兩種新型鴨源Megrivirus的檢測
發(fā)布時間:2021-12-30 11:13
為了了解鴨源微RNA病毒的一個新病毒種Duck Megrivirus(DMV)在重慶市鴨群中的感染及變異情況,試驗采用RT-PCR技術(shù),應(yīng)用DMV基因組3CD序列特異性引物,對重慶市6個地區(qū)的活禽糞便樣品進行分子檢測,并使用CLUSTAL W、MEGA 5.0軟件對陽性樣品序列進行同源性分析和遺傳進化樹的構(gòu)建。結(jié)果表明:從60份活禽糞便樣品中檢出17份陽性樣品,陽性率為28%(17/60),17份陽性樣品的擴增產(chǎn)物均為DMV的283 bp 3CD序列;谛蛄型葱苑治,可將17株DMV分為3類,其中A類有15株病毒,與已知的DMV核苷酸序列同源性為96%~100%;B類有1株病毒(DMV-2/CN/Chongqing-8/2016),與已知的DMV核苷酸序列同源性為88%; C類有1株病毒(DMV-3/CN/Chongqing-10/2016),與已知的DMV核苷酸序列同源性為86%。對B類和C類這2株新型DMV(DMV-2/CN/Chongqing-8/2016和DMV-3/CN/Chongqing-10/2016)的氨基酸序列進行遺傳進化分析, 2株DMV均聚在Megriviru...
【文章來源】:黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(13)北大核心
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
微RNA病毒株遺傳進化樹的構(gòu)建結(jié)果
【參考文獻】:
博士論文
[1]用通用PCR和宏基因組學(xué)發(fā)現(xiàn)鴨和鵝的新病毒[D]. 王府民.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
本文編號:3558079
【文章來源】:黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(13)北大核心
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
微RNA病毒株遺傳進化樹的構(gòu)建結(jié)果
【參考文獻】:
博士論文
[1]用通用PCR和宏基因組學(xué)發(fā)現(xiàn)鴨和鵝的新病毒[D]. 王府民.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
本文編號:3558079
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