馬傳染性貧血病毒（Equine infectious anemia virus,EIAV）與人免疫缺陷病毒（Human immunodeficiency virus,HIV）同屬于逆轉(zhuǎn)錄病毒科慢病毒屬。EIAV是感染馬屬動(dòng)物的重要傳染病病原和用于慢病毒相關(guān)研究的重要模型病毒。上世紀(jì)七十年代,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所成功研制出EIAV中國弱毒疫苗株。該疫苗株能夠誘導(dǎo)馬屬動(dòng)物產(chǎn)生良好的免疫保護(hù),是唯一成功大規(guī)模應(yīng)用的慢病毒疫苗株。對于EIAV親本強(qiáng)毒株致弱過程中的各代次不同毒力的毒株,尤其最終獲得的疫苗弱毒株的生物學(xué)特性研究,將對研究有效慢病毒疫苗提供借鑒,具有重要的科學(xué)意義。前期研究發(fā)現(xiàn),即便宿主的免疫系統(tǒng)受到抑制,該疫苗株仍能保持其穩(wěn)定的低水平復(fù)制,提示是病毒自身的弱化,而不是宿主的免疫系統(tǒng),是EIAV弱毒疫苗株體內(nèi)低水平復(fù)制的主要原因。逆轉(zhuǎn)錄病毒能夠?qū)⑵浠蚪M以前病毒DNA的形式整合到宿主基因組,已有研究提示,前病毒DNA發(fā)生整合的宿主基因組環(huán)境對病毒的轉(zhuǎn)錄和復(fù)制有明顯影響。EIAV,特別是EIAV中國弱毒疫苗株的宿主基因組整合特性如何?是否與其在宿主體內(nèi)的低水平復(fù)制相關(guān)?對這... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：108 頁

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
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摘要
Abstract
英文縮略表
第一章 引言
    1.1 EIAV生物學(xué)特征
        1.1.1 EIAV的首次發(fā)現(xiàn)
        1.1.2 EIAV基因組構(gòu)成
        1.1.3 EIAV致病性
        1.1.4 EIAV細(xì)胞嗜性
    1.2 中國EIAV弱毒疫苗株的致弱路線
    1.3 逆轉(zhuǎn)錄病毒的生活周期
        1.3.1 逆轉(zhuǎn)錄病毒生活周期中的早期階段
        1.3.2 整合酶在病毒生活周期中的重要性
    1.4 整合酶結(jié)構(gòu)
        1.4.1 N末端區(qū)域
        1.4.2 催化核心
        1.4.3 C末端區(qū)域
    1.5 整合機(jī)制
        1.5.1 病毒DNA 3'-端的處理和鏈的轉(zhuǎn)移反應(yīng)
        1.5.2 宿主基因組上病毒插入位點(diǎn)的缺.修復(fù)
    1.6 整合前復(fù)合物
        1.6.1 病毒蛋白
        1.6.2 宿主細(xì)胞蛋白
    1.7 逆轉(zhuǎn)錄病毒在宿主基因組水平上整合位點(diǎn)的選擇特征
        1.7.1 靶向整合的DNA序列及結(jié)構(gòu)
        1.7.2 基因組水平上的整合靶向研究
    1.8 逆轉(zhuǎn)錄病毒整合位點(diǎn)選擇特征差異的機(jī)制
        1.8.1 LEDGF/p75決定著HIV-1 的靶向整合
        1.8.2 BET蛋白決定著MLV的靶向整合
    1.9 逆轉(zhuǎn)錄病毒在基因組上發(fā)生整合的后果
        1.9.1 潛伏（以HIV-1 感染為例）
        1.9.2 插入突變 (以逆轉(zhuǎn)錄病毒基因治療載體為例)
    1.10本研究目的和意義
第二章 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 細(xì)胞與病毒
        2.1.2 質(zhì)粒與菌株
        2.1.3 試劑
        2.1.4 儀器
        2.1.5 耗材
        2.1.6 引物
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 馬單核細(xì)胞分化而來的巨噬細(xì)胞及馬胎皮膚細(xì)胞的培養(yǎng)及感染
        2.2.2 細(xì)胞DNA的小量提取
        2.2.3 病毒RNA的提取
        2.2.4 反轉(zhuǎn)錄及病毒載量測定
        2.2.5 構(gòu)建病毒整合文庫
        2.2.6 PCR擴(kuò)增病毒整合文庫
        2.2.7 膠回收
        2.2.8 TA克隆與細(xì)菌轉(zhuǎn)化試驗(yàn)
        2.2.9 陽性克隆的鑒定及測序
        2.2.10序列分析
        2.2.11統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
        2.2.12序列登錄號(hào)
第三章 弱毒疫苗株EIAVFDDV13在馬基因組上的整合定位及特征
    3.1 EIAVFDDV13在馬胎皮膚細(xì)胞中的生長曲線
    3.2 該研究中所使用的整合位點(diǎn)數(shù)據(jù)集
    3.3 EIAVFDDV13前病毒的染色體分布
    3.4 EIAVFDDV13前病毒在基因內(nèi)的整合頻率
    3.5 整合位點(diǎn)周圍 40 BP范圍內(nèi)各位點(diǎn)的堿基頻率
    3.6 EIAVFDDV13前病毒整合靶向與基因組特征的相關(guān)性
    3.7 EIAVFDDV13前病毒整合靶向與重復(fù)元素的相關(guān)性
    3.8 整合有EIAVFDDV13前病毒宿主基因的GO分析
    小結(jié)
第四章 弱毒疫苗株EIAVDLV121在馬基因組上的整合定位及特征
    4.1 EIAVDLV121在馬巨噬細(xì)胞中的生長曲線
    4.2 該研究中所使用的整合位點(diǎn)數(shù)據(jù)集
    4.3 EIAVDLV121前病毒的染色體分布
    4.4 EIAVDLV121前病毒在基因內(nèi)的整合頻率及比較
    4.5 整合位點(diǎn)周圍 40 BP范圍內(nèi)各位點(diǎn)的堿基頻率
    4.6 EIAVDLV121前病毒整合靶向與基因組特征的相關(guān)性
    4.7 EIAVDLV121前病毒整合靶向與重復(fù)元素的相關(guān)性
    4.8 整合有EIAVDLV121前病毒宿主基因的GO分析
    小結(jié)
第五章 EIAVDLV34和EIAVDLV121在馬基因組上整合位點(diǎn)選擇特征比較
    5.1 在馬巨噬細(xì)胞中，EIAVDLV34和EIAVDLV121的生長曲線
    5.2 該章所使用的數(shù)據(jù)集
    5.3 EIAVDLV34和EIAVDLV121在馬染色體上的分布
    5.4 EIAVDLV34和EIAVDLV121前病毒在基因內(nèi)的整合頻率及比較
    5.5 整合位點(diǎn)周圍 40 BP范圍內(nèi)各位點(diǎn)的堿基頻率
    5.6 EIAVDLV34和EIAVDLV121前病毒整合靶向與基因組特征的相關(guān)性
    5.7 EIAVDLV34和EIAVDLV121前病毒整合靶向與重復(fù)元素的相關(guān)性
    5.8 整合有EIAV前病毒宿主基因的GO分析
    小結(jié)
第六章 討論
第七章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡歷


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]馬傳染性貧血病毒驢白細(xì)胞弱毒疫苗株致弱過程中不同代次病毒LTR的進(jìn)化分析[J]. 王雪峰,楊彬,韓秀娥,林躍智,姜成剛,呂曉玲,趙利平,周建華,王鳳龍.  中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2010(12)
[2]馬傳染性貧血病毒白細(xì)胞弱毒疫苗株及其親本毒驢強(qiáng)毒株前病毒基因組比較分析[J]. 王雪峰,姜成剛,郭巍,項(xiàng)偉,呂曉玲,趙立平,王鳳龍,孔憲剛,張曉燕,邵一鳴,周建華.  病毒學(xué)報(bào). 2008(06)
[3]馬傳染性貧血病免疫的研究[J]. 沈榮顯,徐振東,何云生,張盛興.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 1979(04)



本文編號(hào)：3550695