為了解我國兩廣地區(qū)豬非典型瘟病毒（APPV）的流行及變異情況,本研究于2017年～2018年從該地區(qū)的兩個規(guī)模化養(yǎng)殖場采集了10份患先天性震顫仔豬的各組織病料樣品,利用RT-PCR進行APPV檢測,挑選3份陽性樣品進行該病毒的開放閱讀框（ORF）基因序列的RT-PCR擴增、測序,并對ORF基因、該基因包含的E2和P7基因進行核苷酸和氨基酸序列同源性分析及該3種基因的遺傳進化分析。結果顯示,10份病料樣品均為APPV陽性,采用RT-PCR分段擴增獲得3株APPV的ORF基因全長序列。ORF基因序列分析顯示,3株APPV之間的核苷酸同源性為81.6%～99.8%,與41株中國株的同源性為80.8%～99.3%,與19株國外參考株的同源性為81.3%～91.1%;E2和P7基因的同源性分析結果與ORF基因同源性分析結果一致。ORF、E2和P7基因的遺傳進化樹顯示,廣西豬場分離的GX-GL1株和GX-GL67株屬于基因1型,而廣東豬場分離的GD-CT4株屬于基因3型。上述結果表明3株APPV與中國株的親緣關系更近,兩廣地區(qū)的APPV基因型呈現地域差異性,本研究有助于了解APPV在中國的流行情況... 

【文章來源】：中國預防獸醫(yī)學報. 2020,42(09)北大核心CSCD

【文章頁數】：5 頁

【部分圖文】：

APPV E2基因（A）和P7基因（B）的遺傳進化樹

P7基因編碼病毒孔蛋白，該蛋白可以運輸離子和其它分子通過宿主細胞膜，有助于病毒進入細胞及其在細胞中的成熟[2]。APPV P7基因的同源性分析結果顯示，3株APPV與60株參考株的核苷酸序列的同源性為74.5%～100%，氨基酸序列的同源性為61.3%～100%。3株APPV均與四川SWU-ZH株（MH499647)P7基因氨基酸序列同源性最低（<70%）（圖2B）。豬瘟病毒（Classical swine fever virus,CS-FV）的P7蛋白與毒力相關[8],APPV的P7蛋白變異是否會影響APPV的毒力還需進一步研究。為了進一步確定經ORF基因鑒定的APPV的基因分型結果，本研究對APPV的E2和P7基因進行了遺傳進化分析。E2和P7基因的遺傳進化樹結果均顯示，GX-GL1株和GX-GL67株屬于基因1型且與基因1型的2株廣西株（MH715893、KY652092）、1株四川株（MH499645）、1株云南株（MH499646）和1株貴州株（KY475592）聚為一個分支；而GD-CT4株屬于基因3型，與基因3型的3株廣東株（MH493894、MH493895、MH493896）聚為一個分支。63株APPV在E2和P7基因的遺傳進化樹中的分型結果與ORF基因序列分型結果基本一致，這表明當前所有已鑒定的APPV可分為3個基因型，分別是基因1型、2型和3型。


本文編號：3582054