型,1株H6N2,1株H6N6,其中首次從野生雀形目黃眉柳鶯中分離到了一株高致病性H5N1禽流感病毒,首次從野生鴛鴦中分...
【文章來源】:東北林業(yè)大學黑龍江省211工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:102 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 禽流感病毒概述
1.2 禽流感病毒的結構及其生物學功能
1.2.1 表面糖蛋白及其功能
1.2.2 聚合酶蛋白(Polymerase,PB2、PB1、PA)及其功能
1.2.3 核蛋白(Nucleoprotein,NP)及其功能
1.2.4 基質蛋白(Matrix proteins,M)及其功能
1.2.5 非結構蛋白(Nonstructural proteins,NS)及其功能
1.3 野鳥在禽流感流行病學中的地位
1.3.1 東北地區(qū)野鳥概況
1.3.2 禽流感病毒在野鳥中的分布特點
1.3.3 野鳥在禽流感病毒傳播中的作用
1.4 項目研究的目的與意義
2 野鳥源禽流感病毒的分離與鑒定
2.1 材料
2.1.1 樣品的采集
2.1.2 SPF雞胚及1% SPF雞紅血球
2.1.3 主要試劑及儀器
2.1.4 禽流感病毒亞型診斷引物
2.2 方法
2.2.1 1%雞紅血球制備
2.2.2 樣品的處理
2.2.3 病毒的分離
2.2.4 病毒RNA提取
2.2.5 反轉錄合成cDNA
2.2.6 RT-PCR鑒定
2.2.7 RT-PCR產(chǎn)物鑒定
2.3 結果
2.4 討論
2.5 本章小結
3 三株野鳥源H5N1亞型禽流感病毒的遺傳進化及其致病性分析
3.1 材料
3.1.1 病毒
3.1.2 SPF雞胚和實驗動物
3.1.3 主要試劑及儀器
3.1.4 引物
3.2 方法
3.2.1 病毒RNA提取
3.2.2 反轉錄合成cDNA
3.2.3 RT-PCR片段擴增
3.2.4 PCR產(chǎn)物的鑒定與純化
3.2.5 病毒全基因組測序
3.2.6 分子特征分析及系統(tǒng)進化樹的構建
3.2.7 動物致病性試驗
3.3 結果
3.3.1 同源性比較
3.3.2 分子特征分析
3.3.3 HA和NA基因分子進化研究
3.3.4 對雞和鴨的致病性研究
3.3.5 對小鼠致病性研究
3.4 討論
3.5 本章小結
4 野鳥源H3N8亞型禽流感病毒的遺傳進化及其致病性分析
4.1 材料
4.1.1 病毒
4.1.2 SPF雞胚和實驗動物
4.1.3 主要試劑及儀器
4.1.4 引物
4.2 方法
4.3 結果
4.3.1 同源性比較
4.3.2 分子特征分析
4.3.3 HA和NA基因分子進化研究
4.3.4 對雞和鴨的致病性研究
4.3.5 對小鼠的致病性研究
4.4 討論
4.5 本章小結
5 一株野鳥源H3N2亞型禽流感病毒的遺傳進化及其致病性分析
5.1 材料
5.1.1 病毒
5.1.2 SPF雞胚和實驗動物
5.1.3 主要試劑及儀器
5.1.4 引物
5.2 方法
5.3 結果
5.3.1 同源性比較
5.3.2 分子特征分析
5.3.3 HA和NA基因分子進化研究
5.3.4 對雞和鴨的致病性研究
5.3.5 對小鼠的致病性研究
5.4 討論
5.5 本章小結
結論
參考文獻
攻讀學位期間發(fā)表的學術論文
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]1998~2008年中國中部H9N2亞型AIV分離毒株HA基因的進化分析[J]. 趙軍,柴麗娜,王澤霖. 病毒學報. 2011(02)
[2]H3N2亞型犬流感病毒的分離鑒定[J]. 佘利旋,熊永忠,遠立國,袁天梅,賈坤,李守軍. 中國預防獸醫(yī)學報. 2011(01)
[3]1968年香港流感(H3N2)病原學概述[J]. 杜寧,楊霄星,藍雨,溫樂英,李曉丹,高榮保,郭元吉,李德新,舒躍龍. 病毒學報. 2009(S1)
[4]H3N2亞型豬流感病毒HA基因序列測定及抗原性分析[J]. 劉大飛,楊濤,劉明,劉春國,桑學波,劉大程. 動物醫(yī)學進展. 2008(03)
[5]禽流感病毒的分子生物學研究進展[J]. 傅生芳,獨軍政,;菔|,陳懷濤. 動物醫(yī)學進展. 2005(05)
[6]吉林省鳥類多樣性研究[J]. 高瑋,王海濤,方林,張卓,楊志杰. 東北師大學報(自然科學版). 2005(01)
[7]禽流感病毒分子生物學研究進展[J]. 黃瑜,彭春香,傅光華,程龍飛,李文楊,施少華. 福建畜牧獸醫(yī). 2004(S1)
[8]全球禽流感的流行形勢[J]. 甘孟侯. 中國預防獸醫(yī)學報. 2004(06)
[9]禽流感病毒血凝素分子生物學研究進展[J]. 曹梅,田夫林,莊文忠. 動物醫(yī)學進展. 2004(02)
[10]禽流感病毒分子生物學特性及其診斷進展[J]. 高利波. 云南畜牧獸醫(yī). 2003(02)
碩士論文
[1]福建省H3N2亞型流感病毒分子流行病學特征分析[D]. 謝劍鋒.福建醫(yī)科大學 2012
本文編號:3624914
【文章來源】:東北林業(yè)大學黑龍江省211工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:102 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 禽流感病毒概述
1.2 禽流感病毒的結構及其生物學功能
1.2.1 表面糖蛋白及其功能
1.2.2 聚合酶蛋白(Polymerase,PB2、PB1、PA)及其功能
1.2.3 核蛋白(Nucleoprotein,NP)及其功能
1.2.4 基質蛋白(Matrix proteins,M)及其功能
1.2.5 非結構蛋白(Nonstructural proteins,NS)及其功能
1.3 野鳥在禽流感流行病學中的地位
1.3.1 東北地區(qū)野鳥概況
1.3.2 禽流感病毒在野鳥中的分布特點
1.3.3 野鳥在禽流感病毒傳播中的作用
1.4 項目研究的目的與意義
2 野鳥源禽流感病毒的分離與鑒定
2.1 材料
2.1.1 樣品的采集
2.1.2 SPF雞胚及1% SPF雞紅血球
2.1.3 主要試劑及儀器
2.1.4 禽流感病毒亞型診斷引物
2.2 方法
2.2.1 1%雞紅血球制備
2.2.2 樣品的處理
2.2.3 病毒的分離
2.2.4 病毒RNA提取
2.2.5 反轉錄合成cDNA
2.2.6 RT-PCR鑒定
2.2.7 RT-PCR產(chǎn)物鑒定
2.3 結果
2.4 討論
2.5 本章小結
3 三株野鳥源H5N1亞型禽流感病毒的遺傳進化及其致病性分析
3.1 材料
3.1.1 病毒
3.1.2 SPF雞胚和實驗動物
3.1.3 主要試劑及儀器
3.1.4 引物
3.2 方法
3.2.1 病毒RNA提取
3.2.2 反轉錄合成cDNA
3.2.3 RT-PCR片段擴增
3.2.4 PCR產(chǎn)物的鑒定與純化
3.2.5 病毒全基因組測序
3.2.6 分子特征分析及系統(tǒng)進化樹的構建
3.2.7 動物致病性試驗
3.3 結果
3.3.1 同源性比較
3.3.2 分子特征分析
3.3.3 HA和NA基因分子進化研究
3.3.4 對雞和鴨的致病性研究
3.3.5 對小鼠致病性研究
3.4 討論
3.5 本章小結
4 野鳥源H3N8亞型禽流感病毒的遺傳進化及其致病性分析
4.1 材料
4.1.1 病毒
4.1.2 SPF雞胚和實驗動物
4.1.3 主要試劑及儀器
4.1.4 引物
4.2 方法
4.3 結果
4.3.1 同源性比較
4.3.2 分子特征分析
4.3.3 HA和NA基因分子進化研究
4.3.4 對雞和鴨的致病性研究
4.3.5 對小鼠的致病性研究
4.4 討論
4.5 本章小結
5 一株野鳥源H3N2亞型禽流感病毒的遺傳進化及其致病性分析
5.1 材料
5.1.1 病毒
5.1.2 SPF雞胚和實驗動物
5.1.3 主要試劑及儀器
5.1.4 引物
5.2 方法
5.3 結果
5.3.1 同源性比較
5.3.2 分子特征分析
5.3.3 HA和NA基因分子進化研究
5.3.4 對雞和鴨的致病性研究
5.3.5 對小鼠的致病性研究
5.4 討論
5.5 本章小結
結論
參考文獻
攻讀學位期間發(fā)表的學術論文
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]1998~2008年中國中部H9N2亞型AIV分離毒株HA基因的進化分析[J]. 趙軍,柴麗娜,王澤霖. 病毒學報. 2011(02)
[2]H3N2亞型犬流感病毒的分離鑒定[J]. 佘利旋,熊永忠,遠立國,袁天梅,賈坤,李守軍. 中國預防獸醫(yī)學報. 2011(01)
[3]1968年香港流感(H3N2)病原學概述[J]. 杜寧,楊霄星,藍雨,溫樂英,李曉丹,高榮保,郭元吉,李德新,舒躍龍. 病毒學報. 2009(S1)
[4]H3N2亞型豬流感病毒HA基因序列測定及抗原性分析[J]. 劉大飛,楊濤,劉明,劉春國,桑學波,劉大程. 動物醫(yī)學進展. 2008(03)
[5]禽流感病毒的分子生物學研究進展[J]. 傅生芳,獨軍政,;菔|,陳懷濤. 動物醫(yī)學進展. 2005(05)
[6]吉林省鳥類多樣性研究[J]. 高瑋,王海濤,方林,張卓,楊志杰. 東北師大學報(自然科學版). 2005(01)
[7]禽流感病毒分子生物學研究進展[J]. 黃瑜,彭春香,傅光華,程龍飛,李文楊,施少華. 福建畜牧獸醫(yī). 2004(S1)
[8]全球禽流感的流行形勢[J]. 甘孟侯. 中國預防獸醫(yī)學報. 2004(06)
[9]禽流感病毒血凝素分子生物學研究進展[J]. 曹梅,田夫林,莊文忠. 動物醫(yī)學進展. 2004(02)
[10]禽流感病毒分子生物學特性及其診斷進展[J]. 高利波. 云南畜牧獸醫(yī). 2003(02)
碩士論文
[1]福建省H3N2亞型流感病毒分子流行病學特征分析[D]. 謝劍鋒.福建醫(yī)科大學 2012
本文編號:3624914
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