鵝腸道菌群的宏基因組學(xué)分析及其與肥肝形成關(guān)系的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-17 05:01
腸道菌群通過(guò)參與營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的降解、產(chǎn)生各種代謝物、改變腸道的屏障作用等影響肝臟的代謝與機(jī)能,在動(dòng)物脂肪肝的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中扮演著重要角色。人類與許多動(dòng)物的肝臟在發(fā)生嚴(yán)重脂肪變性時(shí)往往會(huì)出現(xiàn)不可逆的炎癥和纖維化,嚴(yán)重影響人體健康及動(dòng)物生產(chǎn)。相反,鵝肝臟盡管在重量上增加8倍以上,形成嚴(yán)重的脂肪肝,但不會(huì)出現(xiàn)明顯的病理癥狀,因此其可能具有獨(dú)特的形成機(jī)制。課題組前期研究發(fā)現(xiàn),相對(duì)于正常飼喂組,朗德鵝填飼組的腸道菌群發(fā)生了顯著的結(jié)構(gòu)變化,然而,它們影響鵝肥肝形成的機(jī)理尚不清楚。本研究選擇70日齡體重相近的健康朗德鵝公鵝80只,隨機(jī)分為對(duì)照組(48只)和填飼組(32只)。對(duì)照組正常飼養(yǎng),填飼組填飼高能玉米,并于70、82和94日齡時(shí),分別從對(duì)照組和填飼組中選取16只鵝進(jìn)行屠宰采樣,取腸道(空腸、回腸、盲腸)內(nèi)容物。利用16S rDNA測(cè)序技術(shù)研究填飼對(duì)朗德鵝腸道微生物菌群整體結(jié)構(gòu)的影響。根據(jù)16S rDNA測(cè)序結(jié)果選取樣品進(jìn)行宏基因組學(xué)測(cè)定,分析填飼對(duì)不同腸道段的微生物菌群結(jié)構(gòu)和功能的影響。最后選取70日齡體重相近的60只朗德鵝公鵝,隨機(jī)分為對(duì)照組、對(duì)照加乳酸菌組、填飼組、填飼加乳酸菌組,每組15只。...
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:88 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1填飼不同階段朗德鵝表型數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)圖??Figure?2-1?Phenotypic?data?of?Landes?goose?in?different?overfeeding?stages??
2.3.3朗德鵝腸道微生物群落多樣性分析??通過(guò)物種累積箱形圖可以對(duì)樣本中物種豐度進(jìn)行預(yù)測(cè),并判斷試驗(yàn)樣本是否充分。物??種累積箱形圖是描述隨著樣本量的增加物種多樣性增加的分析,結(jié)果見(jiàn)圖2-3。從圖中可??以看出,箱型圖的位置在樣本量低于50時(shí)表現(xiàn)出急劇上升的趨勢(shì),隨著樣本量的增多,??箱形圖位置趨于平緩,表示試驗(yàn)所檢測(cè)到物種并不會(huì)隨樣本量的增加而顯著增多,本試驗(yàn)??所用樣本數(shù)為240個(gè),說(shuō)明本試驗(yàn)抽樣充分,數(shù)據(jù)有效性較高。??§?-??f??“爹??〇?-??iuMMraiinnMinnnnninnOTMnnnininiMniTnnimMTinnininMnMifnnnMMnMronninTninnnininnnMMMnnmnMinMiii??1?12?25?38?51?64?77?90?1?05?121?137?153?1?69?185?201?217?233??Number?of?samples??圖2_3物種累積箱形圖??Figure?2-3?species?accumulation?boxplot??注:橫坐標(biāo)為樣本量;縱坐標(biāo)為抽樣后OTU數(shù)目。??Note:?The?abscissa?is?the?sample?size;?the?ordinate?is?the?number?of?OTUs?after?sampling.??通過(guò)稀釋曲線和等級(jí)聚類曲線來(lái)分析試驗(yàn)各組樣本的微生物群落多樣性。稀釋曲線是??從樣品中隨機(jī)抽取一定測(cè)序量的數(shù)據(jù),統(tǒng)計(jì)它們所代表物種數(shù)目(即OTUs數(shù)目),以抽??取的測(cè)序數(shù)據(jù)量與對(duì)應(yīng)的物種數(shù)來(lái)構(gòu)建曲線。稀釋曲線可直接反映測(cè)序數(shù)據(jù)量的合理性,??并間接反映樣品中物種的豐富程度
斐Φ讕?旱暮昊?蜃檠Х治黽捌溆敕矢渦緯曬叵檔難芯??25??的數(shù)據(jù)量只會(huì)產(chǎn)生少量新的物種(OTUs)。結(jié)果見(jiàn)圖2-4。從圖中可以看出,絕大多數(shù)樣??本在序列數(shù)超過(guò)30000時(shí)曲線都趨于平緩
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腸-肝軸功能紊亂在非酒精性脂肪肝病發(fā)病機(jī)制中的作用及相關(guān)治療策略[J]. 夏凡,周本杰. 世界華人消化雜志. 2018(24)
[2]肥胖及非酒精性脂肪肝疾病與腸道菌群相關(guān)性的研究進(jìn)展[J]. 程偉偉,李博星,陸靜,黎爾納,張政,蔣愛(ài)民,袁靜. 食品科技. 2018(02)
[3]腸道微生物對(duì)仔豬免疫能力的影響[J]. 張學(xué)武. 中國(guó)動(dòng)物保健. 2017(11)
[4]肝硬化及肝細(xì)胞癌患者腸道微生態(tài)組成和結(jié)構(gòu)的初步分析[J]. 周冷瀟,韓濤,劉保文,高英堂,韓海燕. 臨床肝膽病雜志. 2017(09)
[5]家禽腸道微生物穩(wěn)定性影響因素及其生理功能研究進(jìn)展[J]. 王姝妹,盧立志. 中國(guó)家禽. 2017(15)
[6]瑞士乳桿菌調(diào)控小鼠腸道菌群變化規(guī)律的研究[J]. 臧凱麗,賈彥,崔文靜,馬新穎,王泳,趙林森,趙培,葉雷,閻亞麗,陳慶森. 食品科學(xué). 2018(01)
[7]短鏈脂肪酸在疾病治療中的研究進(jìn)展[J]. 王璐璇,劉玥宏,朱繼開(kāi),鐘煜,李利生,徐敬東. 世界華人消化雜志. 2017(13)
[8]雙歧桿菌四聯(lián)活菌治療非酒精性脂肪肝的療效觀察[J]. 張彩峰. 中西醫(yī)結(jié)合心血管病電子雜志. 2017(13)
[9]大鼠腸道自發(fā)熒光微生物的分布[J]. 田樹(shù)紅,王日超,肖敏,符健. 中國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào). 2017(01)
[10]鵝肥肝形成中腸道生理指標(biāo)、菌群及代謝物的變化[J]. 劉龍,龔晗,楊彪,夏麗麗,耿拓宇,龔道清. 揚(yáng)州大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2016(04)
博士論文
[1]Behcet病患者腸道微生物宏基因組學(xué)的研究[D]. 張旎.重慶醫(yī)科大學(xué) 2018
[2]鵝肥肝形成過(guò)程中差異表達(dá)miRNA篩選及miRNA-33的表達(dá)調(diào)控研究[D]. 鄭云.揚(yáng)州大學(xué) 2017
[3]兩核苷酸實(shí)時(shí)合成測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用研究[D]. 浦丹.東南大學(xué) 2015
[4]青藏高原傳統(tǒng)發(fā)酵牦牛奶中乳酸菌多樣性及其益生功能研究[D]. 丁武蓉.蘭州大學(xué) 2014
[5]應(yīng)用焦磷酸測(cè)序技術(shù)對(duì)不同人群腸道微生物群落結(jié)構(gòu)的研究[D]. 郭壯.江南大學(xué) 2013
[6]高通量基因組數(shù)據(jù)的處理、分析與建模[D]. 王叢茂.上海交通大學(xué) 2012
[7]四倍體鯽鯉BAC文庫(kù)構(gòu)建及其演化分析[D]. 陳禹保.湖南師范大學(xué) 2011
碩士論文
[1]奶牛腸道微生物群落結(jié)構(gòu)與多樣性研究[D]. 高鳳.河北工程大學(xué) 2017
[2]脂聯(lián)素受體對(duì)鵝肥肝的保護(hù)作用及其表達(dá)調(diào)控研究[D]. 楊彪.揚(yáng)州大學(xué) 2016
本文編號(hào):3500250
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:88 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1填飼不同階段朗德鵝表型數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)圖??Figure?2-1?Phenotypic?data?of?Landes?goose?in?different?overfeeding?stages??
2.3.3朗德鵝腸道微生物群落多樣性分析??通過(guò)物種累積箱形圖可以對(duì)樣本中物種豐度進(jìn)行預(yù)測(cè),并判斷試驗(yàn)樣本是否充分。物??種累積箱形圖是描述隨著樣本量的增加物種多樣性增加的分析,結(jié)果見(jiàn)圖2-3。從圖中可??以看出,箱型圖的位置在樣本量低于50時(shí)表現(xiàn)出急劇上升的趨勢(shì),隨著樣本量的增多,??箱形圖位置趨于平緩,表示試驗(yàn)所檢測(cè)到物種并不會(huì)隨樣本量的增加而顯著增多,本試驗(yàn)??所用樣本數(shù)為240個(gè),說(shuō)明本試驗(yàn)抽樣充分,數(shù)據(jù)有效性較高。??§?-??f??“爹??〇?-??iuMMraiinnMinnnnninnOTMnnnininiMniTnnimMTinnininMnMifnnnMMnMronninTninnnininnnMMMnnmnMinMiii??1?12?25?38?51?64?77?90?1?05?121?137?153?1?69?185?201?217?233??Number?of?samples??圖2_3物種累積箱形圖??Figure?2-3?species?accumulation?boxplot??注:橫坐標(biāo)為樣本量;縱坐標(biāo)為抽樣后OTU數(shù)目。??Note:?The?abscissa?is?the?sample?size;?the?ordinate?is?the?number?of?OTUs?after?sampling.??通過(guò)稀釋曲線和等級(jí)聚類曲線來(lái)分析試驗(yàn)各組樣本的微生物群落多樣性。稀釋曲線是??從樣品中隨機(jī)抽取一定測(cè)序量的數(shù)據(jù),統(tǒng)計(jì)它們所代表物種數(shù)目(即OTUs數(shù)目),以抽??取的測(cè)序數(shù)據(jù)量與對(duì)應(yīng)的物種數(shù)來(lái)構(gòu)建曲線。稀釋曲線可直接反映測(cè)序數(shù)據(jù)量的合理性,??并間接反映樣品中物種的豐富程度
斐Φ讕?旱暮昊?蜃檠Х治黽捌溆敕矢渦緯曬叵檔難芯??25??的數(shù)據(jù)量只會(huì)產(chǎn)生少量新的物種(OTUs)。結(jié)果見(jiàn)圖2-4。從圖中可以看出,絕大多數(shù)樣??本在序列數(shù)超過(guò)30000時(shí)曲線都趨于平緩
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腸-肝軸功能紊亂在非酒精性脂肪肝病發(fā)病機(jī)制中的作用及相關(guān)治療策略[J]. 夏凡,周本杰. 世界華人消化雜志. 2018(24)
[2]肥胖及非酒精性脂肪肝疾病與腸道菌群相關(guān)性的研究進(jìn)展[J]. 程偉偉,李博星,陸靜,黎爾納,張政,蔣愛(ài)民,袁靜. 食品科技. 2018(02)
[3]腸道微生物對(duì)仔豬免疫能力的影響[J]. 張學(xué)武. 中國(guó)動(dòng)物保健. 2017(11)
[4]肝硬化及肝細(xì)胞癌患者腸道微生態(tài)組成和結(jié)構(gòu)的初步分析[J]. 周冷瀟,韓濤,劉保文,高英堂,韓海燕. 臨床肝膽病雜志. 2017(09)
[5]家禽腸道微生物穩(wěn)定性影響因素及其生理功能研究進(jìn)展[J]. 王姝妹,盧立志. 中國(guó)家禽. 2017(15)
[6]瑞士乳桿菌調(diào)控小鼠腸道菌群變化規(guī)律的研究[J]. 臧凱麗,賈彥,崔文靜,馬新穎,王泳,趙林森,趙培,葉雷,閻亞麗,陳慶森. 食品科學(xué). 2018(01)
[7]短鏈脂肪酸在疾病治療中的研究進(jìn)展[J]. 王璐璇,劉玥宏,朱繼開(kāi),鐘煜,李利生,徐敬東. 世界華人消化雜志. 2017(13)
[8]雙歧桿菌四聯(lián)活菌治療非酒精性脂肪肝的療效觀察[J]. 張彩峰. 中西醫(yī)結(jié)合心血管病電子雜志. 2017(13)
[9]大鼠腸道自發(fā)熒光微生物的分布[J]. 田樹(shù)紅,王日超,肖敏,符健. 中國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào). 2017(01)
[10]鵝肥肝形成中腸道生理指標(biāo)、菌群及代謝物的變化[J]. 劉龍,龔晗,楊彪,夏麗麗,耿拓宇,龔道清. 揚(yáng)州大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2016(04)
博士論文
[1]Behcet病患者腸道微生物宏基因組學(xué)的研究[D]. 張旎.重慶醫(yī)科大學(xué) 2018
[2]鵝肥肝形成過(guò)程中差異表達(dá)miRNA篩選及miRNA-33的表達(dá)調(diào)控研究[D]. 鄭云.揚(yáng)州大學(xué) 2017
[3]兩核苷酸實(shí)時(shí)合成測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用研究[D]. 浦丹.東南大學(xué) 2015
[4]青藏高原傳統(tǒng)發(fā)酵牦牛奶中乳酸菌多樣性及其益生功能研究[D]. 丁武蓉.蘭州大學(xué) 2014
[5]應(yīng)用焦磷酸測(cè)序技術(shù)對(duì)不同人群腸道微生物群落結(jié)構(gòu)的研究[D]. 郭壯.江南大學(xué) 2013
[6]高通量基因組數(shù)據(jù)的處理、分析與建模[D]. 王叢茂.上海交通大學(xué) 2012
[7]四倍體鯽鯉BAC文庫(kù)構(gòu)建及其演化分析[D]. 陳禹保.湖南師范大學(xué) 2011
碩士論文
[1]奶牛腸道微生物群落結(jié)構(gòu)與多樣性研究[D]. 高鳳.河北工程大學(xué) 2017
[2]脂聯(lián)素受體對(duì)鵝肥肝的保護(hù)作用及其表達(dá)調(diào)控研究[D]. 楊彪.揚(yáng)州大學(xué) 2016
本文編號(hào):3500250
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