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硬蜱科四種蜱核糖體全基因組分析

發(fā)布時間:2021-12-09 12:31
  蜱是一種吸血的外寄生蟲,常寄生于家畜和人的體表。作為媒介昆蟲,是僅次于蚊的第二大傳播媒介。它能攜帶病原體在宿主之間傳播,其中大多數(shù)是重要的人獸共患病原。蜱主要分為硬蜱科,軟蜱科和納蜱科,其中最常見且對人和家畜危害性最大的是硬蜱科。核糖體在細胞中廣泛存在,核酸拷貝數(shù)較高,核糖體是分子分類方法的主要標記基因。因此,本研究對在東北地區(qū)人畜危害嚴重的四種硬蜱即森林革蜱、日本血蜱、全溝硬蜱和長角血蜱的核糖體基因組序列進行擴增及分析,為四種硬蜱的分子分類研究提供可靠依據(jù)。首先在東北地區(qū)采集各種蜱,對每只蜱進行形態(tài)學和分子生學鑒定;然后隨機選擇采至黑龍江省的森林革蜱、日本血蜱和全溝硬蜱各5只,同時選擇吉林省和遼寧省的長角血蜱各5只,總計25只硬蜱進行核糖體序列的擴增;進一步對獲得的序列進行拼接組裝,并比較序列長度,組成及結(jié)構(gòu)特點;最后進行同源性和進化分析。結(jié)果表明,首次獲得了森林革蜱、日本血蜱、全溝硬蜱和長角血蜱四種25條硬蜱核糖體全基因組序列,長度為862911346 bp。不同種類蜱18S、28S和5.8S長度相近或相同,而ITS1和ITS2長度均能表現(xiàn)種屬的特異性;IGS...

【文章來源】: 黑龍江八一農(nóng)墾大學黑龍江省

【文章頁數(shù)】:83 頁

【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻綜述
    1.1 東北地區(qū)重要的硬蜱
        1.1.1 森林革蜱
        1.1.2 日本血蜱
        1.1.3 全溝硬蜱
        1.1.4 長角血蜱
    1.2 蜱核糖體全基因組研究進展
        1.2.1 蜱核糖體18S研究進展
        1.2.2 蜱核糖體ITS1 研究進展
        1.2.3 蜱核糖體5.8S研究進展
        1.2.4 蜱核糖體ITS2 研究進展
        1.2.5 蜱核糖體28S研究進展
        1.2.6 蜱核糖體IGS研究進展
    1.3 目的和意義
2 材料方法
    2.1 材料
        2.1.1 蜱蟲樣品
        2.1.2 引物設計
        2.1.3 主要試劑、儀器及應用軟件
    2.2 方法
        2.2.1 采集蜱的方法
        2.2.2 蜱的形態(tài)學鑒定
        2.2.3 總DNA的提取
        2.2.4 各蜱核糖體基因擴增
        2.2.5 序列分析
        2.2.6 同源性分析
        2.2.7 序列分析
3 結(jié)果
    3.1 蜱的形態(tài)學鑒定結(jié)果
    3.2 核糖體各部分PCR擴增結(jié)果
        3.2.1 18S PCR擴增結(jié)果
        3.2.2 ITS1 PCR擴增結(jié)果
        3.2.3 ITS2 PCR擴增結(jié)果
        3.2.4 28S-1 PCR擴增結(jié)果
        3.2.5 28S-2 PCR擴增結(jié)果
        3.2.6 28S-3 PCR擴增結(jié)果
        3.2.7 IGS PCR擴增結(jié)果
    3.3 四種蜱核糖體全基因組分析
        3.3.1 硬蜱科四種蜱核糖體長度分析
        3.3.2 硬蜱科四種蜱核糖體A+T含量分析
        3.3.3 硬蜱科四種蜱核糖體堿基突變和缺失
        3.3.4 硬蜱科四種蜱核糖體種內(nèi)差異分析
        3.3.5 硬蜱科四種蜱核糖體種間差異分析
        3.3.6 硬蜱科四種蜱核糖體IGS的側(cè)翼與重復序列分析
    3.4 同源性分析
        3.4.1 硬蜱科四種蜱核糖體18S同源性分析
        3.4.2 硬蜱科四種蜱核糖體ITS1 同源性分析
        3.4.3 硬蜱科四種蜱核糖體5.8S同源性分析
        3.4.4 硬蜱科四種蜱核糖體ITS2 同源性分析
        3.4.5 硬蜱科四種蜱核糖體28S同源性分析
        3.4.6 硬蜱科四種蜱核糖體IGS同源性分析
        3.4.7 硬蜱科四種蜱核糖體全基因組同源性分析
    3.5 進化分析
4 討論
    4.1 硬蜱科四種蜱的鑒定要點
    4.2 硬蜱科四種蜱核糖體全基因組的結(jié)構(gòu)特征
    4.3 同源性分析
    4.4 基于核糖體18S、ITS1、5.8S、ITS2、28S和 IGS的進化樹
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
個人簡歷


【參考文獻】:
期刊論文
[1]DNA條形碼技術(shù)在鑒定綏芬河口岸日本血蜱和嗜群血蜱中的應用 [J]. 王艷梅,程成,鞠文東,徐寧,耿聰,韓茜宇,劉巖,焦丹,黃洋.  口岸衛(wèi)生控制. 2019(03)
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[7]黑龍江中俄邊境口岸全溝硬蜱中分離到人巴貝西原蟲 [J]. 付維明,何浩,呼滿霞,崔永民,楊麗煒.  中國國境衛(wèi)生檢疫雜志. 2010(02)
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碩士論文
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[3]我國兩種新發(fā)立克次體經(jīng)媒介蜱垂直傳播規(guī)律的研究[D]. 袁婷婷.安徽醫(yī)科大學. 2019
[4]完達山林區(qū)蜱分布及攜帶病原情況調(diào)查[D]. 付雪.黑龍江八一農(nóng)墾大學. 2017
[5]吉林省和黑龍江省蜱種分布及3種重要蜱傳微生物分子流行病學調(diào)查[D]. 劉歡歡.吉林農(nóng)業(yè)大學. 2017
[6]長角血蜱的野外生態(tài)學研究[D]. 鄭洪遠.河北師范大學. 2009
[7]5.8S rDNA和ITS序列同源性分析在酸馬奶酵母菌分子生物學鑒定中的應用[D]. 茍榮.新疆農(nóng)業(yè)大學. 2008



本文編號:3530636

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