為掌握近年來山東地區(qū)豬瘟病毒（CSFV）的流行及其遺傳變異情況,本研究對(duì)2017年1月-2019年12月從山東省濟(jì)南市、泰安市、聊城市、青島市等10個(gè)地區(qū)采集的1 687份疑似豬瘟感染豬病料運(yùn)用反轉(zhuǎn)錄PCR方法進(jìn)行了病毒核酸檢測(cè),將CSFV檢測(cè)為陽性的樣品進(jìn)行E2基因和CSFV全基因擴(kuò)增和測(cè)序,利用生物信息學(xué)軟件DNAStar和Mega 7.0對(duì)CSFV的E2蛋白以及全基因序列進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析。另外,將這些地區(qū)采集的4 866份血清樣本進(jìn)行了抗體ELISA檢測(cè)。結(jié)果顯示,1 687份病料中病原檢測(cè)有188份陽性,總陽性率為11.1%,其中2017-2019年病原檢測(cè)陽性率分別為8.5%、13.1%、15.1%,抗原陽性率逐年上升且呈不穩(wěn)定性,提示規(guī)�；i場(chǎng)豬瘟兔化弱毒疫苗的免疫存在一定的風(fēng)險(xiǎn)和壓力;采集的4 866份血清樣本中4 146份呈現(xiàn)抗體陽性（85.2%）,統(tǒng)計(jì)得到2017-2019年抗體陽性率分別為84.3%、83.0%、92.3%,抗體陽性率呈現(xiàn)上升趨勢(shì),說明山東省規(guī)�；B(yǎng)殖場(chǎng)豬群豬瘟疫苗免疫保護(hù)的整體水平逐年提高;從陽性病料中擴(kuò)增獲得了5株CSFV全基因組序列和5株病毒E... 

【文章來源】：中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2020,47(06)北大核心

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【部分圖文】：

2017-2019年每季度抗體陽性率

通過反轉(zhuǎn)錄PCR分段擴(kuò)增,獲得1～11段基因片段大小依次為1 090、1 533、1 304、1 525、1 114、1 255、1 399、1 293、1 377、1 324、922 bp(圖4),與預(yù)期相符。將11個(gè)不同基因片段測(cè)序結(jié)果拼接,獲得5株分離株的全部序列,分別命名為SDQD-19、SDSH-19、SDLC-19、SDLL-19、SDNJ-19,并將5株分離毒株分別連接pMDTM18-T載體后隨機(jī)挑選2～3個(gè)陽性克隆進(jìn)行測(cè)序。2.4 CSFV 全基因組序列的同源性比對(duì)

對(duì)各分離毒株間及其與GenBank中登錄的28株CSFV參考毒株進(jìn)行同源性比對(duì)發(fā)現(xiàn),5株測(cè)序毒株之間的核苷酸同源性為98.8%～99.5%;5株分離毒株與參考毒株的同源性在83.0%～99.0%之間,其中與2.1d亞型的CSFV全基因組序列的同源性最高,在97.5%～99.0%之間(圖5)。2.5 CSFV E2蛋白氨基酸同源性比對(duì)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3523961