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基于轉(zhuǎn)錄組對(duì)Alternaria oxytropis中苦馬豆素合成相關(guān)基因的篩選與分析

發(fā)布時(shí)間:2021-11-25 12:30
  小花棘豆是世界草原危害較大的毒草之一,它可產(chǎn)生一種有毒的吲哚里西啶類次生代謝產(chǎn)物-苦馬豆素(swainsonine,SW)。SW能抑制動(dòng)物細(xì)胞α-甘露糖苷酶Ⅰ和高爾基體α-甘露糖苷酶Ⅱ的活性,使細(xì)胞空泡變性,失去正常功能,中毒嚴(yán)重者甚至?xí)劳觥T卺t(yī)學(xué)領(lǐng)域,SW一直被作為研究糖蛋白N-寡糖合成的工具藥,上世紀(jì)80年代時(shí)又發(fā)現(xiàn)其具有良好的免疫調(diào)節(jié)和抗腫瘤作用,成為關(guān)注熱點(diǎn)。課題組前期研究發(fā)現(xiàn)SW由小花棘豆內(nèi)生真菌Alternaria oxytropis合成,而酵母氨酸還原酶(酵母氨酸脫氫酶)在真菌SW合成中具有重要作用。利用同源重組技術(shù)敲除該內(nèi)生真菌的酵母氨酸還原酶基因(sac),獲得缺失突變株M1,發(fā)現(xiàn)其SW水平降低。鑒于Alternaria oxytropis內(nèi)生真菌SW合成途徑中很多細(xì)節(jié)未知,故本研究對(duì)該內(nèi)生真菌的野生株OW7.8和突變株M1進(jìn)行了高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-Seq),基于測(cè)序結(jié)果我們篩選了與SW生物合成相關(guān)的Unigene,對(duì)所選Unigene的表達(dá)模式進(jìn)行了qRT-PCR檢測(cè)分析,繼而從候選基因中選擇可能與SW合成的關(guān)鍵基因進(jìn)行克隆,為研究?jī)?nèi)生真菌中SW的合成途徑及... 

【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古師范大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】:82 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于轉(zhuǎn)錄組對(duì)Alternaria oxytropis中苦馬豆素合成相關(guān)基因的篩選與分析


瘋草內(nèi)生真菌苦馬豆素的部分合成代謝途徑推測(cè)[38]

基因簇,重疊群,鏈格孢,棘豆


圖 1-4 稻瘟病菌、棘豆鏈格孢的“SWN”基因簇的結(jié)構(gòu)和基因簇在支架(超級(jí)聚合體)或重疊群上的位置[54]Figure1-4 Structure of the "SWN" gene cluster and the location of the gene cluster on thescaffold (superpolymer) or contig indicated are in Magnaporthe and A. oxytropis[54]

苦馬豆素,生物合成途徑,轉(zhuǎn)錄組,測(cè)序


圖 1-5 稻瘟病菌中苦馬豆素生物合成途徑推測(cè)[54]Figure1-5 Speculated swainsonine metabolic pathway in Magnaporthe[54]3 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的研究進(jìn)展

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]真菌中苦馬豆素生物合成途徑的研究進(jìn)展[J]. 李欣,盧萍.  生命的化學(xué). 2018(06)
[2]不同添加物對(duì)小花棘豆內(nèi)生真菌酵母氨酸還原酶基因缺失突變株M1合成苦馬豆素的影響[J]. 薩如拉,席領(lǐng)軍,盧萍,高峰,杜玲.  生命科學(xué)研究. 2018(04)
[3]α-甘露糖苷酶的研究進(jìn)展[J]. 王鐸,張美萍,王義.  生命科學(xué). 2018(06)
[4]光照和培養(yǎng)基對(duì)內(nèi)生真菌棘豆鏈格孢Alternaria oxytropis苦馬豆素含量的影響[J]. 李欣,盧萍,呂桂芬,袁博.  菌物學(xué)報(bào). 2018(05)
[5]小花棘豆Embellisia內(nèi)生真菌原生質(zhì)體的制備與再生研究[J]. 呼吉雅,盧萍,牛艷芳.  生物技術(shù)通報(bào). 2015(05)
[6]不同因素對(duì)瘋草內(nèi)生真菌合成苦馬豆素的影響[J]. 張蕾蕾,余永濤,何生虎,趙清梅,葛松.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(01)
[7]豆科植物瘋草中內(nèi)生真菌及其作用[J]. 崔振,李彥忠.  草業(yè)科學(xué). 2014(09)
[8]中國(guó)西部天然草地瘋草生態(tài)及動(dòng)物瘋草中毒研究與防控現(xiàn)狀[J]. 周啟武,趙寶玉,路浩,王姍姍,張樑,溫偉利,楊曉雯.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(06)
[9]小花棘豆(Oxytropis glabra)內(nèi)生真菌固體培養(yǎng)條件優(yōu)化研究[J]. 何珊,盧萍,包睿媛.  內(nèi)蒙古師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)漢文版). 2012(01)
[10]瘋草研究進(jìn)展[J]. 余永濤,王建華.  農(nóng)業(yè)科學(xué)研究. 2011(02)

博士論文
[1]瘋草內(nèi)生真菌合成苦馬豆素的研究[D]. 楊國(guó)棟.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012

碩士論文
[1]小花棘豆Alternaria oxytropis內(nèi)生真菌苦馬豆素合成代謝中酵母氨酸還原酶基因的影響[D]. 薩如拉.內(nèi)蒙古師范大學(xué) 2018
[2]瘋草棘豆蠕孢菌哌可酸氧化酶基因突變菌株的構(gòu)建[D]. 任禎慧.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[3]酵母氨酸還原酶基因?qū)π』箖?nèi)生真菌苦馬豆素合成代謝的影響[D]. 席領(lǐng)軍.內(nèi)蒙古師范大學(xué) 2017
[4]瘋草棘豆蠕孢菌吡咯啉5-羧化-還原酶基因敲除菌株的構(gòu)建[D]. 權(quán)海云.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[5]基于RNA-Seq技術(shù)的Undifilum oxytropis中苦馬豆素含量相關(guān)基因的分析[D]. 張峰華.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[6]小花棘豆Embellisia內(nèi)生真菌酵母氨酸還原酶基因?qū)囫R豆素合成影響的研究[D]. 哈布拉.內(nèi)蒙古師范大學(xué) 2016
[7]小花棘豆Embellisia內(nèi)生真菌酵母氨酸還原酶基因缺失突變株的構(gòu)建及篩選鑒定[D]. 呼吉雅.內(nèi)蒙古師范大學(xué) 2015
[8]小花棘豆Embellisia內(nèi)生真菌酵母氨酸還原酶基因的克隆及其缺失載體的構(gòu)建[D]. 王思遠(yuǎn).內(nèi)蒙古師范大學(xué) 2014



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