豬睪丸組織的miRNA表達譜分析
發(fā)布時間:2021-11-19 18:59
MicroRNAs (miRNAs)是一類長約22 nt、單鏈、高度保守、內(nèi)源性、非編碼的小RNA分子,在真核生物中廣泛存在,主要通過與靶基因mRNA3’非編碼區(qū)互補結(jié)合來抑制表達或使其降解,進而在轉(zhuǎn)錄后調(diào)控基因的表達。研究表明,有大量的miRNA偏向于在睪丸和生殖細胞中表達,并且在性成熟前與性成熟睪丸中的表達模式也不同,這也暗示了miRNA在睪丸和生殖細胞中的重要作用。同時,豬也是一種重要的農(nóng)業(yè)經(jīng)濟動物和醫(yī)學(xué)研究模型,并且高通量測序技術(shù)可以準(zhǔn)確、快速、批量地檢測樣本的miRNA,所以,選擇用高通量測序的技術(shù)分析豬睪丸組織性成熟前后的miRNA表達譜并比較分析,以探究miRNA在睪丸發(fā)育和生精調(diào)控中的重要作用,揭示miRNA在哺乳動物生精過程中的調(diào)控機制和促進不育的治療。于是,本實驗利用高通量測序的技術(shù),分別構(gòu)建了性成熟前和性成熟兩個不同時期的豬睪丸組織的miRNAs表達譜,分析不同時期miRNA表達譜的特點并進行比較,主要研究結(jié)果如下:1.用高通量測序的方法,本實驗成功構(gòu)建了豬性成熟前(20天)和性成熟(210天)睪丸組織的miRNA表達譜,共獲得了超過20M的高質(zhì)量的序列(read...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
符號說明
1 文獻綜述
1.1 miRNA研究進展
1.1.1 miRNA的發(fā)現(xiàn)
1.1.2 miRNA的生物合成
1.1.3 miRNA作用機制
1.1.4 miRNA研究方法
1.2 哺乳動物生殖發(fā)生與miRNA研究現(xiàn)狀
1.2.1 哺乳動物的精子發(fā)生過程
1.2.2 miRNA與精子發(fā)生
1.2.3 睪丸組織中miRNA的表達
1.3 實時熒光定量PCR(RT-PCR)
1.3.1 實時熒光定量PCR的技術(shù)原理
1.3.2 熒光定量PCR的定量方法
1.3.3 miRNA熒光定量PCR
1.4 本實驗研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 試驗時間與地點
2.3 主要儀器
2.4 主要試劑
2.5 RNA的制備
2.5.1 RNA提取主要步驟
2.5.2 RNA質(zhì)量檢測
2.6. 小RNA建庫測序
2.7 測序數(shù)據(jù)的處理
2.7.1 測序數(shù)據(jù)過濾與定位比對
2.7.2 測序數(shù)據(jù)的分類
2.8 差異分析
2.9 Q-PCR驗證
2.9.1 cDNA的制備
2.9.2 Real-time PCR
2.10 靶基因的預(yù)測和功能分析
2.11 數(shù)據(jù)庫及分析軟件
3 結(jié)果與分析
3.1 RNA質(zhì)檢結(jié)果
3.2 高通量數(shù)據(jù)結(jié)果
3.3 豬睪丸組織的miRNA轉(zhuǎn)錄組的鑒別和特征
3.4 豬睪丸組織中高表達的miRNAs
3.5 豬睪丸組織中差異表達的miRNA
3.6 靶基因預(yù)測和功能分析
3.7 miRNA的染色體分布
4 討論
4.1 高通量的高檢測率
4.2 高表達的miRNAs具有顯著調(diào)控作用
4.3 差異表達的miRNA參與調(diào)控生精過程
4.4 miRNA的X染色體趨向性表達
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
附錄
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]IL-6調(diào)節(jié)miR-21在激素抵抗性前列腺癌中的機制研究[J]. 李金貴,馬利,熊兵紅,程勇,張才全. 西部醫(yī)學(xué). 2013(10)
[2]利用種子序列檢測山羊皮膚中microRNA靶基因分子方法的建立[J]. 付紹印,趙德超,趙宏麗,李金泉,張文廣. 遺傳. 2012(07)
[3]ERK MAPK是annexin 5調(diào)節(jié)大鼠睪丸間質(zhì)細胞分泌睪酮的重要途徑[J]. 張穩(wěn),陶曉倩,林釵英,柳海燕,時姍姍,戈一峰. 臨床檢驗雜志. 2010(06)
[4]促性腺激素釋放激素激動劑通過ERK MAPK途徑調(diào)控大鼠睪丸間質(zhì)細胞3β-HSD mRNA表達[J]. 柳海燕,時姍姍,陶曉倩,盧坤剛,韓雪峰,張艷梅,崔英霞,李曉軍,姚兵. 醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報. 2009(08)
[5]microRNA表達檢測技術(shù)進展[J]. 張宇,張勇,楊長成,王振寧. 新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2008(06)
本文編號:3505662
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
符號說明
1 文獻綜述
1.1 miRNA研究進展
1.1.1 miRNA的發(fā)現(xiàn)
1.1.2 miRNA的生物合成
1.1.3 miRNA作用機制
1.1.4 miRNA研究方法
1.2 哺乳動物生殖發(fā)生與miRNA研究現(xiàn)狀
1.2.1 哺乳動物的精子發(fā)生過程
1.2.2 miRNA與精子發(fā)生
1.2.3 睪丸組織中miRNA的表達
1.3 實時熒光定量PCR(RT-PCR)
1.3.1 實時熒光定量PCR的技術(shù)原理
1.3.2 熒光定量PCR的定量方法
1.3.3 miRNA熒光定量PCR
1.4 本實驗研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 試驗時間與地點
2.3 主要儀器
2.4 主要試劑
2.5 RNA的制備
2.5.1 RNA提取主要步驟
2.5.2 RNA質(zhì)量檢測
2.6. 小RNA建庫測序
2.7 測序數(shù)據(jù)的處理
2.7.1 測序數(shù)據(jù)過濾與定位比對
2.7.2 測序數(shù)據(jù)的分類
2.8 差異分析
2.9 Q-PCR驗證
2.9.1 cDNA的制備
2.9.2 Real-time PCR
2.10 靶基因的預(yù)測和功能分析
2.11 數(shù)據(jù)庫及分析軟件
3 結(jié)果與分析
3.1 RNA質(zhì)檢結(jié)果
3.2 高通量數(shù)據(jù)結(jié)果
3.3 豬睪丸組織的miRNA轉(zhuǎn)錄組的鑒別和特征
3.4 豬睪丸組織中高表達的miRNAs
3.5 豬睪丸組織中差異表達的miRNA
3.6 靶基因預(yù)測和功能分析
3.7 miRNA的染色體分布
4 討論
4.1 高通量的高檢測率
4.2 高表達的miRNAs具有顯著調(diào)控作用
4.3 差異表達的miRNA參與調(diào)控生精過程
4.4 miRNA的X染色體趨向性表達
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
附錄
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]IL-6調(diào)節(jié)miR-21在激素抵抗性前列腺癌中的機制研究[J]. 李金貴,馬利,熊兵紅,程勇,張才全. 西部醫(yī)學(xué). 2013(10)
[2]利用種子序列檢測山羊皮膚中microRNA靶基因分子方法的建立[J]. 付紹印,趙德超,趙宏麗,李金泉,張文廣. 遺傳. 2012(07)
[3]ERK MAPK是annexin 5調(diào)節(jié)大鼠睪丸間質(zhì)細胞分泌睪酮的重要途徑[J]. 張穩(wěn),陶曉倩,林釵英,柳海燕,時姍姍,戈一峰. 臨床檢驗雜志. 2010(06)
[4]促性腺激素釋放激素激動劑通過ERK MAPK途徑調(diào)控大鼠睪丸間質(zhì)細胞3β-HSD mRNA表達[J]. 柳海燕,時姍姍,陶曉倩,盧坤剛,韓雪峰,張艷梅,崔英霞,李曉軍,姚兵. 醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報. 2009(08)
[5]microRNA表達檢測技術(shù)進展[J]. 張宇,張勇,楊長成,王振寧. 新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2008(06)
本文編號:3505662
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