小反芻獸疫病毒（peste des petits ruminants virus,PPRV）是引起家畜的致命性傳染病——小反芻獸疫（peste des petits ruminants,PPR）的病原體。PPRV感染能夠?qū)е滦》雌c動(dòng)物患肺炎、糜爛致死性口炎及腸炎（腹瀉）等疾病,是國(guó)家法定的Ⅰ類動(dòng)物疫病,對(duì)其預(yù)防與控制方法的研究屬于動(dòng)物傳染病預(yù)防中的研究熱點(diǎn)。目前有關(guān)PPRV在遺傳進(jìn)化及對(duì)宿主天然免疫應(yīng)答的適應(yīng)機(jī)制研究較少,本實(shí)驗(yàn)研究了PPRV基因的核苷酸、二核苷酸、同義密碼子及氨基酸的使用模式在遺傳進(jìn)化中與宿主的適應(yīng)性以及PPRV在侵染293T細(xì)胞后,激活的干擾素（interferon,IFN）信號(hào)通路,為深入了解PPRV與宿主在遺傳進(jìn)化及天然免疫系統(tǒng)中的相互關(guān)系奠定了基礎(chǔ),為PPR的防控提供了新的思路。本實(shí)驗(yàn)研究結(jié)果如下:（1）以PPRV及其同科病毒牛瘟病毒（rinderpest virus,RPV）基因?yàn)檠芯繉?duì)象,采用同義密碼子相對(duì)使用度（relative synonymous codon usage,RSCU）法、相對(duì)二核苷酸豐度測(cè)定法以及“有效密碼子數(shù)（effective nu... 

【文章來源】：西北民族大學(xué)甘肅省

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

IFN和細(xì)胞因子介導(dǎo)的JAK-STAT通路Figure1.1JAK-STATpathwaymediatedbyIFNandcytokines干擾素在人類臨床醫(yī)學(xué)中被廣泛應(yīng)用，Ⅰ型干擾素IFN-α-2a和IFN-α-2b已作

第 2 章 小反芻獸疫病毒的遺傳進(jìn)化分析不同密碼子位置的 G%使用頻率也存在顯著差異（如圖 2.1E）；在兩種病毒的 P基因中，除了 U3%，其他所有的核苷酸使用頻率均存在顯著差異（如圖 2.1F）。值得注意的是，基于兩種病毒的 6 種病毒基因在不同密碼子位置上核苷酸含量的波動(dòng)、總核苷酸含量不影響不同密碼子位置上核苷酸的使用趨勢(shì)，說明總核苷酸含量只是在密碼子位置上綜合反映出來的。不同密碼子位置的核苷酸受各種進(jìn)化力的影響。

西北民族大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院 2019 屆碩士研究生學(xué)位論文（r=0.538，p＜0.001；GC%VSGC3%）（如圖 2.2D），由于 GC%和 GC12%的相關(guān)性很高，所以 GC12%使用頻率在很大程度上影響病毒蛋白氨基酸的組成；PPRV 與 RPV 的 GC12%和 GC3%之間存在顯著正相關(guān)（PPRV：r=0.389，p＜0.01；RPV：r=0.340，p＜0.05），但是相關(guān)度遠(yuǎn)低于 GC%和 GC12%（GC%和 GC3%）之間的相關(guān)度（如圖 2.2E 和 2.2F），進(jìn)一步表明，在 PPRV 和 RPV 基因組中，GC12%和 GC3%的使用頻率受不同進(jìn)化力的影響。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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