產(chǎn)奶性狀是奶山羊的主要經(jīng)濟(jì)性狀,包括產(chǎn)奶量、乳脂率和乳蛋白率等。目前,許多學(xué)者認(rèn)為這些數(shù)量性狀的表現(xiàn)不僅受微效多基因或QTL控制,而且也與主效基因調(diào)控密切相關(guān)。因此,尋找這些性狀的主效基因或與之相連鎖的分子標(biāo)記,研究功能基因的調(diào)控機(jī)理,是開展奶山羊分子育種工作的前提。以分子標(biāo)記輔助選擇為核心的多基因聚合育種技術(shù)能直接在DNA水平上對產(chǎn)奶性狀的基因型進(jìn)行選擇,克服了傳統(tǒng)育種方法準(zhǔn)確性低的問題,可顯著加快遺傳進(jìn)展,提高育種效率。因此,將分子標(biāo)記輔助育種技術(shù)與傳統(tǒng)育種技術(shù)有效結(jié)合,集成創(chuàng)新新的育種技術(shù)體系是奶山羊育種發(fā)展的必然趨勢。本研究選擇對產(chǎn)奶性狀有關(guān)鍵調(diào)控作用的PRLR、ELF5、MTHFR和FOLR1基因,采用PCR-RFLP和DNA測序技術(shù)研究這4個基因在西農(nóng)薩能和關(guān)中奶山羊中的SNPs及其與產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)性；采用實(shí)時定量PCR技術(shù)檢測PRLR、ELF5和FOLR1基因在奶山羊10個組織中的相對表達(dá)量；克隆奶山羊PRLR、ELF5（?）FOLR1基因完整的CDS區(qū),并進(jìn)行生物信息學(xué)分析；從PRLR、ELF5、MTHFR和FOLR1基因中篩選對產(chǎn)奶性狀有顯著影響的基因位點(diǎn),利用數(shù)量遺... 

【文章來源】：西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省211工程院校985工程院校教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：129 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 乳業(yè)與人類文明
    1.2 中國奶業(yè)的概況與發(fā)展現(xiàn)狀
    1.3 分子標(biāo)記育種中常用方法及技術(shù)研究進(jìn)展
        1.3.1 候選基因法
        1.3.2 常用分子標(biāo)記技術(shù)
    1.4 產(chǎn)奶量與乳蛋白研究進(jìn)展
        1.4.1 產(chǎn)奶量
        1.4.2 乳蛋白
    1.5 產(chǎn)奶性狀相關(guān)候選基因的研究進(jìn)展
        1.5.1 葉酸代謝通路基因
        1.5.2 E74類因子5(E74-like factor 5,ELF5)基因
        1.5.3 催乳素與催乳素受體基因
        1.5.4 生長激素和生長激素受體基因
        1.5.5 胰島素樣生長因子(IGFs)
    1.6 多基因聚合的研究進(jìn)展
        1.6.1 基因聚合與基因聚合育種的概念
        1.6.2 多基因聚合育種的原理
        1.6.3 多基因聚合的方法
        1.6.4 基因聚合育種的研究進(jìn)展
    1.7 本研究的目的意義
試驗(yàn)研究
    第二章 PRLR基因的克隆、表達(dá)及其SNPs與產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析
        2.1 引言
        2.2 材料與方法
            2.2.1 試驗(yàn)動物
            2.2.2 主要試劑
            2.2.3 溶液的配置
            2.2.4 儀器設(shè)備
            2.2.5 基因組DNA的提取及檢測
            2.2.6 RNA的提取及檢測
            2.2.7 DNA的凝膠回收
            2.2.8 DNA克隆
            2.2.9 cDNA模板的制備
            2.2.10 實(shí)時定量PCR
            2.2.11 引物設(shè)計(jì)、PCR和酶切反應(yīng)
            2.2.12 酶切產(chǎn)物檢測
            2.2.13 核酸和蛋白序列分析
            2.2.14 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
        2.3 結(jié)果與分析
            2.3.1 山羊基因組DNA的檢測結(jié)果
            2.3.2 山羊組織總RNA的檢測結(jié)果
            2.3.3 山羊PRLR基因的克隆和生物信息學(xué)分析
            2.3.4 PRLR基因的Real time-PCR結(jié)果
            2.3.5 PRLR基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
            2.3.6 山羊PRLR基因的SNPs檢測
            2.3.7 PRLR基因SNPs測序圖
            2.3.8 3'UTR突變對miRNA結(jié)合位點(diǎn)的影響
            2.3.9 PRLR基因SNP位點(diǎn)的遺傳結(jié)構(gòu)
            2.3.10 PRLR基因與山羊產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析
        2.4 討論
            2.4.1 Real time-PCR
            2.4.2 PRLR基因的組織表達(dá)
            2.4.3 PRLR基因突變對產(chǎn)奶性狀的影響
        2.5 小結(jié)
    第三章 ELF5基因的克隆、表達(dá)及其SNPs與產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析
        3.1 引言
        3.2 材料與方法
            3.2.1 引物設(shè)計(jì)
            3.2.2 實(shí)時定量PCR
        3.3 結(jié)果與分析
            3.3.1 山羊ELF5基因的克隆和生物信息學(xué)分析
            3.3.2 ELF5基因的實(shí)時定量PCR結(jié)果
            3.3.3 ELF5基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
            3.3.4 山羊ELF5基因的SNPs檢測
            3.3.5 ELF5基因SNPs測序圖
            3.3.6 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的預(yù)測結(jié)果
            3.3.7 ELF5基因SNP位點(diǎn)的遺傳結(jié)構(gòu)
            3.3.8 ELF5基因與山羊產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析
        3.4 討論
            3.4.1 ELF5基因的表達(dá)
            3.4.2 ELF5基因的多態(tài)性與產(chǎn)奶性能
        3.5 小結(jié)
    第四章 MTHFR基因的SNPs與產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析
        4.1. 引言
        4.2 材料與方法
            4.2.1 引物設(shè)計(jì)、PCR和酶切反應(yīng)
        4.3 結(jié)果與分析
            4.3.1 MTHFR基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
            4.3.2 山羊MTHFR基因的SNPs檢測
            4.3.3 MTHFR基因SNPs測序圖
            4.3.4 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的預(yù)測結(jié)果
            4.3.5 MTHFR基因SNP位點(diǎn)的遺傳結(jié)構(gòu)
            4.3.6 MTHFR基因與山羊產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析
        4.4 討論
        4.5 小結(jié)
    第五章 FOLR1基因的克隆、表達(dá)及SNP與產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析
        5.1 引言
        5.2 材料與方法
            5.2.1 引物設(shè)計(jì)
        5.3 結(jié)果與分析
            5.3.1 山羊FOLR1基因的克隆和生物信息學(xué)分析
            5.3.2 FOLR1基因的實(shí)時定量PCR結(jié)果
            5.3.3 FOLR1基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
            5.3.4 山羊FOLR1基因的SNPs檢測
        5.4 討論
            5.4.1 FOLR1基因的表達(dá)
            5.4.2 FOLR1基因的多態(tài)性
        5.5 小結(jié)
    第六章 PRLR、MTHFR和ELF5基因聚合對產(chǎn)奶性狀的效應(yīng)分析
        6.1 引言
        6.2 材料與方法
        6.3 結(jié)果與分析
        6.4 討論
        6.5 小結(jié)
結(jié)論
創(chuàng)新點(diǎn)
進(jìn)一步研究的問題
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡介


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[2]牛α-乳清蛋白基因5′調(diào)控區(qū)多態(tài)性研究[J]. 楊永強(qiáng),龔俞,焦仁剛,惠嫣婷,劉若余.  中國畜牧獸醫(yī). 2013(01)
[3]綿羊催乳素受體基因外顯子10多態(tài)性及其與產(chǎn)羔數(shù)相關(guān)分析[J]. 張向楠,孫偉,儲明星,張有法,陳玲,吳文忠,周洪,徐厚生.  中國畜牧雜志. 2012(17)
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[9]IGF-Ⅰ在奶牛乳腺的表達(dá)及其對乳腺上皮細(xì)胞泌乳功能的影響[J]. 張童非,崔英俊,李慶章.  中國畜牧獸醫(yī). 2012(05)
[10]PRLR基因在內(nèi)蒙古絨山羊下丘腦、垂體及卵巢中的表達(dá)[J]. 趙艷紅,王志英,石玲,鄭竹清,王琳,李金泉.  東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(03)

博士論文
[1]中國乳業(yè)產(chǎn)業(yè)安全研究[D]. 郝曉燕.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[2]山羊乳營養(yǎng)特性及對嗜酸乳桿菌增菌發(fā)酵效能的研究[D]. 葛武鵬.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2008
[3]雞肌苷酸相關(guān)候選基因遺傳效應(yīng)及表達(dá)規(guī)律研究[D]. 束婧婷.揚(yáng)州大學(xué) 2008

碩士論文
[1]奶山羊乳腺發(fā)育過程中激素及其受體表達(dá)規(guī)律的研究[D]. 李真.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[2]ESR、RYR1基因多態(tài)對豬產(chǎn)活仔數(shù)影響的研究及四個基因SNP位點(diǎn)的檢測[D]. 劉俊.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006



本文編號：3611500