采用RT-PCR的方法對(duì)貴州黑山羊LYRM1基因進(jìn)行了克隆,并對(duì)該基因的編碼區(qū)序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,利用qRT-PCR的方法檢測(cè)LYRM1基因在貴州黑山羊不同組織中mRNA的相對(duì)表達(dá)量以及在不同月齡的時(shí)序表達(dá)。結(jié)果:黑山羊LYRM1基因的編碼區(qū)全長(zhǎng)369 bp,編碼122個(gè)氨基酸,編碼蛋白分子質(zhì)量為14.4 kDa,理論等電點(diǎn)為9.73,不穩(wěn)定系數(shù)為49.48,為不穩(wěn)定蛋白;與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中提供的山羊LYRM1基因的編碼區(qū)序列匹配度為99%,存在2個(gè)堿基的突變,分別為第177位和242位;通過LYRM1基因系統(tǒng)進(jìn)化樹得知,黑山羊與牛的進(jìn)化距離較近,與斑馬魚進(jìn)化距離較遠(yuǎn)。qRT-PCR結(jié)果顯示LYRM1基因在貴州黑山羊7個(gè)組織中均有表達(dá),在脂肪組織的表達(dá)量最高,背最長(zhǎng)肌中的表達(dá)量最低;時(shí)序表達(dá)結(jié)果表明,LYRM1基因在黑山羊脂肪組織的整體表達(dá)趨勢(shì)為先增加再減少,6月齡的表達(dá)量最高,7日齡最低。本試驗(yàn)成功克隆了黑山羊LYRM1基因編碼區(qū)并進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,且檢測(cè)了其在黑山羊不同組織中的表達(dá)以及在脂肪組織中的時(shí)序表達(dá),為深入研究LYRM1基因功能奠定基礎(chǔ)。 

【文章來源】：畜牧與獸醫(yī). 2020,52(09)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

LYRM1基因PCR擴(kuò)增電泳

測(cè)序結(jié)果顯示克隆得到的黑山羊LYRM1基因編碼區(qū)全長(zhǎng)369 bp,編碼122個(gè)氨基酸(圖2);測(cè)序結(jié)果與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中提供的山羊LYRM1基因的編碼區(qū)序列匹配度為99%,分析發(fā)現(xiàn)了2個(gè)堿基的突變:一處為177位(G→C)的同義突變,另一處為242位(A→C)的錯(cuò)義突變,由絡(luò)氨酸(Y)突變?yōu)榻z氨酸(S)(圖3)。經(jīng)BLAST軟件進(jìn)行同源性比對(duì),發(fā)現(xiàn)黑山羊LYRM1基因與山羊(登錄號(hào):XM_005697576.3)、馬(登錄號(hào):XM_023616163.1)、人(登錄號(hào):NM_001128301.3)、牛(登錄號(hào):NM_001205637.1)同源性分別為99.46%、92.89%、93.77%和98.1%;通過構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn),黑山羊與山羊聚為一支,與牛的進(jìn)化距離較近,與斑馬魚等親緣關(guān)系較遠(yuǎn)(圖4)。圖3 序列比對(duì)結(jié)果

LYRM1基因系統(tǒng)進(jìn)化樹

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]LYRM1與LYRM2基因?qū)Π紫簇i脂肪沉積的影響研究[D]. 苑洪霞.貴州大學(xué) 2018



本文編號(hào)：3539847