雞CTNNB1和pri-miR-458b SNPs與產(chǎn)蛋性狀關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時間:2021-12-17 12:48
產(chǎn)蛋性狀是由復(fù)雜的基因網(wǎng)絡(luò)調(diào)控的數(shù)量性狀。雞卵巢卵泡發(fā)育受多種基因調(diào)控,以CTNNB1為中心的Wnt信號通路和miRNA都可以參與調(diào)節(jié)卵巢卵泡發(fā)育。本課題組前期發(fā)現(xiàn)濟寧百日雞140日齡開產(chǎn)前后卵巢CTNNB1和miR-458b-5p差異表達,且表達趨勢相反。并進一步研究發(fā)現(xiàn)miR-458b-5p通過靶向CTNNB1抑制體外培養(yǎng)的雞等級卵泡顆粒細(xì)胞的增殖。本研究旨在探究雞CTNNB1和pri-miR-458b的多態(tài)性及其與產(chǎn)蛋性狀的關(guān)聯(lián),以濟寧百日雞為研究材料,通過混池測序?qū)ふ褻TNNB1和pri-miR-458b的多態(tài)位點,再通過PCR產(chǎn)物直接測序的方法進行個體分型,將其與開產(chǎn)日齡、產(chǎn)蛋量進行關(guān)聯(lián)分析,期望從中找到有價值的分子標(biāo)記。主要研究結(jié)果如下:(1)CTNNB1基因5’調(diào)控區(qū)共檢測出10個多態(tài)位點,低度多態(tài)位點有4個(-1295、-1249、-1154、-660,PIC<0.25),其余位點均呈現(xiàn)中度多態(tài)(0.25<PIC<0.05)。pri-miR-458b共檢測出30個多態(tài)位點,中度多態(tài)位點有6個(g.8954697、g.8954931、g.8954984、...
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
Wnt/β-Catenin信號通路示意圖(MacDonaldetal.,2009)
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文5鼠不育的結(jié)果一致(HernandezGiffordetal.,2009)。此外,通過Ctnnb1(Ex3)fl/fl和Ctnnb1fl/fl小鼠模型發(fā)現(xiàn),F(xiàn)SH/cAMP信號通路激活顆粒細(xì)胞β-Catenin的轉(zhuǎn)錄,增強了FSH誘導(dǎo)的Cyp19的表達(Fanetal.,2010)。因此有可能一旦PI3K/AKT被FSH激活,使得β-Catenin能與SF1結(jié)合,啟動下游靶基因Cyp19a1的轉(zhuǎn)錄,參與調(diào)節(jié)卵巢激素合成。圖1-2PI3K/AKT與Wnt/β-Catenin信號通路相互作用(Boyeretal.,2010)Figure1-2InteractionsbetweenthePI3K/AKTandWnt/β-Cateninsignalingpathways(Boyeretal.,2010)1.2miRNA研究進展1.2.1miRNA發(fā)現(xiàn)及加工過程MicroRNAs(miRNAs)是一類長約22nt具有調(diào)控功能的非編碼單鏈小RNA,由細(xì)胞內(nèi)源產(chǎn)生的發(fā)卡(hairpin)結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄本加工而來(Kim,2005)。最初miRNA是在線蟲中發(fā)現(xiàn)的,1993年Lee等在線蟲中發(fā)現(xiàn)了一種名為lin-4的基因,長22nt的lin-4并不編碼蛋白,能夠調(diào)節(jié)秀麗隱桿線蟲細(xì)胞時序發(fā)育(Leeetal.,1993)。到2001年,人們發(fā)現(xiàn)了大量小RNA序列,將其統(tǒng)一命名為miRNA。隨后的幾年里,在各個物種中發(fā)現(xiàn)了大量的miRNA,從而開辟了一片全新而廣闊的科學(xué)研究領(lǐng)域。動物miRNA是一類在進化上高度保守的基因。miRNA分布于基因組的各個位置,其中約有40%的miRNA位于編碼基因的內(nèi)含子區(qū)域,與宿主基因共享啟動子和調(diào)控元件(Bartel,2004)。miRNA的加工成熟是一個復(fù)雜精密的過程,需要多種酶和輔助蛋白協(xié)調(diào)完成(Kim,2005)。在動物細(xì)胞核內(nèi),RNA聚合酶Ⅱ?qū)iRNA基因轉(zhuǎn)錄為長數(shù)千nt且內(nèi)部有
miRNAs的生物合成(Jungetal.,2015)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Mechanism of miR-21 via Wnt/β-catenin signaling pathway in human A549 lung cancer cells and Lewis lung carcinoma in mice[J]. Dan Wu,Min Shi,Xiao-Dong Fan. Asian Pacific Journal of Tropical Medicine. 2015(06)
[2]MicroRNA與細(xì)胞信號通路的相互作用[J]. 李斌,郭燕華,徐輝,周惠,屈良鵠. 生物化學(xué)與生物物理進展. 2013(07)
[3]文昌雞MTNR1B基因的多態(tài)性及其與產(chǎn)蛋性狀的關(guān)系[J]. 李曉寧,王慧,于希江,姜運良,宋倩,閆超,唐輝. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2012(04)
[4]家禽單核苷酸多態(tài)性研究與應(yīng)用新進展[J]. 盧立志,李進軍,田勇,傅衍. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2010(02)
碩士論文
[1]啟動子區(qū)SNPs及DNA甲基化對缺血性腦卒中患者ABCA1基因表達的調(diào)控機制研究[D]. 王君.鄭州大學(xué) 2019
[2]濟寧百日雞產(chǎn)蛋曲線擬合及ASMT基因5’調(diào)控區(qū)多態(tài)性分析[D]. 滕軍.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[3]miR-458b-5p調(diào)控基因CTNNB1對雞卵泡顆粒細(xì)胞增殖的影響[D]. 張深.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[4]雞miR-1666前體區(qū)SNP對其成熟體生成和其靶基因調(diào)控的影響[D]. 王善禾.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
本文編號:3540153
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
Wnt/β-Catenin信號通路示意圖(MacDonaldetal.,2009)
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文5鼠不育的結(jié)果一致(HernandezGiffordetal.,2009)。此外,通過Ctnnb1(Ex3)fl/fl和Ctnnb1fl/fl小鼠模型發(fā)現(xiàn),F(xiàn)SH/cAMP信號通路激活顆粒細(xì)胞β-Catenin的轉(zhuǎn)錄,增強了FSH誘導(dǎo)的Cyp19的表達(Fanetal.,2010)。因此有可能一旦PI3K/AKT被FSH激活,使得β-Catenin能與SF1結(jié)合,啟動下游靶基因Cyp19a1的轉(zhuǎn)錄,參與調(diào)節(jié)卵巢激素合成。圖1-2PI3K/AKT與Wnt/β-Catenin信號通路相互作用(Boyeretal.,2010)Figure1-2InteractionsbetweenthePI3K/AKTandWnt/β-Cateninsignalingpathways(Boyeretal.,2010)1.2miRNA研究進展1.2.1miRNA發(fā)現(xiàn)及加工過程MicroRNAs(miRNAs)是一類長約22nt具有調(diào)控功能的非編碼單鏈小RNA,由細(xì)胞內(nèi)源產(chǎn)生的發(fā)卡(hairpin)結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄本加工而來(Kim,2005)。最初miRNA是在線蟲中發(fā)現(xiàn)的,1993年Lee等在線蟲中發(fā)現(xiàn)了一種名為lin-4的基因,長22nt的lin-4并不編碼蛋白,能夠調(diào)節(jié)秀麗隱桿線蟲細(xì)胞時序發(fā)育(Leeetal.,1993)。到2001年,人們發(fā)現(xiàn)了大量小RNA序列,將其統(tǒng)一命名為miRNA。隨后的幾年里,在各個物種中發(fā)現(xiàn)了大量的miRNA,從而開辟了一片全新而廣闊的科學(xué)研究領(lǐng)域。動物miRNA是一類在進化上高度保守的基因。miRNA分布于基因組的各個位置,其中約有40%的miRNA位于編碼基因的內(nèi)含子區(qū)域,與宿主基因共享啟動子和調(diào)控元件(Bartel,2004)。miRNA的加工成熟是一個復(fù)雜精密的過程,需要多種酶和輔助蛋白協(xié)調(diào)完成(Kim,2005)。在動物細(xì)胞核內(nèi),RNA聚合酶Ⅱ?qū)iRNA基因轉(zhuǎn)錄為長數(shù)千nt且內(nèi)部有
miRNAs的生物合成(Jungetal.,2015)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Mechanism of miR-21 via Wnt/β-catenin signaling pathway in human A549 lung cancer cells and Lewis lung carcinoma in mice[J]. Dan Wu,Min Shi,Xiao-Dong Fan. Asian Pacific Journal of Tropical Medicine. 2015(06)
[2]MicroRNA與細(xì)胞信號通路的相互作用[J]. 李斌,郭燕華,徐輝,周惠,屈良鵠. 生物化學(xué)與生物物理進展. 2013(07)
[3]文昌雞MTNR1B基因的多態(tài)性及其與產(chǎn)蛋性狀的關(guān)系[J]. 李曉寧,王慧,于希江,姜運良,宋倩,閆超,唐輝. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2012(04)
[4]家禽單核苷酸多態(tài)性研究與應(yīng)用新進展[J]. 盧立志,李進軍,田勇,傅衍. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2010(02)
碩士論文
[1]啟動子區(qū)SNPs及DNA甲基化對缺血性腦卒中患者ABCA1基因表達的調(diào)控機制研究[D]. 王君.鄭州大學(xué) 2019
[2]濟寧百日雞產(chǎn)蛋曲線擬合及ASMT基因5’調(diào)控區(qū)多態(tài)性分析[D]. 滕軍.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[3]miR-458b-5p調(diào)控基因CTNNB1對雞卵泡顆粒細(xì)胞增殖的影響[D]. 張深.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[4]雞miR-1666前體區(qū)SNP對其成熟體生成和其靶基因調(diào)控的影響[D]. 王善禾.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
本文編號:3540153
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