副豬嗜血桿菌血清4型菌株的蛋白質(zhì)組學研究
發(fā)布時間:2022-01-20 13:08
近幾年來,臨床上表現(xiàn)為多發(fā)性纖維素性漿膜炎、關(guān)節(jié)炎的病豬屢見不鮮,從患病豬的病理臟器中分離出副豬嗜血桿菌(Haemophilusparasuis,HPS)的比例越來越高,但對其致病機理尚不清楚。本研究選取2株副豬嗜血桿菌血清4型菌株進行比較蛋白質(zhì)組學和免疫蛋白質(zhì)組學研究,以揭示其致病機制。1副豬嗜血桿菌二維雙向凝膠電泳條件的建立和優(yōu)化本研究主要對裂解液配方、上樣量以及聚焦時間進行優(yōu)化,建立了適宜的副豬嗜血桿菌二維雙向電泳凝膠技術(shù)。通過超聲-裂解液-離心法提取全蛋白,裂解液配方為7M尿素,2M硫脲,4%CHAPS,40mMDTT,2%IPGbuffer。上樣時使用2D clean-up kit以及加入去拖尾DeStreak試劑。采用銀染方法確定了 24cm膠條上樣量為5000μg。一向等電聚焦程序為:30V12h、100V2h、200Vlh、500V lh、1000V3h、2000V 2h、8000V3h、60000 Vh、500V10h。2副豬嗜血桿菌血清4型菌株的差異蛋白質(zhì)組學研究先通過二維雙向凝膠電泳技術(shù)和PDQest8.0軟件分析獲取23個差異表達蛋白,再運用MALDI-TOF-...
【文章來源】:福建農(nóng)林大學福建省
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2副豬嗜血桿菌的SDS-PAGE圖譜??
?pH4?—7??K?剩??8M尿素裂解液制備樣品的2-D圖諳?7M尿素裂解液制備樣品的2-D圖諧??圖2-3不同蛋白裂解液提取樣品的雙向電泳圖譜??Fig.?2-3?2-D?polyacrylamide?gel?electrophoresis?pages?of?different?protein?lysis?buffer??蛋白樣品的有效溶解是雙向電泳成功分離蛋白質(zhì)的關(guān)鍵因素之一,裂解液中??尿素作為常用的變性劑,其常用濃度為8M,過低則不能達到完全溶解蛋白的目??的。硫脲的添加則可以幫助許多難溶蛋白進行溶解,特別是膜蛋白,二者共同作??用能夠破壞蛋白分子間的氫鍵,從而防止由氫鍵引起蛋白質(zhì)聚集以及蛋白遷移中??二級結(jié)構(gòu)的形成。由于硫脲在水中的溶解度低,高濃度尿素可增強其溶解度,因??此通常選用7M尿素和2M硫脲的混合溶液。??如上圖,相同的上樣量和聚焦程序,使用8M尿素裂解液不能徹底溶解樣品??中的蛋白,在酸性端出現(xiàn)大量水平拖尾現(xiàn)象,蛋白點不能很好分開;使用7M尿??素裂解液
未用試劑盒處理的樣品?用試劑盒處理的樣品??圖2-4用2-D?clean?up試劑盒對樣品處理前后的雙向電泳圖譜??Fig.?2-4?Two-dimensional?polyacrylamide?gel?electrophoresis?pages?of?before?and?after?using?2-D??clean?up?kit??雙向電泳對蛋白樣品的要求非常嚴格,樣品中任何雜質(zhì)都會對后續(xù)的等點聚??焦過程產(chǎn)生影響。用2-D?dean?up試劑盒對樣品處理前后的雙向電泳結(jié)果比較發(fā)??現(xiàn),未用試劑盒處理的樣品中含有少量雜質(zhì),出現(xiàn)水平條紋,部分蛋白溶解度差??影響了電泳的分辨率;用試劑盒處理的樣品,因去除了樣品中各種去污劑、鹽份、??多肽、核酸、脂類、酚類和其他一些離子,保持了樣品的溶解性,減少了水平條??紋的發(fā)生,提高了電泳的分辨率,圖譜中蛋白點清晰、聚焦效果很好,而且使用??試劑盒沒有造成斑點的增加或減少,或斑點位置變化,明顯使用2-D?clean?up試??劑盒處理樣品的圖譜要好于沒有用試劑盒處理的圖譜。因此,在開始雙向電泳前??需先用2-D?clean?up試劑盒來處理樣品。??3.5樣品上樣量的確定(24cm)??采用2根24cm膠條
【參考文獻】:
期刊論文
[1]豬鏈球菌二氫硫辛酰胺脫氫酶的原核表達及其粘附相關(guān)功能初探[J]. 張靜,孫建和. 上海交通大學學報(農(nóng)業(yè)科學版). 2012(02)
[2]副豬嗜血桿菌血清5型TbpA蛋白的表達及其免疫原性分析[J]. 李建軍,胡明明,朱曉凱,李艷玲,張艷禾,謝芳,王春來. 中國預防獸醫(yī)學報. 2012(03)
[3]豬胸膜肺炎放線桿菌轉(zhuǎn)鐵結(jié)合蛋白基因(TbpB)分析及建模[J]. 李任峰,田香勤,何啟蓋,胡建和,趙樸,李學斌,王三虎. 生物信息學. 2010(01)
[4]絲氨酸蛋白酶研究進展[J]. 汪世華,王文勇,黃益洲,林琳,沙莉. 福建農(nóng)業(yè)學報. 2007(04)
[5]副豬嗜血桿菌病研究進展[J]. 華升,梅書棋,曾德芳,徐滌平,李勇. 動物醫(yī)學進展. 2006(11)
[6]蛋白質(zhì)組學分析多重耐藥的銅綠假單胞菌[J]. 樂軍,蔣曉飛,梁莉,呂元. 中國抗生素雜志. 2006(08)
[7]異煙肼耐藥和敏感結(jié)核分枝桿菌的比較蛋白質(zhì)組學研究[J]. 樂軍,劉麗蓉,謝建平,劉蓓,梁莉,王洪海. 中華微生物學和免疫學雜志. 2004(04)
[8]大腸桿菌周質(zhì)和外膜蛋白的定位[J]. 葛高翔,林其誰. 生物化學與生物物理進展. 2000(06)
[9]功能蛋白質(zhì)組學[J]. 生命的化學. 1998(06)
[10]細菌蛋白酶的致病作用[J]. 李瑞武. 國外醫(yī)學(微生物學分冊). 1998(03)
博士論文
[1]副豬嗜血桿菌的分離鑒定及診斷方法與滅活疫苗的研究[D]. 蔡旭旺.華中農(nóng)業(yè)大學 2006
本文編號:3598882
【文章來源】:福建農(nóng)林大學福建省
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2副豬嗜血桿菌的SDS-PAGE圖譜??
?pH4?—7??K?剩??8M尿素裂解液制備樣品的2-D圖諳?7M尿素裂解液制備樣品的2-D圖諧??圖2-3不同蛋白裂解液提取樣品的雙向電泳圖譜??Fig.?2-3?2-D?polyacrylamide?gel?electrophoresis?pages?of?different?protein?lysis?buffer??蛋白樣品的有效溶解是雙向電泳成功分離蛋白質(zhì)的關(guān)鍵因素之一,裂解液中??尿素作為常用的變性劑,其常用濃度為8M,過低則不能達到完全溶解蛋白的目??的。硫脲的添加則可以幫助許多難溶蛋白進行溶解,特別是膜蛋白,二者共同作??用能夠破壞蛋白分子間的氫鍵,從而防止由氫鍵引起蛋白質(zhì)聚集以及蛋白遷移中??二級結(jié)構(gòu)的形成。由于硫脲在水中的溶解度低,高濃度尿素可增強其溶解度,因??此通常選用7M尿素和2M硫脲的混合溶液。??如上圖,相同的上樣量和聚焦程序,使用8M尿素裂解液不能徹底溶解樣品??中的蛋白,在酸性端出現(xiàn)大量水平拖尾現(xiàn)象,蛋白點不能很好分開;使用7M尿??素裂解液
未用試劑盒處理的樣品?用試劑盒處理的樣品??圖2-4用2-D?clean?up試劑盒對樣品處理前后的雙向電泳圖譜??Fig.?2-4?Two-dimensional?polyacrylamide?gel?electrophoresis?pages?of?before?and?after?using?2-D??clean?up?kit??雙向電泳對蛋白樣品的要求非常嚴格,樣品中任何雜質(zhì)都會對后續(xù)的等點聚??焦過程產(chǎn)生影響。用2-D?dean?up試劑盒對樣品處理前后的雙向電泳結(jié)果比較發(fā)??現(xiàn),未用試劑盒處理的樣品中含有少量雜質(zhì),出現(xiàn)水平條紋,部分蛋白溶解度差??影響了電泳的分辨率;用試劑盒處理的樣品,因去除了樣品中各種去污劑、鹽份、??多肽、核酸、脂類、酚類和其他一些離子,保持了樣品的溶解性,減少了水平條??紋的發(fā)生,提高了電泳的分辨率,圖譜中蛋白點清晰、聚焦效果很好,而且使用??試劑盒沒有造成斑點的增加或減少,或斑點位置變化,明顯使用2-D?clean?up試??劑盒處理樣品的圖譜要好于沒有用試劑盒處理的圖譜。因此,在開始雙向電泳前??需先用2-D?clean?up試劑盒來處理樣品。??3.5樣品上樣量的確定(24cm)??采用2根24cm膠條
【參考文獻】:
期刊論文
[1]豬鏈球菌二氫硫辛酰胺脫氫酶的原核表達及其粘附相關(guān)功能初探[J]. 張靜,孫建和. 上海交通大學學報(農(nóng)業(yè)科學版). 2012(02)
[2]副豬嗜血桿菌血清5型TbpA蛋白的表達及其免疫原性分析[J]. 李建軍,胡明明,朱曉凱,李艷玲,張艷禾,謝芳,王春來. 中國預防獸醫(yī)學報. 2012(03)
[3]豬胸膜肺炎放線桿菌轉(zhuǎn)鐵結(jié)合蛋白基因(TbpB)分析及建模[J]. 李任峰,田香勤,何啟蓋,胡建和,趙樸,李學斌,王三虎. 生物信息學. 2010(01)
[4]絲氨酸蛋白酶研究進展[J]. 汪世華,王文勇,黃益洲,林琳,沙莉. 福建農(nóng)業(yè)學報. 2007(04)
[5]副豬嗜血桿菌病研究進展[J]. 華升,梅書棋,曾德芳,徐滌平,李勇. 動物醫(yī)學進展. 2006(11)
[6]蛋白質(zhì)組學分析多重耐藥的銅綠假單胞菌[J]. 樂軍,蔣曉飛,梁莉,呂元. 中國抗生素雜志. 2006(08)
[7]異煙肼耐藥和敏感結(jié)核分枝桿菌的比較蛋白質(zhì)組學研究[J]. 樂軍,劉麗蓉,謝建平,劉蓓,梁莉,王洪海. 中華微生物學和免疫學雜志. 2004(04)
[8]大腸桿菌周質(zhì)和外膜蛋白的定位[J]. 葛高翔,林其誰. 生物化學與生物物理進展. 2000(06)
[9]功能蛋白質(zhì)組學[J]. 生命的化學. 1998(06)
[10]細菌蛋白酶的致病作用[J]. 李瑞武. 國外醫(yī)學(微生物學分冊). 1998(03)
博士論文
[1]副豬嗜血桿菌的分離鑒定及診斷方法與滅活疫苗的研究[D]. 蔡旭旺.華中農(nóng)業(yè)大學 2006
本文編號:3598882
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