鴿屠體和肉質(zhì)性狀相關(guān)基因的遺傳效應(yīng)及表達研究
發(fā)布時間:2021-12-17 08:42
本研究以泰深王鴿為研究對象,研究了 DGAT2、ADSL、FABP1、FABP2和FABP3五個基因多態(tài)性及其與屠體和肉質(zhì)性狀的遺傳相關(guān),利用熒光定量PCR技術(shù)研究了基因在鴿組織中的表達特點,采取組織學(xué)切片技術(shù)研究了鴿肌纖維發(fā)育特征。在此基礎(chǔ)上,應(yīng)用慢病毒介導(dǎo)的RANi技術(shù)研究了干擾FABP1、FABP2和FABP3基因?qū)澟咛コ衫w維細胞增殖和凋亡的影響。主要研究結(jié)果如下:1、利用直接測序法對200只4周齡鴿的DGAT2、ADSL、FABP1、FABP2和FABP3五個基因進行了多態(tài)性檢測和分型,并與屠體及肉質(zhì)性狀進行了關(guān)聯(lián)分析。(1)在DGAT2基因上共檢測到了 5個SNP位點,其中有2個位點與鴿屠體及肉質(zhì)性狀有顯著相關(guān)。在G18398T位點上,AA和AB基因型的腹脂重和腹脂率極顯著高于BB基因型(P<0.01),而BB基因型的肌苷酸和肌內(nèi)脂肪含量極顯著高于AA和AB基因型(P<0.01);在G22484C位點上,AA基因型的宰前活重、屠體重、半凈膛重、全凈膛重和胸肌重極顯著高于AB和BB基因型(P<0.01),BB基因型的肌內(nèi)脂肪含量顯著高于AA和AB基因型(P&...
【文章來源】: 浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:162 頁
【文章目錄】:
縮略詞表
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
1 SNP的研究進展
1.1 SNP的分類及作用
1.2 SNP的特性
1.3 SNP的檢測技術(shù)
1.4 SNP的研究意義
2 性狀相關(guān)基因的研究進展
2.1 DGAT2基因的研究進展
2.2 ADSL基因的研究進展
2.3 FABP1、FABP2、FABP3基因的研究進展
3 肉品質(zhì)和肌肉組織學(xué)特性的研究進展
3.1 肉品質(zhì)的評價指標
3.2 肉品質(zhì)的影響因素
3.3 肌肉組織學(xué)特性及其與肉品質(zhì)的關(guān)系
3.4 肌纖維發(fā)育特征及影響因素
4 RNA干擾的研究進展
4.1 RNA干擾的發(fā)現(xiàn)
4.2 RNA干擾的作用機制
4.3 RNA干擾的特點
4.4 RNA干擾的應(yīng)用
5 本研究目的和意義
第二章 鴿DGAT2、ADSL、FABP1、FABP2、FABP3基因多態(tài)性及其與屠體和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
1 實驗材料
1.1 實驗動物
1.2 主要儀器
1.3 主要試劑
1.4 溶液試劑配制
1.5 實驗器材處理與滅菌
2 實驗方法
2.1 屠體性狀測定
2.2 肉質(zhì)性狀測定
2.3 基因組DNA的提取及檢測
2.4 引物設(shè)計、溶解及稀釋
2.5 PCR反應(yīng)體系及程序
2.6 PCR產(chǎn)物直接測序、SNP分型及氨基酸序列分析
2.7 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
3 結(jié)果與分析
3.1 基因組DNA的提取結(jié)果
3.2 PCR擴增結(jié)果
3.3 基因多態(tài)性及氨基酸序列分析結(jié)果
3.4 基因頻率、基因型頻率及群體遺傳特性
3.5 基因多態(tài)性與屠體性狀及肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4 討論
4.1 DGAT2基因多態(tài)性及其與屠體和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.2 ADSL基因多態(tài)性及其與屠體和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.3 FABP1基因多態(tài)性及其與屠體和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.4 FABP2基因多態(tài)性及其與屠體和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.5 FABP3基因多態(tài)性及其與屠體和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
第三章 鴿DGAT2、ADSL、FABP1、FABP2、FABP3基因時空表達及肌纖維發(fā)育特征的研究
1 實驗材料
1.1 實驗動物
1.2 主要儀器
1.3 主要試劑
1.4 溶液試劑配制
1.5 實驗器材處理與滅菌
2 實驗方法
2.1 基因時空表達譜的建立
2.2 鴿肌纖維切片制作和圖像分析
3 結(jié)果與分析
3.1 DGAT2基因時空表達譜
3.2 ADSL基因時空表達譜
3.3 FABP1基因時空表達譜
3.4 FABP2基因時空表達譜
3.5 FABP3基因時空表達譜
3.6 鴿肌纖維發(fā)育特征
4 討論
4.1 關(guān)于相對定量法條件優(yōu)化
4.2 DGAT2基因的表達
4.3 ADSL基因的表達
4.4 FABP1基因的表達
4.5 FABP2基因的表達
4.6 FABP3基因的表達
4.7 肌纖維發(fā)育特征
第四章 慢病毒介導(dǎo)的RNA干擾FABP1、FABP2和FABP3基因?qū)澟咛コ衫w維細胞增殖與凋亡的初步研究
1 實驗材料
1.1 實驗動物
1.2 主要儀器
1.3 主要試劑
1.4 溶液試劑配制
1.5 實驗器材處理與滅菌
2 實驗方法
2.1 鴿胚胎成纖維細胞的培養(yǎng)、傳代與凍存
2.2 siRNA的設(shè)計、轉(zhuǎn)染及篩選
2.3 慢病毒載體構(gòu)建及包裝
2.4 重組慢病毒轉(zhuǎn)染成纖維細胞
2.5 轉(zhuǎn)染后細胞增殖與凋亡檢測
3 結(jié)果與分析
3.1 鴿成纖維細胞原代細胞與傳代細胞形態(tài)觀察
3.2 鴿胚胎成纖維細胞生長曲線
3.3 siRNA的篩選結(jié)果
3.4 重組慢病毒干擾載體的測序鑒定結(jié)果
3.5 慢病毒滴度測定結(jié)果
3.6 重組慢病毒轉(zhuǎn)染效率檢測
3.7 干擾FABP1、FABP2和FABP3基因后細胞增殖檢測
3.8 干擾FABP1、FABP2和FABP3基因后細胞凋亡檢測
4 討論
4.1 鴿胚胎成纖維細胞的培養(yǎng)
4.2 慢病毒介導(dǎo)的RNA干擾
4.3 FABP1、FABP2和FABP3基因干擾對成纖維細胞增殖的影響
4.4 FABP1、FABP2和FABP3基因干擾對成纖維細胞凋亡的影響
第五章 結(jié)論、創(chuàng)新點及研究展望
參考文獻
博士期間科研成果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]北川白山羊FABP3基因cDNA的克隆及表達研究 [J]. 姚毅,馬紅艷,呂學(xué)斌,楊躍奎. 中國畜牧雜志. 2017(06)
[2]鴨I-FABP基因的克隆、組織表達模式及功能研究 [J]. 陳芳,張昊,盧立志. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2016(05)
[3]魯禽3號麻雞優(yōu)良肉質(zhì)性狀分子遺傳標記篩選 [J]. 王丹丹,周艷,雷秋霞,韓海霞,林浴霜. 中國家禽. 2016(09)
[4]FABP-5基因沉默對宮頸癌SiHa細胞生物學(xué)特性的影響 [J]. 陳逢振,尹利榮. 中國組織工程研究. 2016(15)
[5]南方農(nóng)區(qū)不同飼養(yǎng)方式和類群羔羊胴體品質(zhì)及肉質(zhì)比較 [J]. 錢勇,鐘聲,張俊,李隱俠,黎有娣. 家畜生態(tài)學(xué)報. 2015(04)
[6]沉默F(xiàn)ABP-5基因?qū)θ烁伟〩epG2細胞的影響 [J]. 周玲麗,曹驥,李薇,羅旺,楊香娣,楊春,駱成飄,唐艷萍,李瑗. 世界華人消化雜志. 2015(02)
[7]高脂飲食對幼年大鼠小腸組織FABP2 mRNA表達的影響 [J]. 徐云鵬,王文棟,郝敏,張曉磊,高雪,常曉彤. 衛(wèi)生研究. 2014(05)
[8]北京鴨FABP2基因多態(tài)性與體尺和屠體性狀的相關(guān)性研究 [J]. 廖秀冬,任立明,王光瑛,李昂,黃銀花. 中國家禽. 2012(17)
[9]大白豬二脂酰甘油�;D(zhuǎn)移酶1和2基因(DGAT1和DGAT2)發(fā)育性表達特點及其與背膘厚的關(guān)聯(lián)分析 [J]. 王國富,高樹新,張立凡,蔡兆偉,徐寧迎. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2011(04)
[10]鴨肝臟基礎(chǔ)型脂肪酸結(jié)合蛋白Lb-FABP基因的克隆、組織表達譜和序列特征分析 [J]. 鐘萬福,李加琪,楊承忠,王翀,張豪,張愛玲. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(20)
博士論文
[1]雞肌苷酸相關(guān)候選基因遺傳效應(yīng)及表達規(guī)律研究[D]. 束婧婷.揚州大學(xué). 2008
[2]萊蕪豬肉質(zhì)特性及其分子遺傳學(xué)基礎(chǔ)的研究[D]. 曾勇慶.南京農(nóng)業(yè)大學(xué). 2004
[3]DGAT1和DGAT2基因多態(tài)性與牛部分經(jīng)濟性狀相關(guān)性的研究[D]. 徐秀容.西北農(nóng)林科技大學(xué). 2004
碩士論文
[1]雞DGAT2基因組織表達特性及其SNP、CNV遺傳效應(yīng)分析[D]. 付金秀.河南農(nóng)業(yè)大學(xué). 2016
[2]山羊PPARγ和FABP家族基因的分離鑒定、組織表達及其多態(tài)性檢測[D]. 蔣婧.四川農(nóng)業(yè)大學(xué). 2012
[3]RNA干擾技術(shù)沉默A-FABP基因?qū)χ炯毎铣筛视腿ゼ爸?lián)素分泌的影響[D]. 鐘敏.南華大學(xué). 2011
[4]鴨ADSL與PurH基因序列特征及表達與肌肉肌苷酸(IMP)含量的相關(guān)性分析[D]. 徐善金.南京農(nóng)業(yè)大學(xué). 2011
[5]鴨A-FABP和H-FABP基因cDNA序列克隆及其mRNA表達規(guī)律的研究[D]. 儲冬生.揚州大學(xué). 2008
[6]藏豬和太湖豬H-FABP基因表達及肌內(nèi)脂肪含量的發(fā)育性變化研究[D]. 黃河.四川農(nóng)業(yè)大學(xué). 2007
[7]南陽牛幾個基因的多態(tài)性及其與生長發(fā)育性狀的相關(guān)性的研究[D]. 張爭鋒.西北農(nóng)林科技大學(xué). 2006
本文編號:3539773
【文章來源】: 浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:162 頁
【文章目錄】:
縮略詞表
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
1 SNP的研究進展
1.1 SNP的分類及作用
1.2 SNP的特性
1.3 SNP的檢測技術(shù)
1.4 SNP的研究意義
2 性狀相關(guān)基因的研究進展
2.1 DGAT2基因的研究進展
2.2 ADSL基因的研究進展
2.3 FABP1、FABP2、FABP3基因的研究進展
3 肉品質(zhì)和肌肉組織學(xué)特性的研究進展
3.1 肉品質(zhì)的評價指標
3.2 肉品質(zhì)的影響因素
3.3 肌肉組織學(xué)特性及其與肉品質(zhì)的關(guān)系
3.4 肌纖維發(fā)育特征及影響因素
4 RNA干擾的研究進展
4.1 RNA干擾的發(fā)現(xiàn)
4.2 RNA干擾的作用機制
4.3 RNA干擾的特點
4.4 RNA干擾的應(yīng)用
5 本研究目的和意義
第二章 鴿DGAT2、ADSL、FABP1、FABP2、FABP3基因多態(tài)性及其與屠體和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
1 實驗材料
1.1 實驗動物
1.2 主要儀器
1.3 主要試劑
1.4 溶液試劑配制
1.5 實驗器材處理與滅菌
2 實驗方法
2.1 屠體性狀測定
2.2 肉質(zhì)性狀測定
2.3 基因組DNA的提取及檢測
2.4 引物設(shè)計、溶解及稀釋
2.5 PCR反應(yīng)體系及程序
2.6 PCR產(chǎn)物直接測序、SNP分型及氨基酸序列分析
2.7 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
3 結(jié)果與分析
3.1 基因組DNA的提取結(jié)果
3.2 PCR擴增結(jié)果
3.3 基因多態(tài)性及氨基酸序列分析結(jié)果
3.4 基因頻率、基因型頻率及群體遺傳特性
3.5 基因多態(tài)性與屠體性狀及肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4 討論
4.1 DGAT2基因多態(tài)性及其與屠體和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.2 ADSL基因多態(tài)性及其與屠體和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.3 FABP1基因多態(tài)性及其與屠體和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.4 FABP2基因多態(tài)性及其與屠體和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.5 FABP3基因多態(tài)性及其與屠體和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
第三章 鴿DGAT2、ADSL、FABP1、FABP2、FABP3基因時空表達及肌纖維發(fā)育特征的研究
1 實驗材料
1.1 實驗動物
1.2 主要儀器
1.3 主要試劑
1.4 溶液試劑配制
1.5 實驗器材處理與滅菌
2 實驗方法
2.1 基因時空表達譜的建立
2.2 鴿肌纖維切片制作和圖像分析
3 結(jié)果與分析
3.1 DGAT2基因時空表達譜
3.2 ADSL基因時空表達譜
3.3 FABP1基因時空表達譜
3.4 FABP2基因時空表達譜
3.5 FABP3基因時空表達譜
3.6 鴿肌纖維發(fā)育特征
4 討論
4.1 關(guān)于相對定量法條件優(yōu)化
4.2 DGAT2基因的表達
4.3 ADSL基因的表達
4.4 FABP1基因的表達
4.5 FABP2基因的表達
4.6 FABP3基因的表達
4.7 肌纖維發(fā)育特征
第四章 慢病毒介導(dǎo)的RNA干擾FABP1、FABP2和FABP3基因?qū)澟咛コ衫w維細胞增殖與凋亡的初步研究
1 實驗材料
1.1 實驗動物
1.2 主要儀器
1.3 主要試劑
1.4 溶液試劑配制
1.5 實驗器材處理與滅菌
2 實驗方法
2.1 鴿胚胎成纖維細胞的培養(yǎng)、傳代與凍存
2.2 siRNA的設(shè)計、轉(zhuǎn)染及篩選
2.3 慢病毒載體構(gòu)建及包裝
2.4 重組慢病毒轉(zhuǎn)染成纖維細胞
2.5 轉(zhuǎn)染后細胞增殖與凋亡檢測
3 結(jié)果與分析
3.1 鴿成纖維細胞原代細胞與傳代細胞形態(tài)觀察
3.2 鴿胚胎成纖維細胞生長曲線
3.3 siRNA的篩選結(jié)果
3.4 重組慢病毒干擾載體的測序鑒定結(jié)果
3.5 慢病毒滴度測定結(jié)果
3.6 重組慢病毒轉(zhuǎn)染效率檢測
3.7 干擾FABP1、FABP2和FABP3基因后細胞增殖檢測
3.8 干擾FABP1、FABP2和FABP3基因后細胞凋亡檢測
4 討論
4.1 鴿胚胎成纖維細胞的培養(yǎng)
4.2 慢病毒介導(dǎo)的RNA干擾
4.3 FABP1、FABP2和FABP3基因干擾對成纖維細胞增殖的影響
4.4 FABP1、FABP2和FABP3基因干擾對成纖維細胞凋亡的影響
第五章 結(jié)論、創(chuàng)新點及研究展望
參考文獻
博士期間科研成果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]北川白山羊FABP3基因cDNA的克隆及表達研究 [J]. 姚毅,馬紅艷,呂學(xué)斌,楊躍奎. 中國畜牧雜志. 2017(06)
[2]鴨I-FABP基因的克隆、組織表達模式及功能研究 [J]. 陳芳,張昊,盧立志. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2016(05)
[3]魯禽3號麻雞優(yōu)良肉質(zhì)性狀分子遺傳標記篩選 [J]. 王丹丹,周艷,雷秋霞,韓海霞,林浴霜. 中國家禽. 2016(09)
[4]FABP-5基因沉默對宮頸癌SiHa細胞生物學(xué)特性的影響 [J]. 陳逢振,尹利榮. 中國組織工程研究. 2016(15)
[5]南方農(nóng)區(qū)不同飼養(yǎng)方式和類群羔羊胴體品質(zhì)及肉質(zhì)比較 [J]. 錢勇,鐘聲,張俊,李隱俠,黎有娣. 家畜生態(tài)學(xué)報. 2015(04)
[6]沉默F(xiàn)ABP-5基因?qū)θ烁伟〩epG2細胞的影響 [J]. 周玲麗,曹驥,李薇,羅旺,楊香娣,楊春,駱成飄,唐艷萍,李瑗. 世界華人消化雜志. 2015(02)
[7]高脂飲食對幼年大鼠小腸組織FABP2 mRNA表達的影響 [J]. 徐云鵬,王文棟,郝敏,張曉磊,高雪,常曉彤. 衛(wèi)生研究. 2014(05)
[8]北京鴨FABP2基因多態(tài)性與體尺和屠體性狀的相關(guān)性研究 [J]. 廖秀冬,任立明,王光瑛,李昂,黃銀花. 中國家禽. 2012(17)
[9]大白豬二脂酰甘油�;D(zhuǎn)移酶1和2基因(DGAT1和DGAT2)發(fā)育性表達特點及其與背膘厚的關(guān)聯(lián)分析 [J]. 王國富,高樹新,張立凡,蔡兆偉,徐寧迎. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2011(04)
[10]鴨肝臟基礎(chǔ)型脂肪酸結(jié)合蛋白Lb-FABP基因的克隆、組織表達譜和序列特征分析 [J]. 鐘萬福,李加琪,楊承忠,王翀,張豪,張愛玲. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(20)
博士論文
[1]雞肌苷酸相關(guān)候選基因遺傳效應(yīng)及表達規(guī)律研究[D]. 束婧婷.揚州大學(xué). 2008
[2]萊蕪豬肉質(zhì)特性及其分子遺傳學(xué)基礎(chǔ)的研究[D]. 曾勇慶.南京農(nóng)業(yè)大學(xué). 2004
[3]DGAT1和DGAT2基因多態(tài)性與牛部分經(jīng)濟性狀相關(guān)性的研究[D]. 徐秀容.西北農(nóng)林科技大學(xué). 2004
碩士論文
[1]雞DGAT2基因組織表達特性及其SNP、CNV遺傳效應(yīng)分析[D]. 付金秀.河南農(nóng)業(yè)大學(xué). 2016
[2]山羊PPARγ和FABP家族基因的分離鑒定、組織表達及其多態(tài)性檢測[D]. 蔣婧.四川農(nóng)業(yè)大學(xué). 2012
[3]RNA干擾技術(shù)沉默A-FABP基因?qū)χ炯毎铣筛视腿ゼ爸?lián)素分泌的影響[D]. 鐘敏.南華大學(xué). 2011
[4]鴨ADSL與PurH基因序列特征及表達與肌肉肌苷酸(IMP)含量的相關(guān)性分析[D]. 徐善金.南京農(nóng)業(yè)大學(xué). 2011
[5]鴨A-FABP和H-FABP基因cDNA序列克隆及其mRNA表達規(guī)律的研究[D]. 儲冬生.揚州大學(xué). 2008
[6]藏豬和太湖豬H-FABP基因表達及肌內(nèi)脂肪含量的發(fā)育性變化研究[D]. 黃河.四川農(nóng)業(yè)大學(xué). 2007
[7]南陽牛幾個基因的多態(tài)性及其與生長發(fā)育性狀的相關(guān)性的研究[D]. 張爭鋒.西北農(nóng)林科技大學(xué). 2006
本文編號:3539773
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