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蜱凋亡抑制蛋白IAP的鑒定和RNA干擾研究

發(fā)布時間:2021-12-19 14:20
  蜱是一類重要的吸血體外寄生蟲,絕大多數(shù)寄生在哺乳動物體表,少數(shù)寄生在鳥類、爬行類及兩棲類,蜱不但吸食大量血液,損害宿主皮膚,而且可以在叮咬過程中傳播多種病原體,是人和動物許多重要疾病的傳播媒介。在蜱的吸血過程當中,唾液腺是病原體傳播給宿主的通道,是蜱及蜱傳病防治中關鍵的靶器官。雌蜱的唾液腺在蜱吸血末期和飽血后會發(fā)生快速的退化,這一現(xiàn)象主要是由唾液腺細胞凋亡等程序化細胞死亡機制引起的。本論文選擇唾液腺中發(fā)現(xiàn)的凋亡抑制分子(Inhibitor of Apoptosis Protein,IAP),探索其在蜱唾液腺細胞凋亡的作用,并通過RNA干擾技術研究其功能和應用潛力。研究對象為鐮形扇頭蜱,一種大量分布于我國南部的優(yōu)勢蜱種,屬于硬蜱家族,為三宿主蜱。根據實驗室前期唾液腺轉錄組庫的數(shù)據,設計引物,成功從半飽血成蜱唾液腺中擴增出鐮形扇頭蜱凋亡抑制分子(Rhipicephalus heamaphysaloides IAP,RhIAP)的基因編碼序列,大小1887 bp,編碼607個氨基酸,RhIAP的蛋白大小約66 kDa,有3個BIR結構域和一個RING指結構域。經由實時定量PCR方法檢測了Rh... 

【文章來源】:中國農業(yè)科學院北京市

【文章頁數(shù)】:58 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

蜱凋亡抑制蛋白IAP的鑒定和RNA干擾研究


RhIAP擴增凝膠電泳結果

核苷酸序列,結構域,氨基酸,網站


IAP的BIR1(第53-122氨基酸)和BIR2(第198-263氨基酸)分別含有70和66個氨基酸,它們之間相隔75個氨基酸,BIR3(第330-398氨基酸)包含69個氨基酸,與BIR2相隔66個氨基酸,接下來相隔155個氨基酸后是含有個氨基酸的RING值結構域(第554-607氨基酸)。圖2-2測序后的RhIAP的全長基因序列及預測的氨基酸序列綠色,藍色,黃色和紅色網格分別是BIR1,BIR2,BIR3和RING指結構域。Fig.2-2.NucleotideandpredictedaminoacidsequencesofRhIAPTheBIR1,BIR2,BIR3andRINGfingerdomainsaresignedbygreen,blue,yellowandredgrid.圖2-3測序后RhIAP核苷酸序列經NCBI網站預測結構域Fig.2-3TheconserveddomainanylisisresultofRhIAPsequencebyNCBI102030405060708090100110120130140150TACGCCAAGCTTGCATGCCTGCAGGTCGACGATTTTGCCTGGAGCCTACGCAGTTGTGAAACAGGAGGAATACCAGGAGGTGCGCCTTGGTTGCGTTAGGTTTCCCAAGTTGAATTTCGTTGCTGTTCACTCGGCTCCGCTGTTTCGTCT160170180190200210220230240250260270280290300GGACAGGATCGGCCTGTGTGGGGCCAGTCATCACGCAGAGAGGCGTGTACGATGGATAAGCCTAGAGCCAATGCGAGTGGTACAGGAAATCAGCGTGCTTTATCAATGACGCGGCGGTAAAATGAAATTTCCTGATAACCATTCACTGCT310320330340350360370380390400410420430440450CAGTTCGGCGTCCCGACTGCCGCACATCGAGCCTGTTGATGTGTTCAATGGCGTCTATGATGGTGGGCACGGCAGTGACGCAACGGGGGCCGCTCGCCTTCCCGGCATCTGAGCAGACGGTTCTGGATGGGTCCATGGGGGCAGTGGTGAMCSMASMMVGTAVTQRGPLAFPASEQTVLDGSMGAVVS460470480490500510520530540550560570580590600GCAAGTTCACCAAGATGGCCGGTACTGCTGACTATAGCCGAGAGGAACACAGGCTTCCCACTTTTAGTGAGTGGCCCCCAAACGCCCCAGTATCTGCGAAAAAGCTGGCCCAGGGTGGCTTTGTGTGTATTAACGCTTCCAGACTTCTGAKFTKMAGTADYSREEHRLPTFSEWPPNAPVSAKKLAQGGFV

進化樹,硬蜱


sapiens,sp|P98170|;Ixodesscapularis,tr|B7Q7F6|;Ixodesricinus,tr|A0A147BHH1|;Bombyxmori,tr|E9JEI0|;Aedesaegypti,tr|Q175J8|;Drosophilamelanogaster,sp|Q24307|;Rhipicephalusappendiculatus,tr|A0A131YI84|。利用MEGA5,通過最大概似法構建進化樹,結果顯示鐮形扇頭蜱RhIAP與具尾扇頭蜱關系最近,同源性高達87.81%,其次是兩種硬蜱,肩突硬蜱54.07%,篦子硬蜱48.19%,接下來是三種節(jié)肢動物,果蠅32.64%,伊蚊32.21%,蠶31.61%,與哺乳動物同源性較低,家鼠28.67%,小鼠28.2%,人27.21%。圖2-4系統(tǒng)進化樹的構建Fig.2-4.phylogenetictreeofRhIAPfromdifferentorganismsbasedonaminoacidsequence2.5討論凋亡抑制蛋白家族成員眾多,分布廣泛,從結構簡單的原生動物到復雜的多細胞生物體,從有脊椎的哺乳動物到無脊椎的節(jié)肢動物都有IAP蛋白,而對于蜱尚未有關于凋亡抑制分子的研究。本研究選擇在鐮形扇頭蜱唾液腺轉錄組文庫中發(fā)現(xiàn)的一條凋亡抑制相關基因,根據其ORF設計引物,克隆獲得了鐮形扇頭蜱的凋亡抑制蛋白基因序列,命名為RhIAP。獲得的RhIAP是一個典型的有桿狀病毒IAP重復序列的凋亡抑制分子,在C末端還有一個RING指結構域。根據序列同源性,IAP分子分為IAP1至IAP5五種類型(LUQUEetal.2001),RhIAP與果蠅的DIAP2,其他物種的IAP2以及哺乳動物XIAP有相同的結構域構成,都有3個BIR結構域和一個RING指結構域,因此判斷RhIAP也屬于2型IAP分子。凋亡抑制分子主要分布在細胞核附近,所以一般不含有信號肽序列,通過軟件分析發(fā)現(xiàn)RhIAP也不含有信號肽序列。將RhIAP與其他幾種硬蜱、昆蟲和哺乳動物的2型IAP進行同源性分析,結果顯示RhIAP與其他硬蜱家族IAP2氨基酸序列的同源性并不算高,除了與具尾扇頭蜱處在同一分支


本文編號:3544569

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