本實驗利用測序和PCR-SSCP的方法,檢測了218頭中國荷斯坦種公牛甘露糖結(jié)合凝集素（Mannan-Binding Lectin-C, MBL2）基因的單核苷酸多態(tài)性。利用生物信息學的方法對發(fā)現(xiàn)的SNPs位點進行了分析,并分析了其多態(tài)性與精液品質(zhì)和公牛后裔產(chǎn)奶性能及乳房炎抗性的相關(guān)性,以及MBL2基因在健康及患乳房炎奶牛不同組織的表達情況。結(jié)果如下：1.在牛MBL2基因啟動子區(qū)發(fā)現(xiàn)3個新的突變位點,分別為g.895A/T、g.905 A/G和g.956 T/C；在外顯子1 （exon 1）發(fā)現(xiàn)4個突變位點,即g.1164 G/A、g.1197 C/A、 g.1198 G/A和g.1207 T/C；在外顯子2（exon 2）發(fā)現(xiàn)了一個新的突變位點g.1676 C/T。分析發(fā)現(xiàn),g.1164 G/A和g.1197 C/A為非同義突變,分別導致其編碼的第31位和第42位氨基酸發(fā)生精氨酸-谷氨酰胺（R-Q）和脯氨酸-谷氨酰胺（P-Q）替換。只有g(shù).1164G/A和g.1676 C/T位點滿足Hardy-Weinberg平衡（p>0.05）。測序發(fā)現(xiàn)g.905 A/G和g.956T/C緊... 

【文章來源】：南京農(nóng)業(yè)大學江蘇省211工程院校教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：69 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
縮略詞
第一章 文獻綜述
    1 MBL的研究進展
        1.1 MBL的發(fā)現(xiàn)
        1.2 MBL的結(jié)構(gòu)
        1.3 MBL基因
        1.4 MBL功能
            1.4.1 MBL與病原體識別
            1.4.2 MBL與補體系統(tǒng)激活
            1.4.3 MBL與吞噬作用
            1.4.4 MBL與炎癥反應
            1.4.5 MBL與自身識別
            1.4.6 MBL的其它作用
        1.5 MBL單核苷酸多態(tài)性研究
        1.6 MBL在動物中的研究
    2 后裔測定
    3 精液品質(zhì)
    4 本研究的目的及意義
    參考文獻
第二章 公牛MBL2基因單核苷酸多態(tài)性及其與精液品質(zhì)和后裔生產(chǎn)性能的相關(guān)性
    1 材料與方法
        1.1 材料
            1.1.1 實驗動物
            1.1.2 主要儀器設(shè)備
            1.1.3 藥品及試劑
        1.2 實驗方法
            1.2.1 基因組DNA的提取
            1.2.2 引物設(shè)計與PCR擴增
            1.2.3 測序分析
            1.2.4 基因分型
            1.2.5 物種間MBL2基因同源性分析
            1.2.6 牛MBL2基因5'調(diào)控區(qū)序列的生物信息學分析
            1.2.7 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)分析
        1.3 統(tǒng)計分析
            1.3.1 基因型頻率和等位基因頻率
            1.3.2 多態(tài)信息指數(shù)
            1.3.3 Hardy-Weinberg平衡檢驗
            1.3.4 相關(guān)性分析
    2 結(jié)果與分析
        2.1 測序結(jié)果
        2.2 PCR-SSCP分型
        2.3 公牛MBL2基因基因型頻率、等位基因頻率及遺傳參數(shù)
        2.4 物種間MBL2基因同源性分析
        2.5 牛MBL2基因5'調(diào)控區(qū)生物信息學分析
        2.6 MBL-C蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)域預測
        2.7 相關(guān)性分析
            2.7.1 不同基因型與精液品質(zhì)的相關(guān)性
            2.7.2 不同基因型與公牛后裔生產(chǎn)性能及乳房炎抗性的相關(guān)性
    3 討論
        3.1 MBL2基因座位群體遺傳特性分析
        3.2 牛MBL2基因5'調(diào)控區(qū)生物信息學分析
        3.3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析
        3.4 MBL2基因多態(tài)性與精液品質(zhì)的相關(guān)性
        3.5 MBL2基因多態(tài)性與后裔產(chǎn)奶性能及乳房炎抗性的相關(guān)性
    參考文獻
第三章 MBL2基因在健康和患乳房炎奶牛中的表達差異
    1 材料與方法
        1.1 材料
            1.1.1 組織樣品
            1.1.2 主要儀器設(shè)備
            1.1.3 藥品及試劑
        1.2 實驗方法
            1.2.1 引物設(shè)計
            1.2.2 總RNA的提取
            1.2.3 反轉(zhuǎn)錄
            1.2.4 熒光定量PCR
    2 結(jié)果與分析
        2.1 總RNA的提取及質(zhì)量
        2.2 健康和患乳房炎奶牛不同組織中MBL2基因表達
    3 討論
    參考文獻
全文結(jié)論
研究創(chuàng)新點
附錄
攻讀學位期間發(fā)表的論文
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
[1]荷斯坦牛HSP70-1和HSP32基因SNP位點與生產(chǎn)性能及乳房炎抗性的相關(guān)性研究[J]. 蔣小強,白井巖,吳潔,李蓮,李倩倩,王根林.  南京農(nóng)業(yè)大學學報. 2013(03)
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[3]c-myb轉(zhuǎn)錄因子與細胞增殖分化[J]. 范晨,王梁華,焦炳華.  生命的化學. 2011(05)
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碩士論文
[1]荷斯坦公牛SPAG11基因、Tf基因多態(tài)性及與精子質(zhì)量性狀的關(guān)聯(lián)性分析[D]. 劉新顏.山東師范大學 2011



本文編號：3617934