circSNX29通過(guò)Wnt5a/Ca 2+ 信號(hào)通路調(diào)控牛肌細(xì)胞增殖、分化的機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-18 18:12
肌生成是一個(gè)復(fù)雜而精確的過(guò)程,并受到一些非編碼RNA和信號(hào)通路的高度調(diào)控。環(huán)狀RNAs(circRNAs)是一類新型內(nèi)源性非編碼RNA,在絕大多數(shù)真核生物轉(zhuǎn)錄后水平發(fā)揮調(diào)節(jié)功能。雖然在多個(gè)物種和組織中已鑒定出一些cirRNAs,但其調(diào)控的分子機(jī)制仍不太明確。在本研究中,利用牛骨骼肌circRNAs測(cè)序數(shù)據(jù),篩選并鑒定了一個(gè)來(lái)自宿主SNX29基因的候選circRNA,并將其命名為circSNX29,并進(jìn)一步探究其在肌肉發(fā)育過(guò)程中的調(diào)控作用。超表達(dá)circSNX29促進(jìn)成肌細(xì)胞分化,抑制細(xì)胞增殖,而干擾circSNX29抑制其分化,促進(jìn)增殖。隨后,利用RNAhybrid進(jìn)行生物信息學(xué)預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),circSNX29可能吸附到miR-744,具有9個(gè)潛在的結(jié)合位點(diǎn)。利用雙熒光素酶報(bào)告分析實(shí)驗(yàn),結(jié)果顯示,circSNX29能夠直接與miR-744競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合,并有效地扭轉(zhuǎn)miR-744對(duì)Wnt5a和CaMKIIδ的抑制作用。重要的是,通過(guò)KEGG通路富集分析、Western blotting、鈣離子熒光探針和CamKII活性檢測(cè)等實(shí)驗(yàn),結(jié)果發(fā)現(xiàn),超表達(dá)Wnt5a和circSNX29通過(guò)增加CamKI...
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
前言
文獻(xiàn)綜述
第一章 非編碼RNA在骨骼肌中的研究進(jìn)展
1.1 骨骼肌的功能與肌生成
1.2 miRNAs研究進(jìn)展
1.2.1 miRNAs產(chǎn)生的概述
1.2.2 miRNAs的作用機(jī)制
1.2.3 肌生成相關(guān)miRNAs
1.3 肌生成相關(guān)信號(hào)通路
1.4 circRNAs研究進(jìn)展
1.4.1 circRNAs的發(fā)現(xiàn)
1.4.2 circRNAs的產(chǎn)生及分類
1.4.3 circRNAs的分子功能
試驗(yàn)研究
第二章 牛肌生成相關(guān)miR-744 通過(guò)靶向抑制Wnt5a調(diào)控肌細(xì)胞增殖和分化
2.1 材料與方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料準(zhǔn)備
2.1.2 牛肌原代細(xì)胞分離培養(yǎng)及凍存
2.1.3 載體構(gòu)建
2.1.4 雙熒光素酶報(bào)告分析
2.1.5 增殖試驗(yàn)
2.1.6 免疫熒光試驗(yàn)
2.1.7 總RNA提取及RT-qPCR
2.1.8 總蛋白提取和Western blotting試驗(yàn)
2.1.9 數(shù)據(jù)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 秦川牛骨骼肌中miR-744 的鑒定
2.2.2 超表達(dá)miR-744 促進(jìn)成肌細(xì)胞增殖
2.2.3 超表達(dá)miR-744 抑制成肌細(xì)胞分化
2.2.4 miR-744 直接靶向Wnt5a基因
2.2.5 超表達(dá)Wnt5a抑制細(xì)胞分化,并促進(jìn)細(xì)胞增殖
2.3 討論
2.4 小結(jié)
第三章 circ SNX29 調(diào)控成肌細(xì)胞增殖與分化的機(jī)制研究
3.1 材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料準(zhǔn)備
3.1.2 牛肌原代細(xì)胞分離及培養(yǎng)
3.1.3 核質(zhì)分離試驗(yàn)
3.1.4 總RNA提取及RT-qPCR
3.1.5 載體構(gòu)建
3.1.6 增殖及周期測(cè)定試驗(yàn)
3.1.7 免疫熒光試驗(yàn)
3.1.8 miR-744 Sensor試驗(yàn)及熒光素酶報(bào)告分析
3.1.9 總蛋白提取和Western blotting試驗(yàn)
3.1.10 數(shù)據(jù)分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 秦川牛骨骼肌中circSNX29 的鑒定
3.2.2 circSNX29 主要表達(dá)于細(xì)胞質(zhì)
3.2.3 circSNX29 競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-744 調(diào)控Wnt5a的表達(dá)
3.2.4 circSNX29 通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合mi R-744 促進(jìn)肌細(xì)胞分化
3.2.5 circSNX29 通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合mi R-744 抑制肌細(xì)胞增殖
3.3 討論
3.4 小結(jié)
第四章 circ SNX29 通過(guò)吸附miR-744 激活Wnt5a/Ca~(2+)信號(hào)通路調(diào)控成肌細(xì)胞增殖及分化
4.1 材料與方法
4.1.1 牛肌原代細(xì)胞分離及培養(yǎng)
4.1.2 試驗(yàn)儀器與試劑
4.1.3 總RNA提取及RT-qPCR
4.1.4 細(xì)胞內(nèi)Ca~(2+)濃度測(cè)定
4.1.5 CamKII激酶活性檢測(cè)
4.1.6 總蛋白提取及Western blotting試驗(yàn)
4.1.7 KEGG富集分析
4.1.8 數(shù)據(jù)分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 利用KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)和Omicsbean篩選Wnt5a/Ca~(2+)信號(hào)通路
4.2.2 超表達(dá)circSNX29和Wnt5a通過(guò)激活Wnt5a/Ca~(2+)信號(hào)通路調(diào)控成肌細(xì)胞增殖分化
4.3 討論
4.4 小結(jié)
結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)
結(jié)論
創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]27nt-miRNA對(duì)間充質(zhì)干細(xì)胞向血管平滑肌細(xì)胞分化的影響[J]. 沈鳳,楊鵬,陶曉靜,顏淵鴛,李丹,歐和生. 生物工程學(xué)報(bào). 2019(02)
[2]中國(guó)黃牛選育改良及肉牛種業(yè)發(fā)展建議[J]. 昝林森,梅楚剛,王洪程. 中國(guó)牛業(yè)科學(xué). 2016(06)
[3]秦川牛種質(zhì)資源保護(hù)利用、存在問(wèn)題及對(duì)策建議[J]. 昝林森,王洪程,梅楚剛,王應(yīng)海. 中國(guó)牛業(yè)科學(xué). 2014(06)
[4]從中國(guó)黃牛的歷史談現(xiàn)代黃牛的選育[J]. 王雅春,陳幼春,張沅. 中國(guó)牛業(yè)科學(xué). 2012(03)
本文編號(hào):3503368
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
前言
文獻(xiàn)綜述
第一章 非編碼RNA在骨骼肌中的研究進(jìn)展
1.1 骨骼肌的功能與肌生成
1.2 miRNAs研究進(jìn)展
1.2.1 miRNAs產(chǎn)生的概述
1.2.2 miRNAs的作用機(jī)制
1.2.3 肌生成相關(guān)miRNAs
1.3 肌生成相關(guān)信號(hào)通路
1.4 circRNAs研究進(jìn)展
1.4.1 circRNAs的發(fā)現(xiàn)
1.4.2 circRNAs的產(chǎn)生及分類
1.4.3 circRNAs的分子功能
試驗(yàn)研究
第二章 牛肌生成相關(guān)miR-744 通過(guò)靶向抑制Wnt5a調(diào)控肌細(xì)胞增殖和分化
2.1 材料與方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料準(zhǔn)備
2.1.2 牛肌原代細(xì)胞分離培養(yǎng)及凍存
2.1.3 載體構(gòu)建
2.1.4 雙熒光素酶報(bào)告分析
2.1.5 增殖試驗(yàn)
2.1.6 免疫熒光試驗(yàn)
2.1.7 總RNA提取及RT-qPCR
2.1.8 總蛋白提取和Western blotting試驗(yàn)
2.1.9 數(shù)據(jù)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 秦川牛骨骼肌中miR-744 的鑒定
2.2.2 超表達(dá)miR-744 促進(jìn)成肌細(xì)胞增殖
2.2.3 超表達(dá)miR-744 抑制成肌細(xì)胞分化
2.2.4 miR-744 直接靶向Wnt5a基因
2.2.5 超表達(dá)Wnt5a抑制細(xì)胞分化,并促進(jìn)細(xì)胞增殖
2.3 討論
2.4 小結(jié)
第三章 circ SNX29 調(diào)控成肌細(xì)胞增殖與分化的機(jī)制研究
3.1 材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料準(zhǔn)備
3.1.2 牛肌原代細(xì)胞分離及培養(yǎng)
3.1.3 核質(zhì)分離試驗(yàn)
3.1.4 總RNA提取及RT-qPCR
3.1.5 載體構(gòu)建
3.1.6 增殖及周期測(cè)定試驗(yàn)
3.1.7 免疫熒光試驗(yàn)
3.1.8 miR-744 Sensor試驗(yàn)及熒光素酶報(bào)告分析
3.1.9 總蛋白提取和Western blotting試驗(yàn)
3.1.10 數(shù)據(jù)分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 秦川牛骨骼肌中circSNX29 的鑒定
3.2.2 circSNX29 主要表達(dá)于細(xì)胞質(zhì)
3.2.3 circSNX29 競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-744 調(diào)控Wnt5a的表達(dá)
3.2.4 circSNX29 通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合mi R-744 促進(jìn)肌細(xì)胞分化
3.2.5 circSNX29 通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合mi R-744 抑制肌細(xì)胞增殖
3.3 討論
3.4 小結(jié)
第四章 circ SNX29 通過(guò)吸附miR-744 激活Wnt5a/Ca~(2+)信號(hào)通路調(diào)控成肌細(xì)胞增殖及分化
4.1 材料與方法
4.1.1 牛肌原代細(xì)胞分離及培養(yǎng)
4.1.2 試驗(yàn)儀器與試劑
4.1.3 總RNA提取及RT-qPCR
4.1.4 細(xì)胞內(nèi)Ca~(2+)濃度測(cè)定
4.1.5 CamKII激酶活性檢測(cè)
4.1.6 總蛋白提取及Western blotting試驗(yàn)
4.1.7 KEGG富集分析
4.1.8 數(shù)據(jù)分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 利用KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)和Omicsbean篩選Wnt5a/Ca~(2+)信號(hào)通路
4.2.2 超表達(dá)circSNX29和Wnt5a通過(guò)激活Wnt5a/Ca~(2+)信號(hào)通路調(diào)控成肌細(xì)胞增殖分化
4.3 討論
4.4 小結(jié)
結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)
結(jié)論
創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]27nt-miRNA對(duì)間充質(zhì)干細(xì)胞向血管平滑肌細(xì)胞分化的影響[J]. 沈鳳,楊鵬,陶曉靜,顏淵鴛,李丹,歐和生. 生物工程學(xué)報(bào). 2019(02)
[2]中國(guó)黃牛選育改良及肉牛種業(yè)發(fā)展建議[J]. 昝林森,梅楚剛,王洪程. 中國(guó)牛業(yè)科學(xué). 2016(06)
[3]秦川牛種質(zhì)資源保護(hù)利用、存在問(wèn)題及對(duì)策建議[J]. 昝林森,王洪程,梅楚剛,王應(yīng)海. 中國(guó)牛業(yè)科學(xué). 2014(06)
[4]從中國(guó)黃牛的歷史談現(xiàn)代黃牛的選育[J]. 王雅春,陳幼春,張沅. 中國(guó)牛業(yè)科學(xué). 2012(03)
本文編號(hào):3503368
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