DNA分子多態(tài)性為鑒定物種的遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)提供了重要信息。在研究各種家養(yǎng)動(dòng)物的群體內(nèi)遺傳多樣性和群體間遺傳關(guān)系和結(jié)構(gòu)中，微衛(wèi)星DNA標(biāo)記（SSR）是應(yīng)用最為廣泛的遺傳標(biāo)記之一。迄今為止，有許多研究應(yīng)用這些中性基因座對(duì)來(lái)自全世界各大洲和不同生產(chǎn)、管理及歷史背景的家雞群體遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了評(píng)估和分析，發(fā)現(xiàn)群體遺傳結(jié)構(gòu)與它們的地理分布基本一致，而遺傳多樣性水平則與其管理背景相關(guān)。雞主要組織相容性復(fù)合物（MHC）位于雞16號(hào)染色體上，是基因組中最高變異區(qū)域。MHC區(qū)域編碼的基因在免疫系統(tǒng)內(nèi)起到主要作用，許多MHC基因編碼的蛋白參與抗原與T細(xì)胞呈遞過(guò)程。所以研究MHC區(qū)域的多樣性有助于理解病原與宿主間的相互作用。目前，盡管MHC區(qū)域的受選擇的性質(zhì)還不清楚，但已有三種假設(shè)，如雜合優(yōu)勢(shì)、稀有等位基因優(yōu)勢(shì)和波動(dòng)選擇，用于解釋MHC的高度遺傳多樣性。本研究旨在比較MHC區(qū)域多態(tài)性和常染色體微衛(wèi)星體系所代表的基因組水平遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)的異同，探索MHC的進(jìn)化機(jī)制，評(píng)價(jià)MHC區(qū)域的遺傳多樣性是否適用于研究群體的遺傳關(guān)系。本研究通過(guò)對(duì)來(lái)自不同大洲、不同背景及培育歷史的25個(gè)家雞和野生原雞... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】：151 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
附件
摘要
Abstract
第一章 引言
    1.1 雞的起源
        1.1.1 單起源學(xué)說(shuō)
        1.1.2 多起源學(xué)說(shuō)
    1.2 家雞的遺傳多樣性的研究進(jìn)展
        1.2.1 線(xiàn)粒體 DNA 遺傳多樣性
        1.2.2 微衛(wèi)星 DNA 遺傳多樣性水平
        1.2.3 SNP 多樣性分析
    1.3 微衛(wèi)星標(biāo)記及其應(yīng)用
        1.3.1 微衛(wèi)星分子技術(shù)簡(jiǎn)介
        1.3.2 SSR DNA 結(jié)構(gòu)概述
        1.3.3 微衛(wèi)星的形成
        1.3.4 SSR DNA 在基因組中的功能
        1.3.5 SSR DNA 位點(diǎn)信息獲取
        1.3.6 SSR DNA 的應(yīng)用
    1.4 MHC 研究進(jìn)展
        1.4.1 MHC 基因結(jié)構(gòu)
        1.4.2 MHC 基因功能
        1.4.3 MHC 的遺傳特性
        1.4.4 MHC 基因在動(dòng)物遺傳學(xué)基礎(chǔ)研究上的意義
        1.4.5 MHC 與進(jìn)化相關(guān)
        1.4.6 雞 MHC 研究進(jìn)展
    1.5 研究目的和意義
第二章 SSR 和 MHC 比較分析世界范圍內(nèi)雞種群體遺傳結(jié)構(gòu)
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
        2.1.1 樣品的采集
        2.1.2 主要儀器和設(shè)備
        2.1.3 主要藥品
        2.1.4 試劑配置
        2.1.5 遺傳標(biāo)記信息及 PCR 反應(yīng)體系
        2.1.6 數(shù)據(jù)分析
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 MHC 位點(diǎn)基因型判定及多樣性分析
        2.2.2 群體多樣性分析
        2.2.3 群體間差異結(jié)果
        2.2.4 MHC 與 SSR 間群體差異程度相關(guān)分析結(jié)果
        2.2.5 STRUCTURE 群體結(jié)構(gòu)分析結(jié)果
第三章 遠(yuǎn)距離大樣本群體 MHC 遺傳結(jié)構(gòu)差異分析
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
        3.1.1 樣品的采集
        3.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器
        3.1.3 主要試劑
        3.1.4 主要試劑配制
        3.1.5 遺傳標(biāo)記信息及反應(yīng)體系
        3.1.6 等位基因片段長(zhǎng)度分析
        3.1.7 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 基因組 DNA 的檢測(cè)
        3.2.2 微衛(wèi)星多態(tài)性的檢測(cè)
        3.2.3 群體內(nèi) MHC 遺傳多樣性評(píng)估
        3.2.4 MHC 群體遺傳結(jié)構(gòu)差異
第四章 討論
第五章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)歷


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]南陽(yáng)牛BoLA-DRA基因克隆、序列分析及表達(dá)[D]. 楚秋霞.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010
[2]兩種果蝠微衛(wèi)星位點(diǎn)篩選及通用性研究[D]. 邵偉偉.廣西師范大學(xué) 2008



本文編號(hào)：3496982