發(fā)情周期不同階段山羊卵巢IncRNA和mRNA的分析
發(fā)布時間:2021-11-15 07:44
山羊是一種重要的多用途家畜,是一種重要的經(jīng)濟動物,其繁殖力是山羊養(yǎng)殖業(yè)的重要環(huán)節(jié)之一,而繁殖主要受生殖激素調(diào)控,卵巢是主要繁殖器官并直接介導(dǎo)排卵及分泌性激素,對山羊的繁殖性能起著關(guān)鍵性作用。近幾年,研究者們發(fā)現(xiàn)越來越多的lncRNA調(diào)控哺乳動物的繁育。作為一種具有編碼蛋白質(zhì)能力的RNA,mRNA在哺乳動物卵巢功能中發(fā)揮的作用也越來越受到研究者們的重視。然而很少有人研究山羊卵巢中l(wèi)ncRNA和mRNA對山羊繁育的影響。在本研究中,我們共采集10個山羊卵巢(黃體期卵巢和卵泡期卵巢各5個),主要采用RNA-seq技術(shù),對黃體期以及卵泡期山羊卵巢進行全集基因組分析,通過共定位和共表達的分析方法,預(yù)測lncRNA的靶基因,對其靶基因以及mRNA基因進行GO和KEGG等功能分析,篩選與山羊繁育能力相關(guān)的長非編碼RNA和mRNA,并研究不同繁殖周期山羊卵巢的轉(zhuǎn)錄差異,可以為研究山羊繁育提供理論基礎(chǔ)。(1)對采集到的安徽白山羊黃體期和卵泡期卵巢進行RNA-seq。在本次測序中,我們共建立10個文庫,黃體期卵巢(LO)和卵泡期卵巢(FO)的文庫分別得到106510454、108716574、977751...
【文章來源】:阜陽師范大學(xué)安徽省
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
LncRNA篩選流程圖
其中l(wèi)ncRNA 包括 3753 個 novel lncRNA(lincRNA 占 74.0%,antisense-lncRNA 占 26.0%(圖3.1c))和 1173 個 Annotated lncRNA(圖 3.1b)。研究結(jié)果表明,卵泡期和黃體期卵巢表達水平幾乎一致,lncRNA 和 TUCP 的表達水平比 mRNA 低(圖 3.1d/e)。
圖 3.2 黃體期和卵泡期山羊卵巢中 lncRNA、TUCP、mRNA 的比較Figure 3.2 Comparison of lncRNA, TUCP, and mRNA in the goat ovary of the luteal and follicular phase3.2 不同發(fā)情時期山羊卵巢中轉(zhuǎn)錄本的總體差異表達情況在本研究中,從山羊卵巢中一共鑒定出 4926 個 lncRNA、1454 個 TUCP、43766
【參考文獻】:
期刊論文
[1]長鏈非編碼RNA與缺氧缺血腦損傷[J]. 趙鳳艷,屈藝. 中國當(dāng)代兒科雜志. 2016(11)
[2]應(yīng)用Solexa測序技術(shù)挖掘山羊卵巢組織microRNA[J]. 張曉東,凌英會,張運海,李運生,劉亞,曹鴻國,張子軍,殷宗俊,丁建平,章孝榮. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(01)
本文編號:3496345
【文章來源】:阜陽師范大學(xué)安徽省
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
LncRNA篩選流程圖
其中l(wèi)ncRNA 包括 3753 個 novel lncRNA(lincRNA 占 74.0%,antisense-lncRNA 占 26.0%(圖3.1c))和 1173 個 Annotated lncRNA(圖 3.1b)。研究結(jié)果表明,卵泡期和黃體期卵巢表達水平幾乎一致,lncRNA 和 TUCP 的表達水平比 mRNA 低(圖 3.1d/e)。
圖 3.2 黃體期和卵泡期山羊卵巢中 lncRNA、TUCP、mRNA 的比較Figure 3.2 Comparison of lncRNA, TUCP, and mRNA in the goat ovary of the luteal and follicular phase3.2 不同發(fā)情時期山羊卵巢中轉(zhuǎn)錄本的總體差異表達情況在本研究中,從山羊卵巢中一共鑒定出 4926 個 lncRNA、1454 個 TUCP、43766
【參考文獻】:
期刊論文
[1]長鏈非編碼RNA與缺氧缺血腦損傷[J]. 趙鳳艷,屈藝. 中國當(dāng)代兒科雜志. 2016(11)
[2]應(yīng)用Solexa測序技術(shù)挖掘山羊卵巢組織microRNA[J]. 張曉東,凌英會,張運海,李運生,劉亞,曹鴻國,張子軍,殷宗俊,丁建平,章孝榮. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(01)
本文編號:3496345
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3496345.html
最近更新
教材專著