為了了解云南省獨(dú)龍牛環(huán)孢子蟲（Cyclospora）的分子流行病學(xué)情況,試驗(yàn)分四個季節(jié)從云南省怒江流域（鳩門當(dāng)、古泉村、茨開鎮(zhèn)、亞左洛村）和獨(dú)龍江流域（獨(dú)龍江鄉(xiāng)）共五個地點(diǎn)采集1 129份獨(dú)龍牛糞便樣本,根據(jù)環(huán)孢子蟲的18S rRNA基因序列設(shè)計引物進(jìn)行巢式PCR擴(kuò)增,以限制性內(nèi)切酶BspEⅠ進(jìn)行限制性片段長度多態(tài)性（RELP）分析。利用BLAST工具對測得的序列與NCBI上已發(fā)表的環(huán)孢子蟲18S rRNA基因序列進(jìn)行比對分析,通過生物學(xué)軟件MEGA 6.0計算遺傳距離并采用鄰接法（NJ法）構(gòu)建遺傳進(jìn)化樹,以統(tǒng)計學(xué)軟件SPSS對感染率進(jìn)行分析。結(jié)果表明:從1 129份糞便樣本中共檢測出17份環(huán)孢子蟲陽性樣本,對測得序列進(jìn)行同源性分析發(fā)現(xiàn),5份樣本與人環(huán)孢子蟲親緣關(guān)系較近（98.5%～99.4%）,11份樣本與廣州牛源環(huán)孢子蟲親緣關(guān)系較近（94.4%～98.8%）,1份樣本與其他種類環(huán)孢子蟲親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。獨(dú)龍牛環(huán)孢子蟲的總感染率為1.51%（17/1 129）,怒江流域和獨(dú)龍江流域的感染率分別為1.00%（9/903）和3.54%（8/226）,兩者比較差異顯著（P<0.05）;五... 

【文章來源】：黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(23)北大核心

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【部分圖文】：

環(huán)孢子蟲18S rRNA基因PCR擴(kuò)增結(jié)果

經(jīng)RELP分析,在24份PCR陽性樣本中,有17份樣本為環(huán)孢子蟲陽性,其中怒江流域9份,獨(dú)龍江流域8份。電泳結(jié)果顯示環(huán)孢子蟲片段被酶切為130 bp和370 bp兩個片段,見圖2(部分結(jié)果)。2.3 序列的遺傳進(jìn)化分析

通過同源性分析結(jié)果,在17份陽性樣本中有5份樣本與人環(huán)孢子蟲親緣關(guān)系較近,同源性為98.5%～99.4%,11份樣本與廣州牛源環(huán)孢子蟲親緣關(guān)系較近,同源性為94.4%～98.8%,1份樣本與其他種類環(huán)孢子蟲親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。序列分析結(jié)果顯示,共有7份樣本不同DNA序列,上傳至GenBank中,獲得的序列號分別為MK393852～MK393858,遺傳進(jìn)化分析結(jié)果見圖3。2.4 環(huán)孢子蟲感染情況的統(tǒng)計

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]環(huán)孢子蟲分子生物學(xué)檢測研究進(jìn)展[J]. 孫春雪,錢艷瓊,李淵,張莉,李海龍.  中國病原生物學(xué)雜志. 2019(05)
[2]貢山獨(dú)龍牛飼養(yǎng)現(xiàn)狀與發(fā)展?jié)摿J]. 余連華.  云南畜牧獸醫(yī). 2013(04)
[3]地方牛品種云南獨(dú)龍牛的研究進(jìn)展[J]. 張德福,張樹山,戴建軍,吳彩鳳,張廷宇,羅天福.  上海農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2011(02)
[4]鴨糞中環(huán)孢子蟲18S rDNA部分基因和ITS-1基因的克隆與分析[J]. 程家林,李國清,岳彩鈴,徐前明,高振永,劉霞.  動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2010(04)
[5]環(huán)孢子蟲流行病學(xué)、分類及其遺傳特征的研究進(jìn)展[J]. 周洋,王強(qiáng),呂彪,齊萌,菅復(fù)春,張龍現(xiàn).  中國人獸共患病學(xué)報. 2009(03)
[6]牛源環(huán)孢子蟲的發(fā)現(xiàn)與分子鑒定[J]. 肖淑敏,李國清,周榮瓊,李韋華.  中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2006(04)



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