反芻動物瘤胃微生物群落的豐度變化與機(jī)體的許多表型都有關(guān)系,包括飼料效率、疾病狀態(tài)、甲烷排放以及機(jī)體的免疫功能。研究瘤胃微生物與機(jī)體表型之間的關(guān)系是目前反芻動物的一個(gè)研究熱點(diǎn)。本研究通過高通量測序技術(shù)探索龍江和牛瘤胃微生物的組成,并利用培養(yǎng)組學(xué)技術(shù)對瘤胃微生物菌群進(jìn)行分離鑒定,將培養(yǎng)組學(xué)技術(shù)與高通量測序技術(shù)相結(jié)合,分析龍江和牛瘤胃中細(xì)菌群落的組成,初步建立龍江和牛瘤胃微生物菌群庫。實(shí)驗(yàn)所用的瘤胃內(nèi)容物均采自黑龍江省齊齊哈爾市龍江縣某商業(yè)化龍江和牛屠宰場。共無菌采集5頭自然生長狀態(tài)下的健康雄性龍江和牛瘤胃內(nèi)容物,分別提取瘤胃內(nèi)容物菌群的總DNA,通過高通量測序技術(shù),針對16S rDNA的V3-V4區(qū)進(jìn)行測序分析,總共鑒定出37個(gè)細(xì)菌綱,其中占90%以上DNA序列的細(xì)菌綱有7種,包括擬桿菌綱（Bacteroi dia 38.22%-45.39%）、梭菌綱（Clostridia30.31%-34.88%）、厚壁菌綱（Negativicutes 7.21%-10.06%）、未分類菌綱（unclassified 4.72%-10.72%）、丹毒絲菌綱（Erysipelotrichia0.42%-2... 

【文章來源】：黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)黑龍江省

【文章頁數(shù)】：54 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

細(xì)菌擴(kuò)增16SrDNA結(jié)果

（Citrobacter2株0.64％；不同菌種：布氏檸檬酸桿菌）；棒狀桿菌屬（Corynebacterium1株0.32％；不同菌種：干燥棒桿菌）；梭菌屬（Fusobacterium1株0.32％；不同菌種：變形梭桿菌）；考克氏菌屬（Kocuria1株0.32%；不同菌種：考克氏菌）；細(xì)桿菌屬（Microbacterium1株0.32%；不同菌種：細(xì)桿菌）；光崗菌屬（Mitsuokella2株0.64%）；丙酸桿菌屬（Propionibacterium2株0.64%；不同菌種：痤瘡丙酸桿菌）；沙雷氏菌屬（Serratia1株0.32%；不同菌種：粘質(zhì)沙雷氏菌）；未分類芽胞桿菌科1（unclassified_Bacillaceae11株0.32％）。圖2-2擴(kuò)繁后的細(xì)菌菌屬分布圖Fig.2-2DistributionofBacteriaafterExpansion注：不同顏色代表不同菌屬，包括腸球菌屬（Enterococcus161株51.27％），芽孢桿菌屬（bacillus28株8.92％），不動桿菌屬（Acinetobacter26株8.28%），變形桿菌屬（Proteus23株7.32％），葡萄球菌屬（Staphylococcus22株7.01％），梭菌屬（Clostridium19株6.05％），狹義梭菌屬（Clostridiumsensustricto2株0.64％），氨基酸球菌屬（Acidaminococcus6株1.91%），大腸桿菌/志賀菌（Escherichia/Shigella5株1.59％），短桿菌屬（Bravibacterium3株0.96％），鏈球菌屬（Streptococcus4株1.27％），氣球菌屬（Aerococcus2株0.64％），檸檬酸桿菌屬（Citrobacter2株0.64％），棒狀桿菌屬（Corynebacterium1株0.32％），梭菌屬（Fusobacterium1株0.32％），考克氏菌屬（Kocuria1株0.32%），細(xì)桿菌屬（Microbacterium1株0.32%），光崗菌屬（Mitsuokella2株0.64%），丙酸桿菌屬（Propionibacterium2株0.64%），沙雷氏菌屬（Serratia1株0.32%），未分類芽胞桿菌科1（unclassified_Bacillaceae1株0.32％）。

龍江和牛瘤胃微生物分離鑒定及多樣性分析142.4.3不同菌種及不同基因型的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析已被測序鑒定完畢的細(xì)菌歸類為4個(gè)門，6個(gè)綱，9個(gè)目，20個(gè)科，21個(gè)屬，52個(gè)種，其中不同基因型159種，篩選已被分離鑒定出來的所有菌種和有價(jià)值的基因型，并將這些序列通過MEGA6軟件系統(tǒng)建樹分析，結(jié)果呈現(xiàn)在圖2-3中。圖2-3菌種系統(tǒng)進(jìn)化樹發(fā)育性分析Fig.2-3PhylogeneticTreeDevelopmentAnalysisofStrains注：共52個(gè)菌種：雙酶梭菌（Clostridiumbifermentans）、發(fā)酵氨基酸球菌（Acidaminococcusfermentans）、約氏不動桿菌（Acinetobacterjohnsonii）、魯氏不動桿菌（Acinetobacterlwoffii）、不動桿菌屬（Acinetobactersp）、氣球菌屬（Aerococcussp）、海洋細(xì)菌（Aerococcusurinaeequi）、高地芽孢桿菌（Bacillusaltitudinis）、蠟狀芽孢桿菌（Bacilluscereus）、環(huán)狀芽孢桿菌（Bacilluscirculans）、堅(jiān)強(qiáng)芽孢桿菌（Bacillusfirmus）、地衣芽孢桿菌（Bacilluslicheniformis）、海泥芽胞桿菌（Bacillusoceanisediminis）、芽孢桿菌（Bacillusoryzaecorticis）、短小芽孢桿菌（Bacilluspumilus）、芽孢桿菌（Bacillussafensis）、枯草芽孢桿菌（Bacillussubtilis）、蘇云金芽孢桿菌（Bacillusthuringiensis）、地衣芽孢菌株（Bacilluslicheniformis）、短狀桿菌（Brachybacterium）、亞麻短桿菌（Brevibacteriumlinens）、短桿菌（Brevibacterium）、布氏檸檬酸桿菌（Citrobacterbraakii）、梭菌（Clostridium）、產(chǎn)芽胞梭狀芽胞桿菌（Clostridiumsporogenes）、棒狀桿菌干燥株（Corynebacteriumxerosis）、阪崎腸桿菌（Cronobactersakazakii）、痤瘡角質(zhì)層細(xì)菌株（Cutibacteriumacnes）、腸球菌科細(xì)菌株（Enterococcaceaebacterium）、腸球菌（Enterococcusavium?

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]氟哌噻噸美利曲辛片聯(lián)合山莨菪堿片與地衣芽孢桿菌對腸易激綜合征患者心理狀態(tài)的影響和臨床療效觀察[J]. 張?zhí)品?劉功松,尹夢蝶.  當(dāng)代醫(yī)學(xué). 2020(06)
[2]基于16S rRNA高通量測序技術(shù)分析草原紅牛瘤胃微生物多樣性和功能預(yù)測的研究[J]. 吳瓊,王思珍,張適,張麗媛,胡宗福,尤歡,�；�.  畜牧與獸醫(yī). 2020(01)
[3]利用微生物殺菌劑防治馬鈴薯黃萎病[J]. 鹿秀云,趙衛(wèi)松,白穎,馬麗,張麗紅,商俊燕,蘇振賀,郭慶港,張曉云,王培培,閆磊,馬平,李社增.  中國生物防治學(xué)報(bào). 2020(02)
[4]瘤胃微生物培養(yǎng)組學(xué)研究及Hungate1000計(jì)劃項(xiàng)目進(jìn)展[J]. 綦世金,桂干北,曾澤,錢璽丞,張華琦.  農(nóng)技服務(wù). 2019(12)
[5]Effects of live yeast on differential genetic and functional attributes of rumen microbiota in beef cattle[J]. Ibukun M.Ogunade,Jerusha Lay,Kenneth Andries,Christina J.Mc Manus,Frederick Bebe.  Journal of Animal Science and Biotechnology. 2019(04)
[6]枯草芽胞桿菌262XY2x對馬鈴薯炭疽病的預(yù)防效果較好[J]. 鄭慶偉.  農(nóng)藥市場信息. 2019(23)
[7]枯草芽胞桿菌262XY2x對馬鈴薯炭疽病的預(yù)防效果較好[J]. 鄭慶偉.  農(nóng)藥市場信息. 2019 (23)
[8]釀酒酵母和地衣芽孢桿菌對綿羊瘤胃體外發(fā)酵的影響[J]. 鄭瑋才,郝小燕,張春香,項(xiàng)斌偉,張文佳,溫灝宇,張建新.  中國畜牧獸醫(yī). 2019(11)
[9]淺談地衣芽孢桿菌在畜禽上的應(yīng)用[J]. 郭浩,曹忠輝,王林庚.  江西畜牧獸醫(yī)雜志. 2019(05)
[10]瘤胃微生物宏組學(xué)分析及研究進(jìn)展[J]. 蓋葉頂,王后福,王淑玲,矣國,李鵬飛,楊仁輝,周榮康,楊振,成瀟,冷靜.  中國畜牧雜志. 2020(03)



本文編號：3563141