為了解我國兩廣地區(qū)豬非典型瘟病毒（APPV）的流行及變異情況,本研究于2017年～2018年從該地區(qū)的兩個(gè)規(guī)模化養(yǎng)殖場(chǎng)采集了10份患先天性震顫仔豬的各組織病料樣品,利用RT-PCR進(jìn)行APPV檢測(cè),挑選3份陽性樣品進(jìn)行該病毒的開放閱讀框（ORF）基因序列的RT-PCR擴(kuò)增、測(cè)序,并對(duì)ORF基因、該基因包含的E2和P7基因進(jìn)行核苷酸和氨基酸序列同源性分析及該3種基因的遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果顯示,10份病料樣品均為APPV陽性,采用RT-PCR分段擴(kuò)增獲得3株APPV的ORF基因全長序列。ORF基因序列分析顯示,3株APPV之間的核苷酸同源性為81.6%～99.8%,與41株中國株的同源性為80.8%～99.3%,與19株國外參考株的同源性為81.3%～91.1%;E2和P7基因的同源性分析結(jié)果與ORF基因同源性分析結(jié)果一致。ORF、E2和P7基因的遺傳進(jìn)化樹顯示,廣西豬場(chǎng)分離的GX-GL1株和GX-GL67株屬于基因1型,而廣東豬場(chǎng)分離的GD-CT4株屬于基因3型。上述結(jié)果表明3株APPV與中國株的親緣關(guān)系更近,兩廣地區(qū)的APPV基因型呈現(xiàn)地域差異性,本研究有助于了解APPV在中國的流行情況... 

【文章來源】：中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,42(09)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

APPV E2基因（A）和P7基因（B）的遺傳進(jìn)化樹

P7基因編碼病毒孔蛋白，該蛋白可以運(yùn)輸離子和其它分子通過宿主細(xì)胞膜，有助于病毒進(jìn)入細(xì)胞及其在細(xì)胞中的成熟[2]。APPV P7基因的同源性分析結(jié)果顯示，3株APPV與60株參考株的核苷酸序列的同源性為74.5%～100%，氨基酸序列的同源性為61.3%～100%。3株APPV均與四川SWU-ZH株（MH499647)P7基因氨基酸序列同源性最低（<70%）（圖2B）。豬瘟病毒（Classical swine fever virus,CS-FV）的P7蛋白與毒力相關(guān)[8],APPV的P7蛋白變異是否會(huì)影響APPV的毒力還需進(jìn)一步研究。為了進(jìn)一步確定經(jīng)ORF基因鑒定的APPV的基因分型結(jié)果，本研究對(duì)APPV的E2和P7基因進(jìn)行了遺傳進(jìn)化分析。E2和P7基因的遺傳進(jìn)化樹結(jié)果均顯示，GX-GL1株和GX-GL67株屬于基因1型且與基因1型的2株廣西株（MH715893、KY652092）、1株四川株（MH499645）、1株云南株（MH499646）和1株貴州株（KY475592）聚為一個(gè)分支；而GD-CT4株屬于基因3型，與基因3型的3株廣東株（MH493894、MH493895、MH493896）聚為一個(gè)分支。63株APPV在E2和P7基因的遺傳進(jìn)化樹中的分型結(jié)果與ORF基因序列分型結(jié)果基本一致，這表明當(dāng)前所有已鑒定的APPV可分為3個(gè)基因型，分別是基因1型、2型和3型。


本文編號(hào)：3582054